Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A399HPD4

Protein Details
Accession A0A399HPD4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
440-466KDAAQKAKGKGKRDRKRKSAAVEHDTABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
435-458EKRAEKDAAQKAKGKGKRDRKRKS
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 4, pero 3, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR006600  HTH_CenpB_DNA-bd_dom  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51253  HTH_CENPB  
Amino Acid Sequences MDKASRALAQPVPPSLSDSYRARADRSGVPHTTLHHRARGRRSIEEKAQSQQYLAPYEEDALVRFLLQLSDLGQPVRIKYIRFLAFCVTGQRSETDRPLKPPGKNWTRGFEKRHPETQARRVKALDWSRHEKNTYWKITHWYLDPMVIWPAATHRSNWTTFPTPGWQYACSDTGYTDSYISLQWLQRIFDPATKERARGKPRVLICDGFGTHETLEVLEFCFANNILLCRLPSHTSHKLQPCDVAVFSPLKAAYREQVERLERGGVNTIGKEHFTSLYSPAREKAFTSKNIIAGFAASGLFPFNPDRVLRSMPKPLADLTIPKADEVNVEACRESEVPQTPVTPVSAEGLASLRNLIIEQDAGALDETSKRNLQRHLHKLAKAAQLSLAEGALHKNHIRFLLTVNSEAKVRRSTTSLVLGKAKVMGYEELVEAREKRAEKDAAQKAKGKGKRDRKRKSAAVEHDTAEPKTKATRVAEEPEPAVTLATTSTVAAVVGIETAPPTWRAPVARMY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.33
3 0.31
4 0.32
5 0.31
6 0.33
7 0.38
8 0.39
9 0.37
10 0.38
11 0.4
12 0.4
13 0.43
14 0.46
15 0.41
16 0.43
17 0.42
18 0.42
19 0.46
20 0.49
21 0.47
22 0.48
23 0.52
24 0.58
25 0.65
26 0.7
27 0.67
28 0.68
29 0.69
30 0.7
31 0.72
32 0.72
33 0.66
34 0.63
35 0.64
36 0.55
37 0.49
38 0.44
39 0.39
40 0.34
41 0.31
42 0.26
43 0.2
44 0.21
45 0.22
46 0.19
47 0.16
48 0.14
49 0.13
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.12
58 0.12
59 0.12
60 0.15
61 0.16
62 0.17
63 0.24
64 0.24
65 0.22
66 0.24
67 0.33
68 0.36
69 0.35
70 0.36
71 0.32
72 0.33
73 0.33
74 0.35
75 0.29
76 0.24
77 0.24
78 0.25
79 0.25
80 0.27
81 0.34
82 0.36
83 0.37
84 0.41
85 0.5
86 0.54
87 0.54
88 0.58
89 0.61
90 0.63
91 0.69
92 0.67
93 0.66
94 0.68
95 0.72
96 0.72
97 0.7
98 0.71
99 0.68
100 0.71
101 0.69
102 0.68
103 0.69
104 0.71
105 0.72
106 0.65
107 0.62
108 0.55
109 0.52
110 0.52
111 0.53
112 0.51
113 0.48
114 0.53
115 0.55
116 0.58
117 0.59
118 0.52
119 0.54
120 0.55
121 0.54
122 0.49
123 0.46
124 0.48
125 0.49
126 0.49
127 0.41
128 0.35
129 0.29
130 0.28
131 0.26
132 0.21
133 0.18
134 0.15
135 0.13
136 0.09
137 0.11
138 0.14
139 0.15
140 0.14
141 0.18
142 0.22
143 0.24
144 0.25
145 0.29
146 0.28
147 0.28
148 0.3
149 0.3
150 0.28
151 0.3
152 0.31
153 0.26
154 0.23
155 0.25
156 0.24
157 0.2
158 0.18
159 0.14
160 0.14
161 0.15
162 0.13
163 0.11
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.13
171 0.14
172 0.15
173 0.16
174 0.2
175 0.2
176 0.2
177 0.24
178 0.23
179 0.3
180 0.3
181 0.32
182 0.36
183 0.44
184 0.47
185 0.48
186 0.5
187 0.49
188 0.51
189 0.54
190 0.49
191 0.41
192 0.36
193 0.33
194 0.29
195 0.24
196 0.21
197 0.16
198 0.13
199 0.13
200 0.11
201 0.08
202 0.08
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.11
219 0.13
220 0.2
221 0.26
222 0.29
223 0.36
224 0.41
225 0.42
226 0.4
227 0.39
228 0.33
229 0.28
230 0.25
231 0.18
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.1
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.14
242 0.15
243 0.15
244 0.21
245 0.21
246 0.21
247 0.21
248 0.22
249 0.18
250 0.17
251 0.18
252 0.14
253 0.13
254 0.12
255 0.13
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.12
264 0.17
265 0.17
266 0.18
267 0.19
268 0.2
269 0.19
270 0.19
271 0.23
272 0.24
273 0.25
274 0.31
275 0.3
276 0.32
277 0.32
278 0.31
279 0.23
280 0.18
281 0.16
282 0.1
283 0.08
284 0.04
285 0.04
286 0.05
287 0.04
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.08
292 0.09
293 0.11
294 0.13
295 0.18
296 0.2
297 0.23
298 0.3
299 0.29
300 0.3
301 0.29
302 0.27
303 0.25
304 0.22
305 0.21
306 0.17
307 0.21
308 0.2
309 0.19
310 0.18
311 0.16
312 0.16
313 0.15
314 0.16
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.12
319 0.14
320 0.14
321 0.13
322 0.15
323 0.17
324 0.18
325 0.19
326 0.2
327 0.19
328 0.19
329 0.18
330 0.13
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.09
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.1
354 0.11
355 0.13
356 0.17
357 0.19
358 0.23
359 0.3
360 0.39
361 0.45
362 0.52
363 0.59
364 0.63
365 0.62
366 0.64
367 0.64
368 0.63
369 0.53
370 0.45
371 0.38
372 0.32
373 0.3
374 0.25
375 0.17
376 0.1
377 0.1
378 0.11
379 0.09
380 0.11
381 0.13
382 0.13
383 0.15
384 0.17
385 0.18
386 0.17
387 0.19
388 0.24
389 0.24
390 0.27
391 0.26
392 0.25
393 0.26
394 0.26
395 0.27
396 0.23
397 0.24
398 0.22
399 0.25
400 0.27
401 0.29
402 0.37
403 0.37
404 0.36
405 0.38
406 0.36
407 0.33
408 0.33
409 0.29
410 0.2
411 0.19
412 0.16
413 0.14
414 0.15
415 0.15
416 0.13
417 0.14
418 0.15
419 0.14
420 0.15
421 0.19
422 0.19
423 0.21
424 0.27
425 0.3
426 0.32
427 0.42
428 0.49
429 0.53
430 0.56
431 0.61
432 0.59
433 0.65
434 0.67
435 0.65
436 0.66
437 0.68
438 0.75
439 0.79
440 0.83
441 0.83
442 0.88
443 0.88
444 0.87
445 0.87
446 0.86
447 0.82
448 0.76
449 0.68
450 0.64
451 0.59
452 0.5
453 0.45
454 0.36
455 0.3
456 0.31
457 0.31
458 0.32
459 0.33
460 0.39
461 0.39
462 0.45
463 0.48
464 0.46
465 0.45
466 0.39
467 0.35
468 0.28
469 0.22
470 0.15
471 0.12
472 0.09
473 0.09
474 0.08
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.06
487 0.08
488 0.1
489 0.11
490 0.13
491 0.17
492 0.2