FuNGI

A0A399GFU7

Protein Details

Accession

A0A399GFU7

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-48	VAANGQQPPVRRRRPRPQADVLRKPRRPLQ	Hydrophilic
528-554	EASGNESSRKKHKKKHDKLADGSRKSS	Basic
567-591	SEMTDAGKKRKKDKKDKNRTMMGGS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
29-45	RRRRPRPQADVLRKPRR
174-175	RK
188-197	GMKKPPAFHK
515-552	SKSKKRPGSPNLSEASGNESSRKKHKKKHDKLADGSRK
573-585	GKKRKKDKKDKNR

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNGNTNGNPPPASAPAAPVAANGQQPPVRRRRPRPQADVLRKPRRPLQNITRPMVSLSQMNEAKKPVAGPANDGTQSKDALRQQFLDQGASVFPLIVSRKDLKELRHHVMRLHSKTHVDITDEHQFKTPIKLHRRDPRAPPSGMGSTYEEEDTKEDMEEMKERERIELQKEERRKVREENQAKIAPTGMKKPPAFHKKTEQKYRPDDTPEAKKRQLLRYEETLPWHLEDFENKQTWVGTYESELSETHVMLSTTRPGDPSTAIQMAPMERWYRFNVKGKVKTGGDDLDKILAKVERGGGPKFFADLEERQKQRVNAENNARMWSGVRTRVGGGADDEGRIKRERNDDDTIGFVKREADADDIDFNLEEDFADDEEGLNGLFEGEEQDVKEAAEKLKRDQLQAALWDRPDELAIAIKEEQERKEAEEKRIQEKATRKALVKREKQYDYLDSDPENPYITESESDTDSETERQQAKEEAEKKAAEQNGKAPEAGNVPSGTSTKGSNTPSGNHKSGDSKSKKRPGSPNLSEASGNESSRKKHKKKHDKLADGSRKSSLANLKGAGSGSDSEMTDAGKKRKKDKKDKNRTMMGGSPSGTPGASRAGSPAANGSRAGSPSAAPARPPLPSAKEIYESLPPQGMNIQNLIVKFKGRVDKTNTQLFIKLVKAVSSFDKAKSWLTPLEKMPSDEHISAFMNAGNAPKPA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.24
3	0.25
4	0.23
5	0.2
6	0.2
7	0.19
8	0.22
9	0.19
10	0.22
11	0.23
12	0.3
13	0.38
14	0.46
15	0.53
16	0.61
17	0.7
18	0.76
19	0.85
20	0.89
21	0.9
22	0.9
23	0.91
24	0.91
25	0.92
26	0.92
27	0.92
28	0.86
29	0.82
30	0.8
31	0.79
32	0.75
33	0.74
34	0.74
35	0.74
36	0.78
37	0.77
38	0.71
39	0.61
40	0.56
41	0.49
42	0.39
43	0.32
44	0.26
45	0.3
46	0.32
47	0.33
48	0.33
49	0.33
50	0.32
51	0.3
52	0.28
53	0.25
54	0.28
55	0.26
56	0.29
57	0.3
58	0.34
59	0.35
60	0.35
61	0.33
62	0.28
63	0.29
64	0.25
65	0.29
66	0.29
67	0.33
68	0.36
69	0.34
70	0.35
71	0.39
72	0.39
73	0.34
74	0.28
75	0.23
76	0.2
77	0.18
78	0.16
79	0.1
80	0.08
81	0.11
82	0.12
83	0.13
84	0.17
85	0.21
86	0.23
87	0.3
88	0.34
89	0.35
90	0.44
91	0.51
92	0.53
93	0.56
94	0.56
95	0.53
96	0.59
97	0.63
98	0.58
99	0.55
100	0.51
101	0.45
102	0.47
103	0.48
104	0.4
105	0.32
106	0.3
107	0.31
108	0.37
109	0.36
110	0.35
111	0.32
112	0.32
113	0.31
114	0.37
115	0.37
116	0.37
117	0.46
118	0.52
119	0.59
120	0.67
121	0.75
122	0.74
123	0.77
124	0.78
125	0.75
126	0.69
127	0.61
128	0.57
129	0.51
130	0.44
131	0.38
132	0.31
133	0.24
134	0.25
135	0.24
136	0.19
137	0.16
138	0.17
139	0.16
140	0.13
141	0.12
142	0.11
143	0.11
144	0.13
145	0.17
146	0.18
