Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A399HVL8

Protein Details
Accession A0A399HVL8    Localization Confidence Low Confidence Score 6.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-75SSPLSSVKSNTKRRNDERDTRLISHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 9.333, nucl 6.5, cyto_nucl 4.833, cyto 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003607  HD/PDEase_dom  
IPR006674  HD_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF01966  HD  
CDD cd00077  HDc  
Amino Acid Sequences MSQDKTKTSKTDGVFKNIHRRMSNFGKPSGTPKSPYETMSSVADQLPSSLSSSPLSSVKSNTKRRNDERDTRLISLDKLMDGAAIADNDRRWFEKINIAVRAKMNSSAYDPSHDFEHVQRVIMNAHRLWHAEKDREVFRNVDPLVVYVAAMVHDIGDGKYLSDELVKMETDEADQEQQRDFIESFIRESAPECPPYIWGPASHVAALVSFIREIRNPVMVAQQCAAYPALQLVQDADRLDGLGAVGIVRGAVYGGVTEPRGTGTVRRVVHIADERHARYPEMMKTRAGKKEAAKRWEAMKEIRNQIVQQANCEDVLEEY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.6
3 0.65
4 0.62
5 0.66
6 0.59
7 0.56
8 0.56
9 0.6
10 0.62
11 0.56
12 0.55
13 0.52
14 0.5
15 0.54
16 0.54
17 0.49
18 0.44
19 0.42
20 0.46
21 0.44
22 0.45
23 0.43
24 0.36
25 0.34
26 0.33
27 0.31
28 0.25
29 0.24
30 0.23
31 0.17
32 0.16
33 0.15
34 0.12
35 0.13
36 0.11
37 0.12
38 0.12
39 0.13
40 0.14
41 0.15
42 0.18
43 0.18
44 0.22
45 0.3
46 0.39
47 0.49
48 0.56
49 0.64
50 0.71
51 0.78
52 0.84
53 0.83
54 0.83
55 0.8
56 0.81
57 0.76
58 0.67
59 0.62
60 0.52
61 0.44
62 0.37
63 0.31
64 0.21
65 0.16
66 0.14
67 0.11
68 0.09
69 0.09
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.08
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.13
78 0.14
79 0.16
80 0.18
81 0.24
82 0.29
83 0.33
84 0.39
85 0.38
86 0.4
87 0.39
88 0.38
89 0.32
90 0.29
91 0.25
92 0.18
93 0.2
94 0.21
95 0.2
96 0.22
97 0.21
98 0.19
99 0.2
100 0.19
101 0.17
102 0.15
103 0.22
104 0.18
105 0.18
106 0.17
107 0.16
108 0.18
109 0.19
110 0.21
111 0.14
112 0.15
113 0.15
114 0.16
115 0.17
116 0.22
117 0.24
118 0.24
119 0.26
120 0.28
121 0.31
122 0.32
123 0.32
124 0.27
125 0.24
126 0.28
127 0.25
128 0.22
129 0.18
130 0.16
131 0.15
132 0.13
133 0.12
134 0.05
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.08
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.12
167 0.11
168 0.09
169 0.11
170 0.11
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.1
175 0.11
176 0.15
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.14
181 0.16
182 0.17
183 0.18
184 0.15
185 0.12
186 0.15
187 0.17
188 0.17
189 0.15
190 0.14
191 0.12
192 0.11
193 0.12
194 0.09
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.11
201 0.11
202 0.14
203 0.13
204 0.14
205 0.21
206 0.21
207 0.22
208 0.2
209 0.19
210 0.16
211 0.17
212 0.17
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.04
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.09
248 0.1
249 0.13
250 0.17
251 0.25
252 0.25
253 0.27
254 0.27
255 0.26
256 0.32
257 0.35
258 0.32
259 0.3
260 0.37
261 0.38
262 0.42
263 0.43
264 0.37
265 0.34
266 0.37
267 0.4
268 0.4
269 0.4
270 0.39
271 0.45
272 0.53
273 0.56
274 0.53
275 0.51
276 0.52
277 0.61
278 0.66
279 0.65
280 0.61
281 0.58
282 0.62
283 0.62
284 0.58
285 0.55
286 0.53
287 0.55
288 0.58
289 0.6
290 0.56
291 0.5
292 0.53
293 0.54
294 0.47
295 0.43
296 0.39
297 0.35
298 0.32
299 0.32