Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1DXS9

Protein Details
Accession A0A0D1DXS9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-45LHNNHFRKDWQRRVKVWFDQPGAKKRRRTAREAKAAKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-46GAKKRRRTAREAKAAKL
181-209RKARGTHRAAGKVKARIAKKEEEAANAKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001380  Ribosomal_L13e  
Gene Ontology GO:0022625  C:cytosolic large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG uma:UMAG_02924  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01294  Ribosomal_L13e  
Amino Acid Sequences MAVKHNNILHNNHFRKDWQRRVKVWFDQPGAKKRRRTAREAKAAKLGLRPVQLLRPAVRCPTLRYNTKIRSGRGFTIEEVKAAGLGKKYARSVGIPVDHRRRNKSEESLKLNVERIKAYQARLVVIPKLTKKNKDKKVDLSNVEAVRQVQSVLPLPAGTEAEKPRAITSEEKEFNAYETLRKARGTHRAAGKVKARIAKKEEEAANAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.56
3 0.61
4 0.63
5 0.63
6 0.68
7 0.71
8 0.77
9 0.81
10 0.79
11 0.77
12 0.75
13 0.68
14 0.68
15 0.69
16 0.72
17 0.72
18 0.7
19 0.69
20 0.69
21 0.75
22 0.72
23 0.74
24 0.75
25 0.77
26 0.8
27 0.78
28 0.73
29 0.69
30 0.66
31 0.58
32 0.51
33 0.44
34 0.38
35 0.34
36 0.33
37 0.27
38 0.29
39 0.3
40 0.29
41 0.29
42 0.28
43 0.28
44 0.29
45 0.32
46 0.29
47 0.31
48 0.38
49 0.41
50 0.43
51 0.46
52 0.52
53 0.53
54 0.61
55 0.6
56 0.53
57 0.53
58 0.52
59 0.5
60 0.45
61 0.41
62 0.33
63 0.34
64 0.32
65 0.25
66 0.21
67 0.17
68 0.14
69 0.13
70 0.13
71 0.07
72 0.09
73 0.1
74 0.12
75 0.13
76 0.13
77 0.14
78 0.13
79 0.14
80 0.16
81 0.2
82 0.22
83 0.27
84 0.35
85 0.39
86 0.42
87 0.45
88 0.45
89 0.45
90 0.46
91 0.49
92 0.48
93 0.5
94 0.54
95 0.51
96 0.49
97 0.45
98 0.43
99 0.37
100 0.3
101 0.24
102 0.18
103 0.21
104 0.22
105 0.21
106 0.2
107 0.19
108 0.19
109 0.19
110 0.2
111 0.15
112 0.15
113 0.18
114 0.2
115 0.28
116 0.32
117 0.4
118 0.48
119 0.57
120 0.65
121 0.71
122 0.72
123 0.72
124 0.78
125 0.77
126 0.7
127 0.65
128 0.62
129 0.53
130 0.47
131 0.39
132 0.3
133 0.23
134 0.2
135 0.15
136 0.09
137 0.11
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.14
147 0.15
148 0.19
149 0.2
150 0.21
151 0.2
152 0.22
153 0.23
154 0.24
155 0.26
156 0.32
157 0.33
158 0.34
159 0.35
160 0.33
161 0.32
162 0.3
163 0.26
164 0.19
165 0.23
166 0.26
167 0.26
168 0.28
169 0.29
170 0.33
171 0.42
172 0.44
173 0.46
174 0.5
175 0.58
176 0.6
177 0.65
178 0.65
179 0.61
180 0.62
181 0.62
182 0.58
183 0.57
184 0.59
185 0.59
186 0.56
187 0.58
188 0.55
189 0.55