FuNGI

A0A399GCW5

Protein Details

Accession

A0A399GCW5

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-129	GVAPRAKMNQQRSRRFRAAKEAKEKD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
868-882	RGGFRGGRGGGRGGG
1063-1072	RGGGRGGRGG

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 9, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPAMFRWLSQKYPKIVSTVQEELPKKVGDHVIPVDRTGPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDKPAPKTEADMMMAIFEYTDRCVGMVRPRKLLYMAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAKEAKEKDDERAEFQKMLNSQKASRGEDISSLEEVIEKTWDSNAITPGTPFMHLLAESLQYWCAYKFTTDPSWKDMKVIISDASVPGEGEHKIMNFIRSQRSMPTHDPNTSHVIYGLDADLIMLSLATHEPYFRVLREDVFYDSGKDKVCTRCGRKGHIRNNCEFPDDGKKLTEEEAAEEWSNSEHQLKPFIWLHTNILREYLAVEMDTPKRKFKYDLERSLDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIRDQGIDLLISIWRDLAADMDDYVTKDGFPDMRRVQQIMSALASREAGIFKKRKEVSDRQAANRARREAQNNNNKRQRTEASGPPGFKRAKESTDTYTSAGIVFFDPKDAQSKEVRDVHKDIMHTRDAQSNKSAAARLKELMKAKADGTAAPEPTPAEPAPEGETAVLGKRKADEAEDADNGTPGRNTPVIPESPAQAVETPKKEDGPQEDTIMLWEDGYEERYYEQKFGVDPNDIAFRNKVARQYAEGLCWVLAYYMQGCPSWTWYFPHHYAPFAADFVGLEDMDPRKLFEKGTPFHPYEQLMGVLPAASNHAIPEPFRILMEDPDSSIVDFYPQDFPIDLNGKKFAWQGVAILPFIDSKRLLDAMATKYPELSDDERKRNEFGKETLIFSQESGLFDDVEKALYRKGQQKHKIDPTKSRALHGDIEPHDLFVMDSQLVPPFDAQGITEFEVTQDRSMRVYYEMPSLSSARAHQSALLPGVKLPKPALSPGEAESVRRSNERGGFRGGRGGGRGGGGWRGGGGGNNNNYNNDRRGNDNYHNGGGRGGGGGGYQNGRGGGGNYGGNQGGYGGNQGGYGGPPPPFPGPGGNFAPPPPFAAGNFPPPPPGWVPPPGFAPPPGFAPPPSGYGAPPPPITQQRPAWMNGGGSAGNQPPPQQAPGGSSLRDERFYRPADEILGRSSNNGGGGGYQGHNDRGGRGGGRGGRGGRGGNGGGYQGNRQNYNSNDYR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.52
3	0.53
4	0.53
5	0.5
6	0.48
7	0.45
8	0.44
9	0.46
10	0.46
11	0.43
12	0.44
13	0.41
14	0.34
15	0.35
16	0.37
17	0.3
18	0.35
19	0.38
20	0.41
21	0.41
22	0.41
23	0.4
24	0.35
25	0.36
26	0.36
27	0.33
28	0.29
29	0.31
30	0.32
31	0.3
32	0.3
33	0.32
34	0.28
35	0.27
36	0.24
37	0.21
38	0.21
39	0.18
40	0.16
41	0.13
42	0.1
43	0.08
44	0.09
45	0.09
46	0.09
47	0.1
48	0.13
49	0.18
50	0.22
51	0.22
52	0.29
53	0.38
54	0.46
55	0.53
56	0.56
57	0.54
58	0.51
59	0.53
60	0.5
61	0.45
62	0.38
63	0.31
64	0.25
65	0.22
66	0.21
67	0.17
68	0.12
69	0.08
70	0.07
71	0.08
72	0.09
73	0.08
74	0.08
75	0.09
76	0.13
77	0.23
78	0.32
79	0.35
80	0.42
81	0.43
82	0.45
83	0.45
84	0.46
85	0.4
86	0.37
87	0.34
88	0.27
89	0.27
90	0.25
91	0.25
92	0.23
93	0.19
94	0.12
95	0.15
96	0.21
97	0.29
98	0.39
99	0.47
100	0.55
101	0.66
102	0.74
103	0.8
104	0.83
105	0.82
106	0.77
107	0.79
108	0.79
109	0.78
110	0.81
111	0.79
112	0.74
113	0.75
114	0.71
115	0.66
116	0.65
117	0.57
118	0.52
119	0.51
120	0.49
121	0.43
122	0.42
123	0.41
124	0.36
125	0.41
126	0.41
127	0.38
128	0.37
129	0.43
130	0.48
131	0.47
132	0.46
133	0.42
134	0.36
135	0.36
136	0.37
137	0.32
138	0.26
139	0.22
140	0.18
141	0.17
142	0.16
143	0.13
144	0.12
145	0.09
146	0.09
147	0.1
148	0.12
149	0.12
150	0.15
151	0.18
152	0.18
153	0.19
154	0.18
155	0.2
156	0.19
157	0.18
158	0.15
159	0.13
160	0.12
161	0.12
162	0.13
163	0.12
164	0.12
165	0.12
166	0.13
167	0.12
168	0.11
169	0.12
170	0.11
171	0.11
172	0.1
173	0.11
174	0.12
175	0.18
176	0.26
177	0.32
178	0.34
179	0.39
180	0.45
181	0.43
182	0.43
183	0.4
184	0.34
185	0.3
186	0.3
187	0.24
188	0.19
189	0.2
190	0.19
191	0.17
192	0.13
193	0.11
194	0.09
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.09
200	0.13
201	0.15
202	0.16
203	0.18
204	0.23
205	0.28
206	0.3
207	0.31
208	0.34
209	0.37
210	0.42
211	0.44
212	0.49
213	0.47
214	0.48
215	0.49
216	0.46
217	0.48
218	0.42
219	0.36
220	0.27
221	0.23
222	0.19
223	0.18
224	0.15
225	0.08
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.05
230	0.04
231	0.03
232	0.02
233	0.03
234	0.04
235	0.05
236	0.05
237	0.06
238	0.06
239	0.1
240	0.12
241	0.12
242	0.16
243	0.16
244	0.18
245	0.2
246	0.21
247	0.2
248	0.22
249	0.21
250	0.2
251	0.2
252	0.21
253	0.2
254	0.2
255	0.22
256	0.25
257	0.33
258	0.4
259	0.45
260	0.51
261	0.55
262	0.63
263	0.68
264	0.73
265	0.75
266	0.76
267	0.76
268	0.72
269	0.75
270	0.67
271	0.59
272	0.49
273	0.43
274	0.42
275	0.38
276	0.34
277	0.28
278	0.27
279	0.25
280	0.26
281	0.25
282	0.16
283	0.16
284	0.16
285	0.18
286	0.17
287	0.16
288	0.15
289	0.12
290	0.13
291	0.11
292	0.13
293	0.13
294	0.14
295	0.19
296	0.19
297	0.24
298	0.27
299	0.29
300	0.29
301	0.27
302	0.31
303	0.31
304	0.33
305	0.27
306	0.25
307	0.22
308	0.19
309	0.18
310	0.14
311	0.09
312	0.07
313	0.08
314	0.1
315	0.15
316	0.23
317	0.24
318	0.29
319	0.3
320	0.33
321	0.36
322	0.41
323	0.47
324	0.5
325	0.58
326	0.6
327	0.6
328	0.6
329	0.61
330	0.52
331	0.41
332	0.31
333	0.22
334	0.16
335	0.13
336	0.12
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.08
344	0.07
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.07
349	0.08
350	0.12
351	0.14
352	0.15
353	0.14
354	0.15
355	0.14
356	0.14
357	0.13
358	0.08
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.07
374	0.07
375	0.08
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.1
381	0.11
382	0.18
383	0.19
384	0.25
385	0.26
386	0.27
387	0.26
388	0.25
389	0.26
390	0.2
391	0.18
392	0.14
393	0.13
394	0.12
395	0.12
396	0.09
397	0.09
398	0.09
399	0.09
400	0.15
401	0.2
402	0.2
403	0.29
404	0.31
405	0.35
406	0.42
407	0.5
408	0.51
409	0.57
410	0.61
411	0.55
412	0.62
413	0.62
414	0.61
415	0.57
416	0.53
417	0.46
418	0.46
419	0.49
420	0.49
421	0.54
422	0.58
423	0.6
424	0.66
425	0.69
426	0.66
427	0.61
428	0.57
429	0.5
430	0.47
431	0.45
432	0.42
433	0.43
434	0.46
435	0.46
436	0.42
437	0.45
438	0.38
439	0.33
440	0.34
441	0.29
442	0.28
443	0.31
444	0.33
445	0.31
446	0.36
447	0.36
448	0.3
449	0.27
450	0.24
451	0.2
452	0.17
453	0.12
454	0.08
455	0.08
456	0.07
457	0.07
458	0.08
459	0.08
460	0.13
461	0.13
462	0.15
463	0.18
464	0.21
465	0.25
466	0.32
467	0.33
468	0.31
469	0.34
470	0.34
471	0.32
472	0.32
473	0.28
474	0.25
475	0.25
476	0.23
477	0.22
478	0.24
479	0.23
480	0.23
481	0.23
482	0.2
483	0.19
484	0.19
485	0.2
486	0.16
487	0.17
488	0.17
489	0.17
490	0.18
491	0.21
492	0.23
493	0.23
494	0.22
495	0.22
496	0.2
497	0.22
498	0.2
499	0.16
500	0.18
501	0.19
502	0.18
503	0.16
504	0.17
505	0.14
506	0.13
507	0.16
508	0.11
509	0.09
510	0.09
511	0.1
512	0.12
513	0.12
514	0.12
515	0.09
516	0.09
517	0.08
518	0.1
519	0.11
520	0.08
521	0.08
522	0.08
523	0.1
524	0.1
525	0.11
526	0.11
527	0.12
528	0.15
529	0.16
530	0.16
531	0.14
532	0.15
533	0.14
534	0.11
535	0.08
536	0.05
537	0.07
538	0.07
539	0.08
540	0.09
541	0.12
542	0.12
543	0.14
544	0.14
545	0.14
546	0.13
547	0.14
548	0.12
549	0.11
550	0.13
551	0.15
552	0.17
553	0.18
554	0.18
555	0.18
556	0.19
557	0.21
558	0.23
559	0.25
560	0.24
561	0.23
562	0.22
563	0.21
564	0.21
565	0.19
566	0.14
567	0.08
568	0.06
569	0.06
570	0.06
571	0.08
572	0.08
573	0.06
574	0.07
575	0.1
576	0.11
577	0.11
578	0.11
579	0.1
580	0.11
581	0.13
582	0.14
583	0.12
584	0.12
585	0.12
586	0.16
587	0.15
588	0.16
589	0.14
590	0.14
591	0.16
592	0.18
593	0.2
594	0.18
595	0.19
596	0.2
597	0.26
598	0.25
599	0.23
600	0.21
601	0.18
602	0.16
603	0.14
604	0.12
605	0.06
606	0.05
607	0.05
608	0.05
609	0.06
610	0.07
611	0.07
612	0.07
613	0.08
614	0.12
615	0.13
616	0.13
617	0.14
618	0.16
619	0.22
620	0.23
621	0.31
622	0.27
623	0.26
624	0.26
625	0.25
626	0.24
627	0.18
628	0.16
629	0.09
630	0.08
631	0.08
632	0.08
633	0.06
634	0.05
635	0.07
636	0.07
637	0.09
638	0.09
639	0.09
640	0.09
641	0.11
642	0.11
643	0.13
644	0.21
645	0.22
646	0.28
647	0.32
648	0.32
649	0.33
650	0.35
651	0.32
652	0.25
653	0.24
654	0.19
655	0.14
656	0.12
657	0.1
658	0.08
659	0.07
660	0.05
661	0.06
662	0.05
663	0.05
664	0.06
665	0.07
666	0.07
667	0.08
668	0.11
669	0.11
670	0.11
671	0.11
672	0.12
673	0.12
674	0.13
675	0.15
676	0.13
677	0.11
678	0.12
679	0.12
680	0.11
681	0.1
682	0.08
683	0.07
684	0.07
685	0.09
686	0.1
687	0.1
688	0.11
689	0.11
690	0.11
691	0.15
692	0.2
693	0.19
694	0.18
695	0.2
696	0.19
697	0.21
698	0.21
699	0.18
700	0.14
701	0.14
702	0.13
703	0.15
704	0.16
705	0.14
706	0.13
707	0.13
708	0.12
709	0.12
710	0.13
711	0.09
712	0.08
713	0.1
714	0.11
715	0.1
716	0.1
717	0.14
718	0.17
719	0.21
720	0.21
721	0.19
722	0.19
723	0.19
724	0.19
725	0.19
726	0.18
727	0.25
728	0.32
729	0.39
730	0.43
731	0.45
732	0.46
733	0.47
734	0.47
735	0.4
736	0.35
737	0.36
738	0.33
739	0.34
740	0.33
741	0.31
742	0.27
743	0.22
744	0.23
745	0.16
746	0.15
747	0.15
748	0.13
749	0.12
750	0.12
751	0.14
752	0.11
753	0.11
754	0.1
755	0.09
756	0.1
757	0.13
758	0.17
759	0.24
760	0.31
761	0.41
762	0.49
763	0.57
764	0.65
765	0.73
766	0.78
767	0.76
768	0.78
769	0.75
770	0.76
771	0.69
772	0.62
773	0.54
774	0.48
775	0.47
776	0.39
777	0.4
778	0.31
779	0.36
780	0.33
781	0.3
782	0.26
783	0.21
784	0.2
785	0.12
786	0.13
787	0.06
788	0.06
789	0.07
790	0.1
791	0.1
792	0.1
793	0.1
794	0.09
795	0.09
796	0.09
797	0.09
798	0.09
799	0.11
800	0.12
801	0.12
802	0.11
803	0.11
804	0.14
805	0.15
806	0.14
807	0.15
808	0.14
809	0.15
810	0.16
811	0.16
812	0.16
813	0.18
814	0.18
815	0.2
816	0.2
817	0.19
818	0.21
819	0.21
820	0.19
821	0.18
822	0.18
823	0.17
824	0.18
825	0.18
826	0.17
827	0.18
828	0.2
829	0.22
830	0.22
831	0.18
832	0.18
833	0.25
834	0.24
835	0.23
836	0.22
837	0.22
838	0.23
839	0.26
840	0.27
841	0.22
842	0.23
843	0.23
844	0.29
845	0.26
846	0.25
847	0.27
848	0.27
849	0.27
850	0.27
851	0.26
852	0.26
853	0.33
854	0.37
855	0.35
856	0.39
857	0.4
858	0.39
859	0.44
860	0.39
861	0.33
862	0.29
863	0.28
864	0.21
865	0.18
866	0.18
867	0.13
868	0.14
869	0.12
870	0.11
871	0.09
872	0.09
873	0.09
874	0.1
875	0.12
876	0.16
877	0.2
878	0.25
879	0.26
880	0.28
881	0.31
882	0.33
883	0.34
884	0.33
885	0.31
886	0.31
887	0.38
888	0.43
889	0.46
890	0.51
891	0.5
892	0.49
893	0.49
894	0.43
895	0.36
896	0.29
897	0.23
898	0.15
899	0.11
900	0.07
901	0.06
902	0.07
903	0.08
904	0.09
905	0.09
906	0.09
907	0.09
908	0.09
909	0.1
910	0.1
911	0.1
912	0.11
913	0.12
914	0.12
915	0.14
916	0.13
917	0.13
918	0.11
919	0.11
920	0.09
921	0.08
922	0.09
923	0.08
924	0.08
925	0.08
926	0.08
927	0.07
928	0.08
929	0.09
930	0.1
931	0.1
932	0.1
933	0.13
934	0.15
935	0.16
936	0.16
937	0.22
938	0.23
939	0.28
940	0.32
941	0.31
942	0.31
943	0.31
944	0.33
945	0.26
946	0.26
947	0.22
948	0.19
949	0.18
950	0.24
951	0.25
952	0.31
953	0.34
954	0.31
955	0.32
956	0.31
957	0.35
958	0.31
959	0.32
960	0.28
961	0.33
962	0.36
963	0.36
964	0.4
965	0.38
966	0.37
967	0.35
968	0.34
969	0.27
970	0.28
971	0.3
972	0.27
973	0.24
974	0.29
975	0.28
976	0.27
977	0.29
978	0.25
979	0.22
980	0.28
981	0.32
982	0.3
983	0.3
984	0.28
985	0.33
986	0.41
987	0.45
988	0.45
989	0.46
990	0.5
991	0.52
992	0.52
993	0.48
994	0.41
995	0.37
996	0.31
997	0.28
998	0.2
999	0.17
1000	0.19
1001	0.18
1002	0.2
1003	0.2
1004	0.2
1005	0.23
1006	0.25
1007	0.27
1008	0.25
1009	0.24
1010	0.24
1011	0.3
1012	0.32
1013	0.28
1014	0.28
1015	0.33
1016	0.34
1017	0.37
1018	0.36
1019	0.34
1020	0.38
1021	0.4
1022	0.41
1023	0.37
1024	0.36
1025	0.36
1026	0.38
1027	0.34
1028	0.32
1029	0.33
1030	0.29
1031	0.27
1032	0.27
1033	0.24
1034	0.21
1035	0.19
1036	0.14
1037	0.11
1038	0.13
1039	0.15
1040	0.14
1041	0.15
1042	0.16
1043	0.17
1044	0.2
1045	0.2
1046	0.2
1047	0.2
1048	0.22
1049	0.21
1050	0.2
1051	0.26
1052	0.26
1053	0.29
1054	0.32
1055	0.31
1056	0.3
1057	0.32
1058	0.32
1059	0.27
1060	0.27
1061	0.24
1062	0.21
1063	0.2
1064	0.18
1065	0.19
1066	0.19
1067	0.22
1068	0.24
1069	0.28
1070	0.3
1071	0.32
1072	0.38
1073	0.39

A0A399GCW5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer