Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A399GD52

Protein Details
Accession A0A399GD52    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MASDKKASKKSSADKKQKKTSATKNVEAPHydrophilic
269-290DEEPAKTKKTKKTAKKASTSSSHydrophilic
357-376ADAPKSKRSHVENRFQRIKPHydrophilic
404-426VTKGKGFTKEKNKGKRGSYRGGMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-19KASKKSSADKKQKK
96-107KPKKAKKTAANK
145-159VKKAKAVVKKAKKAK
229-237TTKAKKSKK
276-283KKTKKTAK
408-420KGFTKEKNKGKRG
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MASDKKASKKSSADKKQKKTSATKNVEAPLDVIKNFLEQQGEKSAASKLEDFAQSLQDAVKNAPEPMDVDEESASSSDSSSDSSSDSSSESEAEAKPKKAKKTAANKAPAKEDASSSSSSSDSSSDSSSDSSDSDSESEKESAPVKKAKAVVKKAKKAKSVSSSSASSSSDSSDSSDSDSSSEEEPANVPLPDSDSSDASSDSSSSDSDSDSSDSSSDSSSESEAEKKTTKAKKSKKAASVSSSSASSSSDSSDSSDSSDSSDSDSSSDEEPAKTKKTKKTAKKASTSSSSSDSSSSDSSSDSSSDSDSSSDSSSDDDEKKPAALERKTSASDSSATLPANSPAPSSNKRKASSPSADAPKSKRSHVENRFQRIKPDVKVDPKLASNAYVSYDYADRAHAKLIVTKGKGFTKEKNKGKRGSYRGGMIDTSGGKGIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.88
3 0.91
4 0.89
5 0.87
6 0.87
7 0.86
8 0.86
9 0.84
10 0.8
11 0.76
12 0.74
13 0.67
14 0.57
15 0.47
16 0.42
17 0.37
18 0.31
19 0.25
20 0.2
21 0.21
22 0.21
23 0.22
24 0.2
25 0.17
26 0.21
27 0.26
28 0.28
29 0.26
30 0.26
31 0.27
32 0.24
33 0.26
34 0.24
35 0.19
36 0.23
37 0.24
38 0.24
39 0.22
40 0.22
41 0.2
42 0.19
43 0.19
44 0.15
45 0.15
46 0.14
47 0.17
48 0.16
49 0.17
50 0.17
51 0.16
52 0.15
53 0.17
54 0.21
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.15
61 0.12
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.1
78 0.13
79 0.14
80 0.2
81 0.24
82 0.27
83 0.35
84 0.4
85 0.47
86 0.51
87 0.58
88 0.61
89 0.67
90 0.74
91 0.75
92 0.79
93 0.77
94 0.73
95 0.7
96 0.63
97 0.54
98 0.45
99 0.37
100 0.31
101 0.29
102 0.27
103 0.22
104 0.21
105 0.19
106 0.18
107 0.17
108 0.13
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.12
124 0.14
125 0.15
126 0.14
127 0.16
128 0.19
129 0.21
130 0.24
131 0.28
132 0.26
133 0.29
134 0.35
135 0.4
136 0.45
137 0.51
138 0.58
139 0.62
140 0.7
141 0.75
142 0.76
143 0.76
144 0.71
145 0.7
146 0.67
147 0.63
148 0.59
149 0.54
150 0.48
151 0.42
152 0.4
153 0.33
154 0.25
155 0.2
156 0.17
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.12
163 0.12
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.09
176 0.08
177 0.07
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.1
187 0.09
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.07
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.12
211 0.12
212 0.14
213 0.15
214 0.15
215 0.23
216 0.29
217 0.36
218 0.44
219 0.53
220 0.6
221 0.68
222 0.75
223 0.75
224 0.74
225 0.71
226 0.65
227 0.6
228 0.52
229 0.44
230 0.36
231 0.28
232 0.21
233 0.17
234 0.14
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.1
249 0.11
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.11
255 0.12
256 0.11
257 0.11
258 0.14
259 0.16
260 0.21
261 0.25
262 0.32
263 0.38
264 0.47
265 0.57
266 0.65
267 0.73
268 0.79
269 0.82
270 0.83
271 0.81
272 0.77
273 0.74
274 0.66
275 0.58
276 0.51
277 0.43
278 0.35
279 0.3
280 0.25
281 0.2
282 0.18
283 0.16
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.09
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.14
303 0.17
304 0.17
305 0.18
306 0.18
307 0.18
308 0.19
309 0.21
310 0.25
311 0.25
312 0.29
313 0.31
314 0.35
315 0.36
316 0.36
317 0.33
318 0.27
319 0.25
320 0.22
321 0.22
322 0.2
323 0.19
324 0.18
325 0.18
326 0.17
327 0.18
328 0.16
329 0.14
330 0.14
331 0.21
332 0.28
333 0.35
334 0.42
335 0.48
336 0.49
337 0.54
338 0.57
339 0.59
340 0.59
341 0.57
342 0.57
343 0.58
344 0.6
345 0.6
346 0.58
347 0.58
348 0.54
349 0.52
350 0.51
351 0.5
352 0.57
353 0.61
354 0.67
355 0.68
356 0.75
357 0.8
358 0.74
359 0.72
360 0.69
361 0.67
362 0.6
363 0.59
364 0.57
365 0.57
366 0.61
367 0.59
368 0.56
369 0.51
370 0.5
371 0.43
372 0.36
373 0.29
374 0.24
375 0.24
376 0.21
377 0.19
378 0.17
379 0.17
380 0.16
381 0.16
382 0.18
383 0.17
384 0.17
385 0.19
386 0.19
387 0.2
388 0.24
389 0.29
390 0.34
391 0.34
392 0.37
393 0.4
394 0.43
395 0.5
396 0.49
397 0.53
398 0.56
399 0.64
400 0.7
401 0.76
402 0.79
403 0.79
404 0.84
405 0.85
406 0.82
407 0.81
408 0.77
409 0.73
410 0.68
411 0.63
412 0.54
413 0.44
414 0.4
415 0.31
416 0.27
417 0.23
418 0.2
419 0.16