Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A399GDD7

Protein Details
Accession A0A399GDD7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21SDSEWNRRKRELRYLQDPLEHydrophilic
583-622QGDRGEARPSWKKEWKRPLKRPSRPARPAKPFERRKGYTSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
589-618ARPSWKKEWKRPLKRPSRPARPAKPFERRK
Subcellular Location(s) nucl 11, pero 8, cyto 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MSDSEWNRRKRELRYLQDPLELATFVRNELKKDKAEEMLQLVRMASHSMQCIVSWNHIIDHYLAKERVNDAIKVYNDMKKRAQFPDSYTYTILLRGLSWNAHTSGVLSKALSIYHSLSAPNSRVEPSIMHTNAALKVCARAGDMDALWGVAGKIPENGPAAANAITYITILNAIRQSLLVDAPKGESEDETAARRERGIMEGRRMWEDIIGRWRRADLAIDEELVCAMGRLLLIGSRPRDWDDVLSLVEQTMDIPRLVPRLGSVERQGAGLPHVRAPNVPEQYRIDDDHLSPDNVPARGDEFLALTPQGVGSAVSSPLIYVRPGNNTLSLVQEACQKVVANKAAQEYWDLLTDPTTYKITPDLNNLNMRLRNLRQNRASSAAVQVLQQDMMNRAIRPPPGTFRIAMSTCVRDKNNHNSLKNGGQILGMMSKTLEDADPKTVTMYAGLVISFPLAKGSDFIDALTLLNPLVKNIRLQVGVGAGQTKYAGRRGPQYLKGEARQDAIDALKKVHGVYDKLLFSNLIAEELKSPFEKERARLSAFIQRVMFKGGQTNAEDQEADLHGYLRKEDSQADDRMEPDEVRQGDRGEARPSWKKEWKRPLKRPSRPARPAKPFERRKGYTSPAVDKSGDLRDM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.81
3 0.75
4 0.72
5 0.64
6 0.54
7 0.45
8 0.36
9 0.26
10 0.22
11 0.19
12 0.16
13 0.24
14 0.24
15 0.27
16 0.32
17 0.38
18 0.39
19 0.43
20 0.46
21 0.44
22 0.45
23 0.44
24 0.45
25 0.43
26 0.39
27 0.35
28 0.31
29 0.25
30 0.23
31 0.22
32 0.17
33 0.16
34 0.16
35 0.17
36 0.18
37 0.17
38 0.22
39 0.21
40 0.24
41 0.24
42 0.23
43 0.22
44 0.22
45 0.24
46 0.2
47 0.23
48 0.22
49 0.26
50 0.26
51 0.26
52 0.28
53 0.28
54 0.34
55 0.32
56 0.3
57 0.26
58 0.32
59 0.31
60 0.34
61 0.36
62 0.35
63 0.36
64 0.41
65 0.45
66 0.45
67 0.5
68 0.51
69 0.53
70 0.5
71 0.52
72 0.56
73 0.53
74 0.49
75 0.44
76 0.39
77 0.34
78 0.31
79 0.26
80 0.17
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.15
86 0.16
87 0.16
88 0.17
89 0.16
90 0.15
91 0.16
92 0.18
93 0.17
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.13
101 0.13
102 0.14
103 0.14
104 0.15
105 0.19
106 0.2
107 0.2
108 0.19
109 0.19
110 0.19
111 0.2
112 0.19
113 0.2
114 0.27
115 0.26
116 0.24
117 0.23
118 0.25
119 0.28
120 0.28
121 0.24
122 0.14
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.14
127 0.11
128 0.11
129 0.13
130 0.13
131 0.12
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.08
141 0.08
142 0.12
143 0.13
144 0.14
145 0.12
146 0.12
147 0.14
148 0.12
149 0.12
150 0.09
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.04
156 0.06
157 0.06
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.09
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.09
174 0.1
175 0.12
176 0.13
177 0.14
178 0.16
179 0.17
180 0.17
181 0.17
182 0.16
183 0.15
184 0.18
185 0.24
186 0.26
187 0.3
188 0.34
189 0.35
190 0.36
191 0.35
192 0.3
193 0.25
194 0.22
195 0.2
196 0.26
197 0.28
198 0.27
199 0.26
200 0.27
201 0.25
202 0.24
203 0.23
204 0.15
205 0.16
206 0.17
207 0.17
208 0.17
209 0.16
210 0.15
211 0.12
212 0.1
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.04
220 0.06
221 0.09
222 0.11
223 0.12
224 0.14
225 0.16
226 0.17
227 0.17
228 0.17
229 0.15
230 0.15
231 0.14
232 0.13
233 0.11
234 0.1
235 0.09
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.12
248 0.14
249 0.15
250 0.17
251 0.18
252 0.18
253 0.18
254 0.18
255 0.13
256 0.13
257 0.15
