Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A399HRX0

Protein Details
Accession A0A399HRX0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
477-511PLPPVEQPKSRKTKKQKAKAKKKAAKERKFETKNLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
484-505PKSRKTKKQKAKAKKKAAKERK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, nucl 10.5, cyto 10.5, cysk 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006941  RNase_CAF1  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04857  CAF1  
Amino Acid Sequences MEVDAETFPYHLLGMFIHISEADFVSFDLELSGIPSRIQDKPAHGPGRFTMEERYAETKMGADRYQILQVGITCARFDYIANKYVLRPYNINISPLFDERMDFEREIRFQSGACTFLLGCGFDLGAPFTKGVQYLSREEAERARQMAWDRLENKNPIPDLQLKEGDVESLDFMRRVREAIKKWKTSTSSSLDITTHTGLSGAPSIPVITRFEKRLVHQLVRAEFPELVSIGRNECVRIVDLDPVREADNMRRIKNRVKDSIIRQTGFRWIFEALVKGGDINRTGPLYAARTTGMLSTADAHDIRDRYDRAIERLKTKQPVLVGHNMFTDIVYFYRTFVGELPDTLQGFQDAIHELFPKIIDTKYLATYAEGDLNASPSLQDIAQSLSRQPLPEIITHADHPKYQETERFHEAGYDSLLTATIMIKLAAKLGAERGEKVTAPLFSHPLTLNKANSILQSEDVPDFVKDGREKVEEPVPLPPVEQPKSRKTKKQKAKAKKKAAKERKFETKNLFDTLKTLDPETETSSTEEDDDAKLAQNGVSIEWDEELHESAGSWEDAVHVQDKTGWVPLEQMKRRSMELIPAFNSKFWDEFGNTLRVFGTEEAILHIADWEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.11
4 0.11
5 0.11
6 0.11
7 0.12
8 0.12
9 0.09
10 0.08
11 0.08
12 0.09
13 0.09
14 0.08
15 0.07
16 0.06
17 0.06
18 0.08
19 0.11
20 0.09
21 0.1
22 0.13
23 0.16
24 0.19
25 0.24
26 0.26
27 0.3
28 0.39
29 0.49
30 0.53
31 0.5
32 0.5
33 0.49
34 0.53
35 0.47
36 0.4
37 0.35
38 0.33
39 0.34
40 0.35
41 0.38
42 0.3
43 0.3
44 0.28
45 0.26
46 0.25
47 0.27
48 0.24
49 0.21
50 0.23
51 0.25
52 0.28
53 0.26
54 0.22
55 0.2
56 0.19
57 0.22
58 0.2
59 0.18
60 0.15
61 0.14
62 0.15
63 0.13
64 0.14
65 0.15
66 0.18
67 0.23
68 0.25
69 0.26
70 0.27
71 0.34
72 0.38
73 0.36
74 0.34
75 0.3
76 0.39
77 0.39
78 0.39
79 0.32
80 0.31
81 0.31
82 0.3
83 0.3
84 0.2
85 0.19
86 0.2
87 0.23
88 0.23
89 0.2
90 0.21
91 0.24
92 0.25
93 0.28
94 0.27
95 0.24
96 0.2
97 0.24
98 0.23
99 0.2
100 0.18
101 0.16
102 0.13
103 0.15
104 0.16
105 0.12
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.12
119 0.15
120 0.17
121 0.2
122 0.23
123 0.25
124 0.25
125 0.27
126 0.3
127 0.3
128 0.3
129 0.28
130 0.25
131 0.26
132 0.27
133 0.32
134 0.3
135 0.33
136 0.34
137 0.38
138 0.43
139 0.43
140 0.43
141 0.41
142 0.39
143 0.33
144 0.34
145 0.35
146 0.33
147 0.34
148 0.34
149 0.29
150 0.3
151 0.28
152 0.24
153 0.17
154 0.14
155 0.1
156 0.09
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.15
164 0.22
165 0.29
166 0.39
167 0.48
168 0.53
169 0.55
170 0.6
171 0.59
172 0.56
173 0.56
174 0.51
175 0.46
176 0.41
177 0.4
178 0.33
179 0.31
180 0.28
181 0.22
182 0.16
183 0.12
184 0.11
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.09
194 0.12
195 0.13
196 0.16
197 0.18
198 0.22
199 0.24
200 0.26
201 0.34
202 0.36
203 0.35
204 0.36
205 0.39
206 0.37
207 0.36
208 0.34
209 0.26
210 0.21
211 0.18
212 0.16
213 0.11
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.15
227 0.16
228 0.17
229 0.16
230 0.16
231 0.16
232 0.15
233 0.15
234 0.14
235 0.21
236 0.24
