FuNGI

A0A3A2ZFD4

Protein Details

Accession

A0A3A2ZFD4

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-43	APPMRIRRPKPADPLVRPKRKLG	Basic
137-156	SQFTRPVRLQRRDPRAKSHE	Hydrophilic
522-544	GTDTSRKKAKSKHPSSQSTPQPN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
24-45	MRIRRPKPADPLVRPKRKLGSR
416-435	REREAQRVLGKRVRKALQKR
499-513	PLKKGPTAAPRKRPG
527-532	RKKAKS

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSSTSVNDLNTAQSSTGPNGAPPMRIRRPKPADPLVRPKRKLGSRPGVSTPSGTGAISKPSPAQPTTSATLSRSRLENPHQTFAKDDVAVNGFSGPLVSDTYTDYPLVTTKRALRDGLKHHIARFASKKNIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRAKSHETNDERNQGMLKAASESSQMDEADREDLAARRAAREKERAENLAQIAPSVGSAPKRANVSKHKTQQVSKTDLTPEEIAKTKIKYEEALPWHVEDFDNKNVWVGNYEAALSETHAVFVLENTGKMRMIPVEKWYKFTAKSQFKPLSIEEAERFMAKKIKDPRWFMEKQQELAQQKELENFVKQRRVYAGKQGTPAGADGLEADEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEEAKVAEKRIKQDQLKANVFDLKDEKEYEEEELREKREREAQRVLGKRVRKALQKREKNYDYSSGSDVNPYSDDESTDESEAEAQREEERKAEEEKNRKESASSTKDYGTPSGRSKHTDPLKKGPTAAPRKRPGSPNISDASGTDTSRKKAKSKHPSSQSTPQPNSRPMSPTPSSSIQPGKKRVRNIRAGGTGPGSDIDTGAGSGGEVSESGKVKKLKLNPPGISSPGGTPQGSRAGSPMPQGGRGLSGSRASSPEQSSSMRGQAQASPGSHNFPTPAEIHAAIPPSGILSSDLLKIFRPRIGDSRENHRRFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGTLKDG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.2
3	0.23
4	0.21
5	0.19
6	0.25
7	0.26
8	0.28
9	0.31
10	0.39
11	0.44
12	0.53
13	0.58
14	0.62
15	0.69
16	0.74
17	0.78
18	0.78
19	0.79
20	0.79
21	0.86
22	0.85
23	0.87
24	0.81
25	0.78
26	0.78
27	0.76
28	0.76
29	0.75
30	0.75
31	0.73
32	0.76
33	0.75
34	0.7
35	0.62
36	0.55
37	0.46
38	0.38
39	0.31
40	0.25
41	0.21
42	0.18
43	0.23
44	0.22
45	0.22
46	0.22
47	0.25
48	0.3
49	0.29
50	0.31
51	0.29
52	0.34
53	0.36
54	0.35
55	0.33
56	0.3
57	0.36
58	0.35
59	0.35
60	0.33
61	0.33
62	0.37
63	0.43
64	0.51
65	0.49
66	0.55
67	0.53
68	0.52
69	0.5
70	0.47
71	0.44
72	0.35
73	0.3
74	0.25
75	0.25
76	0.24
77	0.21
78	0.18
79	0.13
80	0.11
81	0.11
82	0.07
83	0.06
84	0.07
85	0.07
86	0.08
87	0.12
88	0.14
89	0.15
90	0.15
91	0.14
92	0.14
93	0.17
94	0.19
95	0.17
96	0.2
97	0.25
98	0.31
99	0.34
100	0.36
101	0.38
102	0.44
103	0.5
104	0.54
105	0.57
106	0.53
107	0.51
108	0.54
109	0.49
110	0.49
111	0.49
112	0.47
113	0.47
114	0.48
115	0.54
116	0.58
117	0.65
118	0.61
119	0.6
120	0.57
121	0.58
122	0.58
123	0.54
124	0.5
125	0.49
126	0.46
127	0.46
128	0.45
129	0.45
130	0.52
131	0.57
132	0.62
133	0.65
134	0.75
135	0.79
136	0.8
137	0.8
138	0.78
139	0.79
140	0.74
141	0.71
142	0.71
143	0.66
144	0.7
145	0.66
146	0.64
147	0.56
148	0.51
149	0.45
150	0.35
