Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3A3A8V4

Protein Details
Accession A0A3A3A8V4    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-170GGEERPRRKKEGRREKKSRRIKDLEEGPERTQKRERKKREATPEDEEBasic
186-207MDEALKKPTKRRARKQDGIDLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-163GRHKRKRDEEGGEERPRRKKEGRREKKSRRIKDLEEGPERTQKRERKKRE
190-200LKKPTKRRARK
430-445RKMKARQIAATKAGRK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSASPEHQPGSPAAPPSDHEDSKPTAAETVEEPQAEEPSAAEDYDEEPAAETGPAEDAAEAEAENPEAGGHVSDDESILSEVDEAQFEDFDPTTVDVEDRAPLAIDEDNLKLIGRHKRKRDEEGGEERPRRKKEGRREKKSRRIKDLEEGPERTQKRERKKREATPEDEELLDPATRRRRALDRVMDEALKKPTKRRARKQDGIDLEQMADAEIEDMRKRMTHAAQMDAINRREGRPAMHKLKMLPEVVSLLNRNQYVNSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLMTALAKLPINKEALIASGIGKVIVFYTKIKRAEPGIKRMAERLLAEWTRPILQRTDDYSKRVYEEVEYDPRKLPARMPSVAASAAEVRARELLPPRLANRARPETVHKSYTVVPRPMVVEESKYARPLGASGEDRFRKMKARQIAATKAGRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.32
4 0.38
5 0.34
6 0.32
7 0.33
8 0.35
9 0.37
10 0.37
11 0.3
12 0.24
13 0.23
14 0.23
15 0.21
16 0.22
17 0.22
18 0.2
19 0.21
20 0.2
21 0.21
22 0.2
23 0.17
24 0.12
25 0.12
26 0.13
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.13
32 0.13
33 0.1
34 0.1
35 0.11
36 0.11
37 0.1
38 0.09
39 0.07
40 0.08
41 0.08
42 0.07
43 0.07
44 0.06
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.11
82 0.1
83 0.09
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.16
100 0.25
101 0.33
102 0.41
103 0.5
104 0.6
105 0.67
106 0.74
107 0.77
108 0.74
109 0.73
110 0.74
111 0.74
112 0.72
113 0.72
114 0.7
115 0.69
116 0.65
117 0.63
118 0.63
119 0.64
120 0.66
121 0.72
122 0.77
123 0.79
124 0.88
125 0.91
126 0.93
127 0.94
128 0.92
129 0.91
130 0.87
131 0.81
132 0.78
133 0.76
134 0.74
135 0.7
136 0.64
137 0.57
138 0.57
139 0.53
140 0.49
141 0.48
142 0.47
143 0.52
144 0.59
145 0.66
146 0.69
147 0.78
148 0.83
149 0.86
150 0.87
151 0.82
152 0.77
153 0.71
154 0.61
155 0.51
156 0.42
157 0.31
158 0.23
159 0.17
160 0.12
161 0.13
162 0.19
163 0.21
164 0.21
165 0.25
166 0.3
167 0.36
168 0.44
169 0.48
170 0.44
171 0.46
172 0.47
173 0.44
174 0.39
175 0.36
176 0.34
177 0.29
178 0.26
179 0.28
180 0.36
181 0.45
182 0.55
183 0.62
184 0.68
185 0.74
186 0.81
187 0.82
188 0.81
189 0.76
190 0.69
191 0.6
192 0.49
193 0.39
194 0.31
195 0.24
196 0.15
197 0.1
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.07
207 0.1
208 0.11
209 0.16
210 0.17
211 0.19
212 0.22
213 0.22
214 0.25
215 0.26
216 0.25
217 0.22
218 0.21
219 0.2
220 0.19
221 0.19
222 0.19
223 0.21
224 0.29
225 0.33
226 0.36
227 0.37
228 0.36
229 0.4
230 0.41
231 0.34
232 0.26
233 0.2
234 0.19
235 0.18
236 0.18
237 0.14
238 0.11
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.12
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.07
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.12
273 0.12
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.11
285 0.12
286 0.12
287 0.13
288 0.15
289 0.16
290 0.15
291 0.15
292 0.12
293 0.13
294 0.12
295 0.11
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.07
304 0.08
305 0.1
306 0.15
307 0.22
308 0.25
309 0.25
310 0.27
311 0.33
312 0.41
313 0.44
314 0.48
315 0.49
316 0.5
317 0.5
318 0.5
319 0.47
320 0.4
321 0.34
322 0.27
323 0.28
324 0.25
325 0.24
326 0.23
327 0.23
328 0.24
329 0.24
330 0.24
331 0.19
332 0.21
333 0.25
334 0.31
335 0.38
336 0.37
337 0.39
338 0.41
339 0.4
340 0.39
341 0.36
342 0.3
343 0.24
344 0.24
345 0.27
346 0.34
347 0.34
348 0.34
349 0.35
350 0.38
351 0.39
352 0.36
353 0.34
354 0.33
355 0.38
356 0.37
357 0.38
358 0.37
359 0.36
360 0.35
361 0.3
362 0.23
363 0.18
364 0.17
365 0.16
366 0.14
367 0.13
368 0.14
369 0.15
370 0.17
371 0.21
372 0.27
373 0.31
374 0.35
375 0.36
376 0.44
377 0.46
378 0.5
379 0.53
380 0.54
381 0.51
382 0.5
383 0.57
384 0.56
385 0.6
386 0.56
387 0.47
388 0.42
389 0.47
390 0.53
391 0.53
392 0.48
393 0.42
394 0.41
395 0.42
396 0.41
397 0.38
398 0.3
399 0.25
400 0.25
401 0.3
402 0.3
403 0.29
404 0.28
405 0.25
406 0.23
407 0.21
408 0.22
409 0.24
410 0.25
411 0.27
412 0.37
413 0.39
414 0.42
415 0.43
416 0.4
417 0.42
418 0.43
419 0.49
420 0.49
421 0.54
422 0.59
423 0.65
424 0.7
425 0.7