Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A399HU45

Protein Details
Accession A0A399HU45    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-65EGSDFEDKKKRAKKQTKTAHSKEGVTTTKKTPKAARVPKKAPPKDVHydrophilic
88-109MTTSTAPKPKRQKKDPTTLAAEHydrophilic
253-286EPAKTEKPKKEDKPAKTKKQEKEKTPKQKWTAYVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-69KKKRAKKQTKTAHSKEGVTTTKKTPKAARVPKKAPPKDVTKKR
96-101PKRQKK
113-123KKAKADKAAHK
256-279KTEKPKKEDKPAKTKKQEKEKTPK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR022656  XPA_C  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
CDD cd21075  DBD_XPA-like  
Amino Acid Sequences MSTRRSGRATKEVKYTSASEGSDFEDKKKRAKKQTKTAHSKEGVTTTKKTPKAARVPKKAPPKDVTKKRAAESDNENDDAIANQNDAMTTSTAPKPKRQKKDPTTLAAEAQEKKAKADKAAHKKAWQDWLSSHDNEGEMLEEEPDKHESITQTDALKKYGVKKDELNSLLRFEKKNPLYPGMMKLFLEEDVRELAFRKIGVLEGAQGDDEEIVEKGKQLWTEEHKDDVDVEEEKSVRTETKDKDTARDENADEPAKTEKPKKEDKPAKTKKQEKEKTPKQKWTAYVSENSIDEDERLPKEPFDLINQTDCKNRYNLTPRDLACLPYFPKKNPAYGNTMKIFKESVVKSLAYRKTAVLAGLEDDGKDDEGLLEKGQKLFEEQSDPDKDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.51
3 0.46
4 0.45
5 0.4
6 0.31
7 0.29
8 0.31
9 0.34
10 0.32
11 0.32
12 0.37
13 0.38
14 0.46
15 0.54
16 0.6
17 0.64
18 0.74
19 0.79
20 0.8
21 0.89
22 0.91
23 0.93
24 0.89
25 0.88
26 0.82
27 0.75
28 0.67
29 0.64
30 0.6
31 0.54
32 0.52
33 0.5
34 0.55
35 0.55
36 0.57
37 0.56
38 0.59
39 0.66
40 0.72
41 0.74
42 0.76
43 0.8
44 0.82
45 0.86
46 0.82
47 0.8
48 0.75
49 0.75
50 0.75
51 0.79
52 0.79
53 0.77
54 0.76
55 0.71
56 0.72
57 0.64
58 0.59
59 0.56
60 0.57
61 0.52
62 0.47
63 0.44
64 0.36
65 0.34
66 0.28
67 0.22
68 0.13
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.1
75 0.08
76 0.09
77 0.13
78 0.17
79 0.23
80 0.25
81 0.33
82 0.43
83 0.52
84 0.62
85 0.67
86 0.74
87 0.77
88 0.87
89 0.86
90 0.82
91 0.78
92 0.69
93 0.62
94 0.54
95 0.5
96 0.41
97 0.38
98 0.35
99 0.28
100 0.29
101 0.32
102 0.3
103 0.3
104 0.37
105 0.43
106 0.5
107 0.59
108 0.61
109 0.6
110 0.63
111 0.63
112 0.63
113 0.54
114 0.45
115 0.37
116 0.4
117 0.4
118 0.36
119 0.32
120 0.23
121 0.22
122 0.19
123 0.18
124 0.13
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.11
135 0.11
136 0.13
137 0.15
138 0.16
139 0.17
140 0.2
141 0.21
142 0.2
143 0.2
144 0.2
145 0.26
146 0.29
147 0.29
148 0.28
149 0.31
150 0.33
151 0.39
152 0.4
153 0.36
154 0.3
155 0.31
156 0.32
157 0.31
158 0.29
159 0.24
160 0.31
161 0.3
162 0.36
163 0.36
164 0.36
165 0.35
166 0.36
167 0.38
168 0.31
169 0.3
170 0.23
171 0.2
172 0.18
173 0.16
174 0.15
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.07
190 0.06
191 0.07
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.09
206 0.14
207 0.19
208 0.25
209 0.26
210 0.28
211 0.26
212 0.26
213 0.25
214 0.21
215 0.17
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.11
222 0.11
223 0.1
224 0.12
225 0.18
226 0.2
227 0.28
228 0.35
229 0.35
230 0.39
231 0.43
232 0.44
233 0.4
234 0.41
235 0.34
236 0.3
237 0.33
238 0.3
239 0.25
240 0.23
241 0.24
242 0.22
243 0.25
244 0.3
245 0.31
246 0.36
247 0.46
248 0.51
249 0.59
250 0.66
251 0.71
252 0.75
253 0.8
254 0.84
255 0.85
256 0.88
257 0.86
258 0.87
259 0.87
260 0.86
261 0.86
262 0.86
263 0.87
264 0.87
265 0.88
266 0.83
267 0.81
268 0.76
269 0.72
270 0.68
271 0.61
272 0.56
273 0.49
274 0.45
275 0.38
276 0.34
277 0.27
278 0.21
279 0.18
280 0.16
281 0.17
282 0.16
283 0.2
284 0.19
285 0.18
286 0.2
287 0.22
288 0.21
289 0.22
290 0.26
291 0.24
292 0.3
293 0.32
294 0.32
295 0.36
296 0.36
297 0.33
298 0.31
299 0.3
300 0.33
301 0.4
302 0.45
303 0.44
304 0.5
305 0.48
306 0.51
307 0.5
308 0.44
309 0.36
310 0.35
311 0.34
312 0.35
313 0.38
314 0.34
315 0.43
316 0.43
317 0.48
318 0.5
319 0.51
320 0.51
321 0.53
322 0.59
323 0.54
324 0.56
325 0.49
326 0.44
327 0.41
328 0.33
329 0.35
330 0.29
331 0.28
332 0.27
333 0.27
334 0.28
335 0.37
336 0.41
337 0.35
338 0.35
339 0.32
340 0.32
341 0.32
342 0.31
343 0.23
344 0.19
345 0.18
346 0.18
347 0.18
348 0.14
349 0.14
350 0.14
351 0.13
352 0.12
353 0.1
354 0.08
355 0.11
356 0.12
357 0.13
358 0.16
359 0.18
360 0.2
361 0.21
362 0.21
363 0.22
364 0.25
365 0.28
366 0.29
367 0.29
368 0.36