151	0.3
152	0.23
153	0.17
154	0.13
155	0.13
156	0.12
157	0.13
158	0.13
159	0.13
160	0.14
161	0.14
162	0.12
163	0.12
164	0.12
165	0.12
166	0.11
167	0.1
168	0.09
169	0.11
170	0.12
171	0.15
172	0.14
173	0.17
174	0.23
175	0.28
176	0.32
177	0.38
178	0.41
179	0.45
180	0.49
181	0.48
182	0.44
183	0.44
184	0.4
185	0.35
186	0.3
187	0.22
188	0.18
189	0.15
190	0.13
191	0.1
192	0.1
193	0.08
194	0.11
195	0.12
196	0.15
197	0.2
198	0.22
199	0.28
200	0.37
201	0.44
202	0.52
203	0.59
204	0.63
205	0.65
206	0.67
207	0.69
208	0.66
209	0.64
210	0.56
211	0.51
212	0.46
213	0.41
214	0.39
215	0.32
216	0.26
217	0.21
218	0.22
219	0.21
220	0.21
221	0.21
222	0.21
223	0.22
224	0.23
225	0.21
226	0.21
227	0.27
228	0.28
229	0.31
230	0.29
231	0.26
232	0.26
233	0.25
234	0.23
235	0.18
236	0.18
237	0.18
238	0.19
239	0.18
240	0.18
241	0.18
242	0.18
243	0.16
244	0.13
245	0.09
246	0.08
247	0.09
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.07
252	0.08
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.06
258	0.06
259	0.09
260	0.08
261	0.09
262	0.09
263	0.1
264	0.1
265	0.1
266	0.11
267	0.1
268	0.12
269	0.13
270	0.19
271	0.28
272	0.29
273	0.32
274	0.33
275	0.34
276	0.33
277	0.38
278	0.42
279	0.41
280	0.43
281	0.49
282	0.51
283	0.49
284	0.5
285	0.45
286	0.41
287	0.33
288	0.32
289	0.24
290	0.22
291	0.21
292	0.18
293	0.18
294	0.13
295	0.17
296	0.15
297	0.21
298	0.28
299	0.37
300	0.44
301	0.48
302	0.5
303	0.54
304	0.56
305	0.52
306	0.53
307	0.46
308	0.41
309	0.42
310	0.44
311	0.37
312	0.37
313	0.37
314	0.29
315	0.27
316	0.27
317	0.24
318	0.18
319	0.19
320	0.22
321	0.23
322	0.27
323	0.26
324	0.25
325	0.28
326	0.33
327	0.32
328	0.37
329	0.4
330	0.36
331	0.38
332	0.37
333	0.33
334	0.28
335	0.26
336	0.17
337	0.1
338	0.07
339	0.05
340	0.05
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.03
345	0.03
346	0.04
347	0.04
348	0.03
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.07
357	0.09
358	0.09
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.06
365	0.05
366	0.04
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.06
371	0.08
372	0.11
373	0.14
374	0.17
375	0.24
376	0.31
377	0.32
378	0.4
379	0.46
380	0.51
381	0.52
382	0.5
383	0.44
384	0.4
385	0.38
386	0.32
387	0.26
388	0.19
389	0.17
390	0.17
391	0.17
392	0.14
393	0.15
394	0.15
395	0.16
396	0.14
397	0.16
398	0.18
399	0.2
400	0.24
401	0.24
402	0.24
403	0.3
404	0.33
405	0.36
406	0.4
407	0.44
408	0.48
409	0.52
410	0.55
411	0.51
412	0.52
413	0.49
414	0.49
415	0.48
416	0.49
417	0.53
418	0.59
419	0.64
420	0.7
421	0.73
422	0.75
423	0.74
424	0.69