147	0.21
148	0.23
149	0.23
150	0.25
151	0.29
152	0.31
153	0.33
154	0.39
155	0.41
156	0.47
157	0.53
158	0.58
159	0.6
160	0.61
161	0.6
162	0.59
163	0.62
164	0.65
165	0.64
166	0.63
167	0.64
168	0.63
169	0.59
170	0.51
171	0.44
172	0.37
173	0.33
174	0.34
175	0.31
176	0.35
177	0.35
178	0.39
179	0.47
180	0.53
181	0.56
182	0.54
183	0.6
184	0.63
185	0.72
186	0.79
187	0.76
188	0.75
189	0.78
190	0.78
191	0.72
192	0.69
193	0.65
194	0.6
195	0.63
196	0.63
197	0.61
198	0.58
199	0.58
200	0.58
201	0.6
202	0.62
203	0.56
204	0.53
205	0.52
206	0.55
207	0.52
208	0.49
209	0.43
210	0.36
211	0.31
212	0.26
213	0.2
214	0.16
215	0.17
216	0.19
217	0.22
218	0.22
219	0.21
220	0.21
221	0.2
222	0.2
223	0.19
224	0.15
225	0.1
226	0.1
227	0.12
228	0.12
229	0.13
230	0.12
231	0.12
232	0.12
233	0.12
234	0.11
235	0.1
236	0.09
237	0.09
238	0.1
239	0.12
240	0.12
241	0.13
242	0.13
243	0.12
244	0.14
245	0.15
246	0.15
247	0.15
248	0.16
249	0.15
250	0.14
251	0.15
252	0.14
253	0.13
254	0.14
255	0.12
256	0.11
257	0.14
258	0.17
259	0.22
260	0.27
261	0.35
262	0.41
263	0.48
264	0.54
265	0.54
266	0.57
267	0.52
268	0.47
269	0.41
270	0.36
271	0.29
272	0.24
273	0.21
274	0.19
275	0.19
276	0.17
277	0.16
278	0.13
279	0.12
280	0.11
281	0.13
282	0.14
283	0.16
284	0.18
285	0.17
286	0.17
287	0.17
288	0.17
289	0.14
290	0.11
291	0.12
292	0.15
293	0.21
294	0.28
295	0.29
296	0.3
297	0.33
298	0.33
299	0.34
300	0.37
301	0.35
302	0.35
303	0.42
304	0.45
305	0.43
306	0.44
307	0.39
308	0.31
309	0.27
310	0.23
311	0.18
312	0.17
313	0.17
314	0.16
315	0.16
316	0.18
317	0.17
318	0.15
319	0.12
320	0.11
321	0.1
322	0.1
323	0.11
324	0.09
325	0.11
326	0.11
327	0.12
328	0.14
329	0.21
330	0.24
331	0.29
332	0.33
333	0.32
334	0.32
335	0.32
336	0.29
337	0.22
338	0.19
339	0.13
340	0.1
341	0.09
342	0.09
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.09
347	0.09
348	0.09
349	0.08
350	0.07
351	0.07
352	0.05
353	0.05
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.02
368	0.02
369	0.04
370	0.04
371	0.05
372	0.05
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.08
377	0.08
378	0.1
379	0.13
380	0.14
381	0.16
382	0.23
383	0.25
384	0.25
385	0.25
386	0.26
387	0.24
388	0.28
389	0.28
390	0.23
391	0.22
392	0.21
393	0.19
394	0.16
395	0.14
396	0.1
397	0.07
398	0.08
399	0.08
400	0.1
401	0.1
402	0.11
403	0.13
404	0.16
405	0.16
406	0.15
407	0.16
408	0.18
409	0.26
410	0.3
411	0.33
412	0.37
413	0.4
414	0.43
415	0.47
416	0.44
417	0.41
418	0.44
419	0.47
420	0.49
421	0.49
422	0.46
423	0.5
424	0.59
425	0.63
426	0.64
427	0.64
428	0.64
429	0.63
430	0.63
431	0.59
432	0.54
433	0.49
434	0.43
435	0.36
436	0.29
437	0.3
438	0.27
439	0.24
440	0.2
441	0.15
442	0.14
443	0.13
444	0.13
445	0.11
446	0.1
447	0.11
448	0.1
449	0.11
450	0.11
451	0.11
452	0.11
453	0.12
454	0.12
455	0.17
456	0.19
457	0.19
458	0.2
459	0.22
460	0.23
461	0.3
462	0.34
463	0.32
464	0.33
465	0.33
466	0.33
467	0.35
468	0.36
469	0.3
470	0.27
471	0.29
472	0.31
473	0.32
474	0.31
475	0.25
476	0.23
477	0.23
478	0.23
479	0.19
480	0.13
481	0.12
482	0.13
483	0.14
484	0.13
485	0.11
486	0.11
487	0.12
488	0.17
489	0.19
490	0.22
491	0.24
492	0.26
493	0.34
494	0.39
495	0.39
496	0.34
497	0.34
498	0.35
499	0.37
500	0.44
501	0.45
502	0.48
503	0.56
504	0.64
505	0.67
506	0.7
507	0.76
508	0.75
509	0.77
510	0.73
511	0.7
512	0.63
513	0.59
514	0.51
515	0.42
516	0.39
517	0.31
518	0.26
519	0.24
520	0.25
521	0.28
522	0.38
523	0.49
524	0.51
525	0.57
526	0.68
527	0.75
528	0.82
529	0.9
530	0.9
531	0.89
532	0.89
533	0.91
534	0.9
535	0.83
536	0.74
537	0.65
538	0.55
539	0.45
540	0.42
541	0.38
542	0.31
543	0.31
544	0.29
545	0.28
546	0.29
547	0.28
548	0.23
549	0.18
550	0.14
551	0.13
552	0.13
553	0.12
554	0.11
555	0.12
556	0.12
557	0.16
558	0.21
559	0.28
560	0.32
561	0.38
562	0.47
563	0.56
564	0.67
565	0.73
566	0.79
567	0.82
568	0.87
569	0.93
570	0.92
571	0.92
572	0.85
573	0.78
574	0.73
575	0.66
576	0.58
577	0.48
578	0.39
579	0.31
580	0.28
581	0.22
582	0.16
583	0.13
584	0.13
585	0.13
586	0.12
587	0.13
588	0.15
589	0.15
590	0.16
591	0.21
592	0.19
593	0.2
594	0.2
595	0.2
596	0.21
597	0.21
598	0.22
599	0.17
600	0.15
601	0.2
602	0.26
603	0.25
604	0.22
605	0.26
606	0.26
607	0.27
608	0.29
609	0.28
610	0.28
611	0.31
612	0.34
613	0.33
614	0.35
615	0.35
616	0.36
617	0.37
618	0.33
619	0.31
620	0.3
621	0.26
622	0.23
623	0.28
624	0.29
625	0.23
626	0.23
627	0.23
628	0.22
629	0.23
630	0.25
631	0.2
632	0.19
633	0.19
634	0.24
635	0.31
636	0.33
637	0.41
638	0.47
639	0.55
640	0.59
641	0.67
642	0.63
643	0.56
644	0.55
645	0.49
646	0.44
647	0.36
648	0.35
649	0.26
650	0.26
651	0.25
652	0.24
653	0.27
654	0.3
655	0.31
656	0.28
657	0.31
658	0.31
659	0.33
660	0.33
661	0.33
662	0.34
663	0.36
664	0.4
665	0.41
666	0.48
667	0.47
668	0.47
669	0.45
670	0.44
671	0.45
672	0.4
673	0.36
674	0.31
675	0.31
676	0.29
677	0.27
678	0.22
679	0.16
680	0.16
681	0.18

A0A399GFU7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer