Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B8NJ07

Protein Details
Accession B8NJ07    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-252PETPSKTKEPKAEKEKKSKSSKSKKKEKKEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-252KTKEPKAEKEKKSKSSKSKKKEKKEK
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 8.833, mito 8.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MKHYPGEYGVLYVYLTATFLVFRPQRGQILEGWVNVQSEGFLGAVVLNLFSVGIERKRLPSNWKWVPPGEEGSVSGDQQKTATTSEDDESEPSASFDQEKEHFNPVSLANPVSDTLNEEANAEDDESAAEGYFQSVSGHRVRGTVRFRVVDVDVIPGSERDRSFLSIEGTMLSPEEEARVLEDERNGILTTSATPRRGRSQEPRVSMSGALAAPSVAAIPEPETPSKTKEPKAEKEKKSKSSKSKKKEKKEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.06
4 0.06
5 0.06
6 0.06
7 0.15
8 0.16
9 0.19
10 0.23
11 0.27
12 0.31
13 0.32
14 0.33
15 0.27
16 0.34
17 0.34
18 0.3
19 0.28
20 0.25
21 0.23
22 0.22
23 0.19
24 0.1
25 0.08
26 0.08
27 0.07
28 0.05
29 0.04
30 0.04
31 0.05
32 0.05
33 0.05
34 0.04
35 0.04
36 0.04
37 0.03
38 0.05
39 0.07
40 0.09
41 0.13
42 0.14
43 0.19
44 0.23
45 0.27
46 0.33
47 0.38
48 0.47
49 0.52
50 0.56
51 0.56
52 0.54
53 0.55
54 0.51
55 0.47
56 0.38
57 0.3
58 0.25
59 0.25
60 0.24
61 0.2
62 0.2
63 0.17
64 0.15
65 0.14
66 0.14
67 0.11
68 0.11
69 0.13
70 0.1
71 0.12
72 0.13
73 0.14
74 0.14
75 0.13
76 0.14
77 0.13
78 0.12
79 0.1
80 0.1
81 0.08
82 0.09
83 0.08
84 0.11
85 0.12
86 0.15
87 0.17
88 0.21
89 0.2
90 0.2
91 0.21
92 0.19
93 0.18
94 0.16
95 0.14
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.04
122 0.05
123 0.08
124 0.09
125 0.11
126 0.11
127 0.13
128 0.14
129 0.21
130 0.24
131 0.26
132 0.27
133 0.27
134 0.27
135 0.27
136 0.27
137 0.21
138 0.17
139 0.15
140 0.12
141 0.11
142 0.11
143 0.09
144 0.1
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.14
150 0.15
151 0.16
152 0.17
153 0.14
154 0.14
155 0.13
156 0.12
157 0.1
158 0.09
159 0.08
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.12
173 0.11
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.1
178 0.15
179 0.19
180 0.22
181 0.24
182 0.27
183 0.36
184 0.39
185 0.45
186 0.49
187 0.55
188 0.6
189 0.63
190 0.64
191 0.57
192 0.55
193 0.47
194 0.37
195 0.3
196 0.22
197 0.17
198 0.12
199 0.1
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.06
207 0.1
208 0.13
209 0.15
210 0.18
211 0.21
212 0.27
213 0.36
214 0.41
215 0.44
216 0.5
217 0.58
218 0.65
219 0.75
220 0.79
221 0.8
222 0.84
223 0.87
224 0.88
225 0.89
226 0.89
227 0.89
228 0.9
229 0.91
230 0.91
231 0.92
232 0.93