425	0.63
426	0.59
427	0.51
428	0.43
429	0.4
430	0.32
431	0.28
432	0.26
433	0.23
434	0.17
435	0.15
436	0.13
437	0.13
438	0.11
439	0.11
440	0.11
441	0.13
442	0.14
443	0.14
444	0.13
445	0.11
446	0.13
447	0.13
448	0.12
449	0.1
450	0.09
451	0.13
452	0.16
453	0.16
454	0.16
455	0.17
456	0.19
457	0.24
458	0.3
459	0.34
460	0.42
461	0.48
462	0.53
463	0.53
464	0.51
465	0.46
466	0.44
467	0.46
468	0.43
469	0.38
470	0.34
471	0.33
472	0.36
473	0.36
474	0.35
475	0.29
476	0.26
477	0.28
478	0.32
479	0.33
480	0.35
481	0.37
482	0.42
483	0.48
484	0.52
485	0.53
486	0.57
487	0.61
488	0.57
489	0.57
490	0.54
491	0.55
492	0.57
493	0.6
494	0.6
495	0.62
496	0.65
497	0.68
498	0.68
499	0.65
500	0.63
501	0.57
502	0.53
503	0.47
504	0.44
505	0.38
506	0.32
507	0.31
508	0.24
509	0.22
510	0.22
511	0.23
512	0.24
513	0.31
514	0.34
515	0.34
516	0.42
517	0.52
518	0.58
519	0.65
520	0.72
521	0.76
522	0.8
523	0.81
524	0.82
525	0.81
526	0.79
527	0.75
528	0.72
529	0.68
530	0.66
531	0.62
532	0.56
533	0.51
534	0.43
535	0.46
536	0.41
537	0.38
538	0.38
539	0.38
540	0.35
541	0.36
542	0.42
543	0.41
544	0.47
545	0.54
546	0.58
547	0.6
548	0.69
549	0.75
550	0.75
551	0.78
552	0.75
553	0.73
554	0.68
555	0.65
556	0.57
557	0.49
558	0.39
559	0.3
560	0.25
561	0.18
562	0.12
563	0.11
564	0.09
565	0.07
566	0.06
567	0.06
568	0.05
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.03
574	0.04
575	0.08
576	0.1
577	0.11
578	0.18
579	0.2
580	0.24
581	0.31
582	0.4
583	0.45
584	0.53
585	0.62
586	0.59
587	0.62
588	0.62
589	0.58
590	0.51
591	0.43
592	0.35
593	0.31
594	0.31
595	0.25
596	0.22
597	0.22
598	0.28
599	0.26
600	0.25
601	0.21
602	0.21
603	0.23
604	0.25
605	0.27
606	0.22
607	0.23
608	0.24
609	0.22
610	0.21
611	0.21
612	0.2
613	0.17
614	0.19
615	0.18
616	0.19
617	0.21
618	0.22
619	0.26
620	0.27
621	0.27
622	0.28
623	0.28
624	0.3
625	0.31
626	0.33
627	0.3
628	0.29
629	0.28
630	0.29
631	0.31
632	0.32
633	0.3
634	0.31
635	0.3
636	0.33
637	0.31
638	0.29
639	0.26
640	0.22
641	0.24
642	0.19
643	0.19
644	0.19
645	0.19
646	0.2
647	0.21
648	0.22
649	0.19
650	0.18
651	0.16
652	0.13
653	0.12
654	0.11
655	0.1
656	0.09
657	0.11
658	0.15
659	0.16
660	0.16
661	0.19
662	0.23
663	0.25
664	0.26
665	0.28
666	0.29
667	0.36
668	0.43
669	0.49
670	0.48
671	0.56
672	0.65
673	0.64
674	0.62
675	0.55
676	0.48
677	0.42
678	0.46
679	0.42
680	0.36
681	0.35
682	0.34
683	0.34
684	0.33
685	0.32
686	0.25
687	0.19
688	0.17
689	0.18
690	0.21
691	0.22
692	0.23
693	0.29
694	0.31
695	0.3
696	0.34

A0A3A2ZFD4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer