Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A399HRT6

Protein Details
Accession A0A399HRT6    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
518-539QLKAVKRVERERRAEEKRKEEABasic
550-577LINNTKKLIKLSKKGKRKASTADQPATKHydrophilic
594-616AAQPVPPKTTKTRVIRRPKKDLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
521-569AVKRVERERRAEEKRKEEAEKLAKKQHQQLINNTKKLIKLSKKGKRKAS
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR006600  HTH_CenpB_DNA-bd_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
PF03221  HTH_Tnp_Tc5  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51253  HTH_CENPB  
Amino Acid Sequences MDPIQEAIEEIESRDPGDDFSYQAIAKKFGIDRRTLARRHQGLSTTRNAAHLVLHPEHEAELVQYIRTLNERSLPPSRAMIQQFAGQLAGKPVSRSWVTRFLNRHPKNLISRYTKGMTKERTKADSGAKYNLYFKLLLDKMKEYDIQPLHIFNMDEKGFQLGRLGGSKRIFDKSLWEKKEVRQALEDGSSEWITVMACICSDGKPLSPTLIFQGANGSVQSSWVEAIQAGEHSVFVTSSPSGWSNNDIGLAWLKGVFERETRRYASTGYRLLLLDGHGSHVTMDFIEYCHDNKILLFVFPPHATHTLQPLDVVMFKPLATAYSNELSGYLQDSQGLLPLTKGDFFPLFWSSWNSVFKAPLIKRSFEATGIYPPNPDAILKKFAKEASDSDSSQSVLSGDDWLKLKTIVRREVKDQSSKDVKKLQRSLHHIAAQNQLLHGEIRGLKRSLAIKERRPKQSFALQLDEDEVYHGGAKIWSPRSVQRARDRRASQQQQAELEKLQKAKQAEIKKAARDCDAQLKAVKRVERERRAEEKRKEEAEKLAKKQHQQLINNTKKLIKLSKKGKRKASTADQPATKRQKGVVGGTASVGAQVAAQPVPPKTTKTRVIRRPKKDLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.13
4 0.16
5 0.16
6 0.14
7 0.16
8 0.18
9 0.17
10 0.22
11 0.23
12 0.22
13 0.22
14 0.26
15 0.29
16 0.33
17 0.38
18 0.37
19 0.4
20 0.46
21 0.55
22 0.53
23 0.56
24 0.6
25 0.61
26 0.6
27 0.6
28 0.58
29 0.57
30 0.59
31 0.57
32 0.52
33 0.47
34 0.46
35 0.42
36 0.36
37 0.31
38 0.31
39 0.31
40 0.27
41 0.27
42 0.26
43 0.25
44 0.25
45 0.23
46 0.17
47 0.11
48 0.13
49 0.12
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.13
54 0.16
55 0.17
56 0.15
57 0.21
58 0.24
59 0.28
60 0.35
61 0.36
62 0.35
63 0.37
64 0.38
65 0.39
66 0.39
67 0.37
68 0.31
69 0.33
70 0.32
71 0.28
72 0.26
73 0.19
74 0.17
75 0.17
76 0.18
77 0.15
78 0.15
79 0.15
80 0.2
81 0.22
82 0.24
83 0.27
84 0.34
85 0.37
86 0.43
87 0.48
88 0.52
89 0.61
90 0.61
91 0.63
92 0.57
93 0.61
94 0.63
95 0.65
96 0.64
97 0.6
98 0.6
99 0.6
100 0.59
101 0.55
102 0.51
103 0.53
104 0.53
105 0.53
106 0.58
107 0.58
108 0.58
109 0.57
110 0.57
111 0.57
112 0.57
113 0.52
114 0.5
115 0.47
116 0.44
117 0.45
118 0.41
119 0.35
120 0.27
121 0.23
122 0.26
123 0.26
124 0.28
125 0.27
126 0.28
127 0.27
128 0.29
129 0.32
130 0.23
131 0.3
132 0.28
133 0.28
134 0.26
135 0.25
136 0.24
137 0.24
138 0.23
139 0.15
140 0.2
141 0.17
142 0.16
143 0.16
144 0.19
145 0.16
146 0.16
147 0.17
148 0.12
149 0.13
150 0.18
151 0.19
152 0.21
153 0.22
154 0.25
155 0.26
156 0.28
157 0.28
158 0.24
159 0.31
160 0.36
161 0.44
162 0.45
163 0.47
164 0.47
165 0.5
166 0.6
167 0.54
168 0.46
169 0.39
170 0.38
171 0.35
172 0.34
173 0.3
174 0.2
175 0.2
176 0.17
177 0.14
178 0.13
179 0.1
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.12
193 0.13
194 0.12
195 0.13
196 0.14
197 0.17
198 0.16
199 0.14
200 0.17
201 0.15
202 0.15
203 0.14
204 0.12
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.06
224 0.05
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.1
230 0.12
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.08
243 0.08
244 0.11
245 0.16
246 0.19
247 0.22
248 0.25
249 0.26
250 0.25
251 0.26
252 0.27
253 0.27
254 0.27
255 0.24
256 0.23
257 0.22
258 0.21
259 0.19
260 0.15
261 0.11
262 0.08
263 0.1
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.05
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.11
289 0.13
290 0.13
291 0.14
292 0.17
293 0.16
294 0.16
295 0.15
296 0.13
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.06
307 0.07
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.07
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.08
322 0.09
323 0.07
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.08
332 0.1
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.14
337 0.14
338 0.18
339 0.2
340 0.19
341 0.18
342 0.18
343 0.18
344 0.24
345 0.23
346 0.28
347 0.29
348 0.29
349 0.29
350 0.32
351 0.31
352 0.24
353 0.25
354 0.17
355 0.21
356 0.22
357 0.21
358 0.18
359 0.18
360 0.17
361 0.16
362 0.15
363 0.11
364 0.12
365 0.2
366 0.2
367 0.21
368 0.23
369 0.24
370 0.25
371 0.24
372 0.22
373 0.2
374 0.24
375 0.23
376 0.22
377 0.22
378 0.21
379 0.18
380 0.17
381 0.11
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.09
386 0.11
387 0.12
388 0.13
389 0.13
390 0.13
391 0.16
392 0.18
393 0.25
394 0.31
395 0.36
396 0.39
397 0.44
398 0.52
399 0.54
400 0.58
401 0.52
402 0.51
403 0.55
404 0.54
405 0.54
406 0.54
407 0.53
408 0.55
409 0.6
410 0.59
411 0.57
412 0.64
413 0.65
414 0.63
415 0.64
416 0.58
417 0.55
418 0.54
419 0.48
420 0.4
421 0.34
422 0.27
423 0.22
424 0.18
425 0.14
426 0.11
427 0.13
428 0.15
429 0.19
430 0.2
431 0.19
432 0.23
433 0.27
434 0.29
435 0.35
436 0.4
437 0.46
438 0.55
439 0.64
440 0.7
441 0.7
442 0.67
443 0.63
444 0.64
445 0.63
446 0.58
447 0.55
448 0.45
449 0.42
450 0.41
451 0.35
452 0.27
453 0.2
454 0.15
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.07
459 0.08
460 0.09
461 0.15
462 0.18
463 0.2
464 0.23
465 0.27
466 0.36
467 0.42
468 0.49
469 0.53
470 0.6
471 0.62
472 0.7
473 0.69
474 0.7
475 0.74
476 0.75
477 0.72
478 0.69
479 0.69
480 0.64
481 0.63
482 0.56
483 0.47
484 0.43
485 0.39
486 0.34
487 0.32
488 0.31
489 0.3
490 0.33
491 0.39
492 0.43
493 0.47
494 0.53
495 0.57
496 0.6
497 0.62
498 0.59
499 0.55
500 0.5
501 0.45
502 0.46
503 0.42
504 0.38
505 0.39
506 0.4
507 0.43
508 0.45
509 0.45
510 0.41
511 0.49
512 0.57
513 0.61
514 0.65
515 0.67
516 0.72
517 0.79
518 0.83
519 0.82
520 0.8
521 0.79
522 0.78
523 0.75
524 0.68
525 0.68
526 0.68
527 0.68
528 0.66
529 0.68
530 0.66
531 0.68
532 0.73
533 0.71
534 0.69
535 0.66
536 0.7
537 0.72
538 0.76
539 0.73
540 0.66
541 0.62
542 0.55
543 0.55
544 0.55
545 0.53
546 0.53
547 0.61
548 0.69
549 0.76
550 0.82
551 0.86
552 0.84
553 0.82
554 0.81
555 0.81
556 0.82
557 0.81
558 0.8
559 0.77
560 0.73
561 0.76
562 0.76
563 0.68
564 0.61
565 0.54
566 0.53
567 0.5
568 0.51
569 0.48
570 0.41
571 0.38
572 0.36
573 0.34
574 0.27
575 0.22
576 0.17
577 0.09
578 0.06
579 0.07
580 0.08
581 0.08
582 0.1
583 0.13
584 0.14
585 0.2
586 0.22
587 0.26
588 0.32
589 0.4
590 0.48
591 0.56
592 0.65
593 0.7
594 0.8
595 0.85
596 0.87