Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A399HSQ2

Protein Details
Accession A0A399HSQ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-63PEASKDSKKAAKKAKRKEKKKQKAKEIDEDDLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-56KKRKREAEPEASKDSKKAAKKAKRKEKKKQKAK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13.833, cyto 10.5, mito_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032704  Cms1  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Pfam View protein in Pfam  
PF14617  CMS1  
Amino Acid Sequences MSDSDSEGGVPLIEAQFDVDASSKKRKREAEPEASKDSKKAAKKAKRKEKKKQKAKEIDEDDLDQTLGVNHSFERMDGQLLADYVNARTRLYGKELSSVELEDKFISARTVQDGTSWTEPRTTDNLSAFLNKQSSTLEPTPSKPPGAPHTLVVTVSGIRAADVCRSLKSGLPKQGIKNPNVAKLFAKHLKLPDQVAHLKKTKIDYGVGTPDRLIALLEDGALSTANLKRVVIDVSYIDQKKRGILDMKDLHEAVIKLLLRKELVGEDKQGGDGLFLFY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.08
4 0.08
5 0.08
6 0.09
7 0.12
8 0.17
9 0.28
10 0.31
11 0.36
12 0.45
13 0.52
14 0.58
15 0.66
16 0.72
17 0.72
18 0.77
19 0.78
20 0.78
21 0.75
22 0.67
23 0.57
24 0.53
25 0.49
26 0.46
27 0.49
28 0.52
29 0.58
30 0.68
31 0.78
32 0.83
33 0.86
34 0.9
35 0.93
36 0.93
37 0.94
38 0.95
39 0.94
40 0.94
41 0.94
42 0.91
43 0.9
44 0.85
45 0.79
46 0.7
47 0.62
48 0.51
49 0.41
50 0.33
51 0.22
52 0.15
53 0.11
54 0.09
55 0.07
56 0.07
57 0.06
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.1
65 0.11
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.11
76 0.13
77 0.15
78 0.19
79 0.23
80 0.2
81 0.26
82 0.26
83 0.27
84 0.25
85 0.24
86 0.2
87 0.16
88 0.16
89 0.1
90 0.1
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.12
101 0.15
102 0.19
103 0.19
104 0.17
105 0.18
106 0.18
107 0.2
108 0.21
109 0.2
110 0.19
111 0.18
112 0.2
113 0.18
114 0.2
115 0.18
116 0.17
117 0.16
118 0.13
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.16
123 0.16
124 0.18
125 0.19
126 0.21
127 0.25
128 0.25
129 0.25
130 0.2
131 0.22
132 0.22
133 0.26
134 0.25
135 0.21
136 0.22
137 0.22
138 0.21
139 0.19
140 0.15
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.05
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.11
153 0.12
154 0.14
155 0.21
156 0.26
157 0.31
158 0.36
159 0.39
160 0.41
161 0.49
162 0.52
163 0.46
164 0.48
165 0.43
166 0.45
167 0.43
168 0.41
169 0.34
170 0.31
171 0.37
172 0.34
173 0.33
174 0.29
175 0.31
176 0.35
177 0.36
178 0.36
179 0.31
180 0.32
181 0.37
182 0.37
183 0.39
184 0.38
185 0.36
186 0.37
187 0.38
188 0.35
189 0.31
190 0.29
191 0.26
192 0.26
193 0.34
194 0.33
195 0.3
196 0.26
197 0.24
198 0.22
199 0.2
200 0.16
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.07
211 0.09
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.14
217 0.16
218 0.13
219 0.13
220 0.12
221 0.14
222 0.23
223 0.24
224 0.24
225 0.25
226 0.26
227 0.28
228 0.28
229 0.31
230 0.31
231 0.31
232 0.4
233 0.44
234 0.47
235 0.47
236 0.45
237 0.39
238 0.36
239 0.34
240 0.24
241 0.23
242 0.21
243 0.2
244 0.22
245 0.24
246 0.21
247 0.21
248 0.23
249 0.22
250 0.27
251 0.27
252 0.28
253 0.28
254 0.28
255 0.28
256 0.27
257 0.21
258 0.16