258 0.14
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.15
263 0.18
264 0.24
265 0.25
266 0.25
267 0.24
268 0.25
269 0.28
270 0.3
271 0.28
272 0.23
273 0.2
274 0.19
275 0.21
276 0.2
277 0.18
278 0.16
279 0.17
280 0.17
281 0.16
282 0.16
283 0.11
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.09
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.05
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.04
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.11
310 0.13
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.13
317 0.1
318 0.09
319 0.14
320 0.13
321 0.13
322 0.13
323 0.12
324 0.12
325 0.16
326 0.18
327 0.13
328 0.15
329 0.16
330 0.15
331 0.15
332 0.16
333 0.13
334 0.11
335 0.11
336 0.1
337 0.08
338 0.09
339 0.1
340 0.09
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.09
345 0.12
346 0.15
347 0.15
348 0.2
349 0.21
350 0.24
351 0.27
352 0.28
353 0.29
354 0.27
355 0.27
356 0.26
357 0.25
358 0.31
359 0.34
360 0.4
361 0.42
362 0.44
363 0.45
364 0.45
365 0.43
366 0.35
367 0.31
368 0.26
369 0.21
370 0.18
371 0.16
372 0.12
373 0.12
374 0.11
375 0.09
376 0.09
377 0.12
378 0.13
379 0.12
380 0.14
381 0.17
382 0.18
383 0.2
384 0.2
385 0.22
386 0.24
387 0.26
388 0.25
389 0.23
390 0.27
391 0.25
392 0.26
393 0.24
394 0.24
395 0.24
396 0.29
397 0.28
398 0.27
399 0.32
400 0.4
401 0.47
402 0.5
403 0.49
404 0.47
405 0.5
406 0.49
407 0.47
408 0.37
409 0.28
410 0.2
411 0.19
412 0.17
413 0.16
414 0.11
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.09
423 0.13
424 0.13
425 0.13
426 0.14
427 0.14
428 0.13
429 0.12
430 0.1
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.06
435 0.05
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.06
443 0.07
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.08
452 0.06
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.11
457 0.11
458 0.12
459 0.14
460 0.17
461 0.16
462 0.16
463 0.16
464 0.15
465 0.15
466 0.14
467 0.14
468 0.1
469 0.1
470 0.11
471 0.11
472 0.11
473 0.14
474 0.16
475 0.17
476 0.24
477 0.32
478 0.39
479 0.45
480 0.48
481 0.52
482 0.54
483 0.56
484 0.54
485 0.48
486 0.43
487 0.35
488 0.31
489 0.25
490 0.23
491 0.23
492 0.19
493 0.19
494 0.18
495 0.19
496 0.18
497 0.2
498 0.21
499 0.19
500 0.22
501 0.27
502 0.27
503 0.26
504 0.27
505 0.23
506 0.19
507 0.21
508 0.18
509 0.14
510 0.12
511 0.13
512 0.15
513 0.16
514 0.18
515 0.14
516 0.16
517 0.17
518 0.24
519 0.28
520 0.29
521 0.37
522 0.42
523 0.44
524 0.44
525 0.45
526 0.47
527 0.43
528 0.44
529 0.37
530 0.32
531 0.31
532 0.33
533 0.31
534 0.22
535 0.27
536 0.25
537 0.27
538 0.28
539 0.31
540 0.27
541 0.28
542 0.27
543 0.21
544 0.22
545 0.19
546 0.17
547 0.14
548 0.13
549 0.14
550 0.15
551 0.17
552 0.16
553 0.17
554 0.18
555 0.2
556 0.26
557 0.29
558 0.32
559 0.35
560 0.34
561 0.33
562 0.33
563 0.32
564 0.25
565 0.21
566 0.25
567 0.23
568 0.24
569 0.26
570 0.25
571 0.28
572 0.33
573 0.35
574 0.32
575 0.34
576 0.4
577 0.47
578 0.52
579 0.56
580 0.6
581 0.67
582 0.72
583 0.8
584 0.84
585 0.85
586 0.9
587 0.92
588 0.93
589 0.94
590 0.94
591 0.94
592 0.94
593 0.93
594 0.93
595 0.93
596 0.92
597 0.91
598 0.91
599 0.91
600 0.9
601 0.9
602 0.9
603 0.83
604 0.78
605 0.77
606 0.74
607 0.72
608 0.69
609 0.67
610 0.62
611 0.62
612 0.56
613 0.49
614 0.47