Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A399HT46

Protein Details
Accession A0A399HT46    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
215-248TSSSQTTSKKQKKETKAKKSKTKKAGKKATQSAEHydrophilic
269-297PEIDTPQPKKRGRPPKKDKKAAAAPKANNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
223-242KKQKKETKAKKSKTKKAGKK
276-294PKKRGRPPKKDKKAAAAPK
374-394KQKKGKTGGRGGKRGGKGRGK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 10.666, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011082  Exosome-assoc_fac/DNA_repair  
IPR007146  Sas10/Utp3/C1D  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04000  Sas10_Utp3  
Amino Acid Sequences MDPQTDLPDLVEDLEVNIDELTTALEPLLATPLHTTASSLPLLDKAEFYCMSAYAVEAILFSVLKASGVNAMEHDVFKEIARLKQYNSKIKDIKDRGIMGSAEGRARLDVGAAQRFIKHGLAGNDKYDLERQERIAKEKARAHLKAQKINKKFDDEGKEMEYKDATPKKRAVGEVDDQQEYSDDEVMEGLEEAEPATKKARVTSADGTEIDSEATSSSQTTSKKQKKETKAKKSKTKKAGKKATQSAESTEADADNKEDDSKSQAEPSPEIDTPQPKKRGRPPKKDKKAAAAPKANNKQDSDTIDVVATPTQQDTDVEATPSRAEERVTRRRNTRLSTQNLLQDEESVVPTPDDAPKTRSETFTALLDGSLSEKQKKGKTGGRGGKRGGKGRGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.09
4 0.08
5 0.07
6 0.06
7 0.06
8 0.07
9 0.06
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.07
15 0.1
16 0.08
17 0.09
18 0.1
19 0.11
20 0.12
21 0.12
22 0.13
23 0.12
24 0.16
25 0.16
26 0.15
27 0.14
28 0.16
29 0.19
30 0.18
31 0.17
32 0.14
33 0.19
34 0.18
35 0.19
36 0.17
37 0.15
38 0.15
39 0.14
40 0.13
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.05
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.1
55 0.11
56 0.12
57 0.11
58 0.14
59 0.15
60 0.15
61 0.15
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.17
66 0.17
67 0.19
68 0.26
69 0.27
70 0.28
71 0.37
72 0.45
73 0.49
74 0.51
75 0.56
76 0.55
77 0.58
78 0.66
79 0.63
80 0.6
81 0.57
82 0.54
83 0.46
84 0.44
85 0.39
86 0.3
87 0.28
88 0.25
89 0.19
90 0.17
91 0.16
92 0.12
93 0.13
94 0.11
95 0.08
96 0.09
97 0.12
98 0.15
99 0.16
100 0.16
101 0.16
102 0.17
103 0.18
104 0.16
105 0.13
106 0.14
107 0.18
108 0.25
109 0.25
110 0.26
111 0.26
112 0.26
113 0.26
114 0.25
115 0.23
116 0.19
117 0.2
118 0.22
119 0.28
120 0.3
121 0.33
122 0.38
123 0.38
124 0.42
125 0.45
126 0.5
127 0.5
128 0.5
129 0.51
130 0.52
131 0.55
132 0.55
133 0.59
134 0.61
135 0.59
136 0.64
137 0.61
138 0.59
139 0.55
140 0.54
141 0.53
142 0.46
143 0.43
144 0.39
145 0.38
146 0.33
147 0.31
148 0.24
149 0.18
150 0.23
151 0.28
152 0.26
153 0.29
154 0.31
155 0.34
156 0.37
157 0.38
158 0.33
159 0.31
160 0.33
161 0.34
162 0.34
163 0.31
164 0.27
165 0.26
166 0.22
167 0.17
168 0.14
169 0.09
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.09
185 0.09
186 0.11
187 0.14
188 0.15
189 0.2
190 0.23
191 0.24
192 0.25
193 0.25
194 0.24
195 0.21
196 0.19
197 0.14
198 0.1
199 0.08
200 0.05
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.09
206 0.11
207 0.16
208 0.26
209 0.34
210 0.41
211 0.5
212 0.59
213 0.66
214 0.76
215 0.82
216 0.83
217 0.86
218 0.89
219 0.9
220 0.91
221 0.9
222 0.89
223 0.89
224 0.87
225 0.87
226 0.89
227 0.87
228 0.86
229 0.84
230 0.79
231 0.73
232 0.65
233 0.57
234 0.51
235 0.43
236 0.34
237 0.26
238 0.2
239 0.16
240 0.15
241 0.12
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.12
248 0.14
249 0.14
250 0.17
251 0.2
252 0.21
253 0.22
254 0.24
255 0.25
256 0.22
257 0.23
258 0.23
259 0.29
260 0.33
261 0.4
262 0.47
263 0.45
264 0.53
265 0.62
266 0.7
267 0.72
268 0.78
269 0.81
270 0.83
271 0.91
272 0.93
273 0.88
274 0.86
275 0.86
276 0.84
277 0.83
278 0.8
279 0.75
280 0.75
281 0.8
282 0.74
283 0.67
284 0.59
285 0.53
286 0.49
287 0.48
288 0.43
289 0.35
290 0.31
291 0.27
292 0.25
293 0.22
294 0.17
295 0.14
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.11
302 0.14
303 0.14
304 0.15
305 0.15
306 0.16
307 0.16
308 0.16
309 0.15
310 0.13
311 0.13
312 0.2
313 0.29
314 0.39
315 0.46
316 0.53
317 0.58
318 0.66
319 0.73
320 0.71
321 0.71
322 0.7
323 0.7
324 0.7
325 0.67
326 0.64
327 0.58
328 0.55
329 0.45
330 0.36
331 0.3
332 0.25
333 0.22
334 0.16
335 0.15
336 0.12
337 0.12
338 0.13
339 0.17
340 0.2
341 0.21
342 0.23
343 0.28
344 0.35
345 0.38
346 0.38
347 0.37
348 0.36
349 0.36
350 0.34
351 0.31
352 0.25
353 0.21
354 0.19
355 0.15
356 0.14
357 0.17
358 0.18
359 0.21
360 0.25
361 0.32
362 0.38
363 0.44
364 0.5
365 0.53
366 0.59
367 0.65
368 0.72
369 0.75
370 0.76
371 0.76
372 0.77
373 0.77
374 0.75