237 0.27
238 0.31
239 0.34
240 0.4
241 0.47
242 0.5
243 0.48
244 0.49
245 0.53
246 0.54
247 0.62
248 0.59
249 0.51
250 0.45
251 0.4
252 0.43
253 0.37
254 0.31
255 0.22
256 0.17
257 0.17
258 0.17
259 0.17
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.1
274 0.11
275 0.11
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.07
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.1
289 0.1
290 0.11
291 0.14
292 0.14
293 0.14
294 0.19
295 0.19
296 0.21
297 0.28
298 0.29
299 0.31
300 0.36
301 0.39
302 0.38
303 0.37
304 0.35
305 0.3
306 0.32
307 0.31
308 0.33
309 0.29
310 0.26
311 0.26
312 0.24
313 0.22
314 0.17
315 0.14
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.11
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.11
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.11
350 0.12
351 0.13
352 0.12
353 0.11
354 0.12
355 0.12
356 0.12
357 0.1
358 0.09
359 0.09
360 0.1
361 0.09
362 0.08
363 0.07
364 0.05
365 0.06
366 0.05
367 0.06
368 0.05
369 0.08
370 0.1
371 0.11
372 0.11
373 0.13
374 0.15
375 0.15
376 0.14
377 0.16
378 0.16
379 0.17
380 0.19
381 0.19
382 0.19
383 0.2
384 0.24
385 0.21
386 0.2
387 0.21
388 0.21
389 0.22
390 0.22
391 0.27
392 0.28
393 0.33
394 0.36
395 0.35
396 0.31
397 0.3
398 0.28
399 0.23
400 0.2
401 0.14
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.07
406 0.07
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.07
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.09
418 0.14
419 0.15
420 0.16
421 0.17
422 0.18
423 0.18
424 0.19
425 0.2
426 0.16
427 0.17
428 0.17
429 0.18
430 0.16
431 0.19
432 0.19
433 0.2
434 0.23
435 0.25
436 0.24
437 0.23
438 0.25
439 0.23
440 0.23
441 0.22
442 0.18
443 0.15
444 0.15
445 0.16
446 0.14
447 0.14
448 0.13
449 0.11
450 0.11
451 0.11
452 0.15
453 0.14
454 0.16
455 0.19
456 0.21
457 0.23
458 0.25
459 0.3
460 0.27
461 0.27
462 0.3
463 0.28
464 0.25
465 0.25
466 0.26
467 0.29
468 0.3
469 0.36
470 0.37
471 0.44
472 0.55
473 0.62
474 0.68
475 0.71
476 0.78
477 0.82
478 0.87
479 0.88
480 0.89
481 0.94
482 0.94
483 0.94
484 0.92
485 0.92
486 0.92
487 0.93
488 0.91
489 0.88
490 0.86
491 0.86
492 0.83
493 0.79
494 0.77
495 0.74
496 0.68
497 0.64
498 0.57
499 0.46
500 0.42
501 0.4
502 0.36
503 0.28
504 0.25
505 0.22
506 0.22
507 0.24
508 0.27
509 0.24
510 0.2
511 0.21
512 0.21
513 0.2
514 0.19
515 0.17
516 0.14
517 0.13
518 0.13
519 0.12
520 0.12
521 0.12
522 0.12
523 0.12
524 0.12
525 0.12
526 0.11
527 0.12
528 0.12
529 0.11
530 0.12
531 0.12
532 0.1
533 0.11
534 0.12
535 0.11
536 0.1
537 0.09
538 0.09
539 0.11
540 0.1
541 0.09
542 0.08
543 0.09
544 0.1
545 0.12
546 0.14
547 0.12
548 0.12
549 0.14
550 0.16
551 0.16
552 0.19
553 0.18
554 0.16
555 0.22
556 0.29
557 0.37
558 0.42
559 0.46
560 0.47
561 0.49
562 0.5
563 0.48
564 0.43
565 0.43
566 0.43
567 0.44
568 0.42
569 0.46
570 0.45
571 0.43
572 0.44
573 0.36
574 0.3
575 0.25
576 0.26
577 0.22
578 0.25
579 0.29
580 0.33
581 0.31
582 0.31
583 0.29
584 0.25
585 0.25
586 0.21
587 0.19
588 0.13
589 0.13
590 0.15
591 0.16
592 0.15
593 0.13