Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A399HVN6

Protein Details
Accession A0A399HVN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-51KENASRTRRARRHLTTSSRRPEQSHydrophilic
345-368YVQHQLQEEKRRNPPPHRPSPLEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-38RTRRAR
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 4, cyto 3, extr 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024461  CCDC90-like  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005739  C:mitochondrion  
Pfam View protein in Pfam  
PF07798  CCDC90-like  
Amino Acid Sequences MATPRLPFLWPMLFQPAKSPRVRASIAKENASRTRRARRHLTTSSRRPEQSIPQRYGKAYEHTAPALEQEPPKEPQQKDPATAEKSPQDPVHEQEEVEEDAPTATTSPSTPSQTSATEEIEPPKTPAPDPPKTGDPKPLDSVLHIPTAAEEESHKAPHLKTPPYVHHFDTYGLVRKLSQSSYTPEQSITIMKAVRQTLLDNMALAREGLVSKSNVENDTYLFRAACSELKTEIGNARKGEMERMRTERGQLQHEVDILGQRLGQETGGLRDELKGLFDDRKMAVRQEQRHMETKIQELNYKITVALNSDARSEVEGLRWVLTRRAAITVGVSAFMLFVALRYTSYVQHQLQEEKRRNPPPHRPSPLEDLADHTSTASRPVVDIASPTQQDALGGELLATEGVSLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.41
3 0.44
4 0.45
5 0.47
6 0.49
7 0.45
8 0.51
9 0.54
10 0.52
11 0.52
12 0.55
13 0.58
14 0.6
15 0.57
16 0.57
17 0.62
18 0.59
19 0.59
20 0.56
21 0.62
22 0.63
23 0.68
24 0.72
25 0.71
26 0.77
27 0.79
28 0.82
29 0.82
30 0.85
31 0.86
32 0.83
33 0.76
34 0.71
35 0.67
36 0.67
37 0.67
38 0.66
39 0.63
40 0.62
41 0.64
42 0.61
43 0.61
44 0.54
45 0.48
46 0.44
47 0.42
48 0.38
49 0.35
50 0.35
51 0.29
52 0.28
53 0.24
54 0.22
55 0.2
56 0.2
57 0.23
58 0.25
59 0.32
60 0.38
61 0.38
62 0.43
63 0.51
64 0.52
65 0.53
66 0.56
67 0.57
68 0.53
69 0.54
70 0.49
71 0.43
72 0.41
73 0.41
74 0.37
75 0.34
76 0.32
77 0.33
78 0.34
79 0.3
80 0.28
81 0.25
82 0.27
83 0.22
84 0.2
85 0.17
86 0.11
87 0.1
88 0.1
89 0.09
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.1
95 0.13
96 0.17
97 0.17
98 0.19
99 0.21
100 0.22
101 0.25
102 0.24
103 0.23
104 0.2
105 0.22
106 0.23
107 0.23
108 0.22
109 0.21
110 0.22
111 0.21
112 0.2
113 0.27
114 0.32
115 0.35
116 0.38
117 0.4
118 0.44
119 0.47
120 0.49
121 0.5
122 0.45
123 0.44
124 0.43
125 0.41
126 0.34
127 0.31
128 0.33
129 0.26
130 0.23
131 0.18
132 0.15
133 0.13
134 0.14
135 0.12
136 0.09
137 0.07
138 0.1
139 0.11
140 0.12
141 0.13
142 0.13
143 0.14
144 0.2
145 0.26
146 0.26
147 0.29
148 0.33
149 0.4
150 0.43
151 0.46
152 0.41
153 0.36
154 0.34
155 0.3
156 0.28
157 0.23
158 0.24
159 0.21
160 0.2
161 0.18
162 0.19
163 0.2
164 0.18
165 0.18
166 0.14
167 0.18
168 0.23
169 0.24
170 0.23
171 0.21
172 0.21
173 0.19
174 0.18
175 0.14
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.14
180 0.14
181 0.14
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.15
186 0.14
187 0.1
188 0.1
189 0.09
190 0.08
191 0.07
192 0.06
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.12
207 0.11
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.17
220 0.18
221 0.2
222 0.19
223 0.19
224 0.21
225 0.21
226 0.26
227 0.26
228 0.27
229 0.28
230 0.33
231 0.35
232 0.33
233 0.36
234 0.34
235 0.33
236 0.33
237 0.31
238 0.29
239 0.26
240 0.26
241 0.24
242 0.19
243 0.17
244 0.14
245 0.11
246 0.09
247 0.08
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.1
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.1
263 0.12
264 0.13
265 0.15
266 0.15
267 0.2
268 0.2
269 0.21
270 0.27
271 0.33
272 0.38
273 0.43
274 0.49
275 0.49
276 0.54
277 0.54
278 0.51
279 0.46
280 0.45
281 0.43
282 0.38
283 0.37
284 0.32
285 0.33
286 0.29
287 0.26
288 0.22
289 0.17
290 0.16
291 0.15
292 0.16
293 0.16
294 0.15
295 0.16
296 0.16
297 0.15
298 0.16
299 0.15
300 0.13
301 0.12
302 0.15
303 0.15
304 0.16
305 0.18
306 0.18
307 0.19
308 0.2
309 0.2
310 0.19
311 0.2
312 0.19
313 0.17
314 0.17
315 0.17
316 0.15
317 0.13
318 0.12
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.07
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.08
329 0.1
330 0.12
331 0.16
332 0.24
333 0.24
334 0.28
335 0.32
336 0.38
337 0.45
338 0.53
339 0.58
340 0.58
341 0.66
342 0.72
343 0.77
344 0.78
345 0.82
346 0.81
347 0.84
348 0.85
349 0.81
350 0.77
351 0.77
352 0.74
353 0.66
354 0.56
355 0.51
356 0.47
357 0.42
358 0.36
359 0.28
360 0.22
361 0.19
362 0.22
363 0.18
364 0.14
365 0.13
366 0.16
367 0.17
368 0.15
369 0.18
370 0.18
371 0.23
372 0.23
373 0.23
374 0.22
375 0.21
376 0.2
377 0.18
378 0.17
379 0.1
380 0.1
381 0.09
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.07