Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8RX21

Protein Details
Accession A0A3D8RX21    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-97EPSKPTLKYKPRAVGRRSKEERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-101TLKYKPRAVGRRSKEEREAIE
117-165AIARGKANLAARGRAGFAGRGRGGPMGLAGAAGPLGSGFAGRRGRGGSR
224-232KKKKRKGKM
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 8.5, cyto_nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MPPKAAPRRGASSAPTRNNNGTASGASATPTTSASPAPGNTTRAPVQRLQSLKKRAPSGSIGPGPGPTSAGSGTGEPSKPTLKYKPRAVGRRSKEEREAIEKLEAERNAERLAEAAAIARGKANLAARGRAGFAGRGRGGPMGLAGAAGPLGSGFAGRRGRGGSRFGGGDPRATSMSRRSKSMTAGPGGGYSSDESDGDIRVSIDRINLESDADDDDEDAMIEKKKKRKGKMVLGSARESGLRPIRVERHEHEERVVSVNMESSTAKSAELRQQAKEKAKDDALFVQDDDETPTEGEPQVKQEPTENDQAMTDVPHAEEPVTTDDGLLPAPKVKVRRKLGSREPSVPVAPAVQDPKSLLRTKEDIEEYDRHAEDLELIKDLFTKEPPTKATEAAEGAEAPEGAEATTDDQDKEKKEGEDGEEELQDDKLTGQLFLMQFPPITPNLIEPSADGANLDSEATPIPNPAAPQSAGQNGASETPALKREDDVEVLDGQDEDTATNTQSKVVTAADWQLKAGQAGKLNVHASGRVTMDWGGISFELDRATAVDFLQEALIVSTPPNVTEEMPDDEHKVWAMGQLSGKFTVTPDWEKIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.62
3 0.61
4 0.6
5 0.59
6 0.55
7 0.47
8 0.39
9 0.31
10 0.27
11 0.23
12 0.19
13 0.16
14 0.15
15 0.13
16 0.12
17 0.12
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.13
22 0.16
23 0.16
24 0.22
25 0.25
26 0.29
27 0.29
28 0.34
29 0.37
30 0.39
31 0.42
32 0.41
33 0.41
34 0.44
35 0.5
36 0.53
37 0.57
38 0.61
39 0.64
40 0.66
41 0.68
42 0.62
43 0.6
44 0.58
45 0.55
46 0.54
47 0.51
48 0.46
49 0.4
50 0.39
51 0.35
52 0.29
53 0.24
54 0.15
55 0.14
56 0.12
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.14
61 0.18
62 0.18
63 0.17
64 0.19
65 0.22
66 0.24
67 0.29
68 0.38
69 0.43
70 0.5
71 0.58
72 0.65
73 0.71
74 0.78
75 0.8
76 0.8
77 0.78
78 0.81
79 0.79
80 0.76
81 0.74
82 0.7
83 0.67
84 0.64
85 0.59
86 0.51
87 0.48
88 0.43
89 0.38
90 0.39
91 0.34
92 0.3
93 0.29
94 0.28
95 0.25
96 0.23
97 0.2
98 0.14
99 0.15
100 0.11
101 0.09
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.12
110 0.13
111 0.17
112 0.19
113 0.21
114 0.22
115 0.22
116 0.23
117 0.21
118 0.2
119 0.17
120 0.17
121 0.21
122 0.21
123 0.21
124 0.21
125 0.2
126 0.19
127 0.15
128 0.14
129 0.08
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.03
137 0.02
138 0.03
139 0.02
140 0.03
141 0.03
142 0.1
143 0.13
144 0.13
145 0.15
146 0.17
147 0.21
148 0.24
149 0.28
150 0.23
151 0.23
152 0.24
153 0.23
154 0.28
155 0.24
156 0.24
157 0.21
158 0.21
159 0.21
160 0.2
161 0.21
162 0.24
163 0.34
164 0.32
165 0.34
166 0.36
167 0.37
168 0.4
169 0.45
170 0.41
171 0.33
172 0.32
173 0.3
174 0.27
175 0.24
176 0.2
177 0.14
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.09
209 0.14
210 0.19
211 0.26
212 0.34
213 0.42
214 0.49
215 0.58
216 0.65
217 0.7
218 0.75
219 0.78
220 0.77
221 0.73
222 0.68
223 0.58
224 0.49
225 0.38
226 0.29
227 0.23
228 0.21
229 0.18
230 0.17
231 0.21
232 0.26
233 0.29
234 0.33
235 0.32
236 0.35
237 0.38
238 0.37
239 0.35
240 0.3
241 0.29
242 0.27
243 0.25
244 0.16
245 0.13
246 0.14
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.11
256 0.16
257 0.24
258 0.25
259 0.26
260 0.32
261 0.38
262 0.44
263 0.46
264 0.41
265 0.37
266 0.37
267 0.36
268 0.32
269 0.3
270 0.24
271 0.2
272 0.18
273 0.16
274 0.13
275 0.12
276 0.12
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.08
285 0.11
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.17
290 0.2
291 0.22
292 0.28
293 0.24
294 0.21
295 0.21
296 0.21
297 0.17
298 0.14
299 0.11
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.05
316 0.06
317 0.07
318 0.1
319 0.17
320 0.23
321 0.33
322 0.39
323 0.47
324 0.51
325 0.59
326 0.67
327 0.69
328 0.68
329 0.63
330 0.59
331 0.54
332 0.47
333 0.39
334 0.29
335 0.2
336 0.16
337 0.14
338 0.13
339 0.11
340 0.11
341 0.12
342 0.15
343 0.19
344 0.21
345 0.2
346 0.21
347 0.24
348 0.24
349 0.29
350 0.27
351 0.24
352 0.26
353 0.28
354 0.27
355 0.29
356 0.27
357 0.22
358 0.2
359 0.19
360 0.16
361 0.17
362 0.15
363 0.11
364 0.11
365 0.11
366 0.12
367 0.13
368 0.11
369 0.1
370 0.14
371 0.16
372 0.19
373 0.21
374 0.24
375 0.25
376 0.25
377 0.26
378 0.23
379 0.21
380 0.18
381 0.17
382 0.13
383 0.11
384 0.1
385 0.08
386 0.06
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.06
393 0.08
394 0.09
395 0.09
396 0.11
397 0.15
398 0.17
399 0.2
400 0.21
401 0.2
402 0.21
403 0.24
404 0.26
405 0.26
406 0.26
407 0.25
408 0.22
409 0.22
410 0.2
411 0.17
412 0.13
413 0.1
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.07
418 0.07
419 0.11
420 0.12
421 0.13
422 0.14
423 0.12
424 0.11
425 0.12
426 0.14
427 0.1
428 0.12
429 0.11
430 0.12
431 0.15
432 0.16
433 0.16
434 0.13
435 0.17
436 0.15
437 0.15
438 0.13
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.1
443 0.06
444 0.06
445 0.07
446 0.08
447 0.07
448 0.07
449 0.08
450 0.09
451 0.1
452 0.11
453 0.14
454 0.14
455 0.15
456 0.17
457 0.19
458 0.2
459 0.19
460 0.19
461 0.16
462 0.16
463 0.15
464 0.13
465 0.11
466 0.12
467 0.16
468 0.16
469 0.16
470 0.16
471 0.19
472 0.21
473 0.22
474 0.2
475 0.18
476 0.17
477 0.17
478 0.16
479 0.13
480 0.1
481 0.09
482 0.08
483 0.06
484 0.07
485 0.08
486 0.09
487 0.12
488 0.12
489 0.13
490 0.14
491 0.14
492 0.14
493 0.14
494 0.14
495 0.13
496 0.2
497 0.22
498 0.22
499 0.22
500 0.22
501 0.22
502 0.23
503 0.23
504 0.2
505 0.2
506 0.23
507 0.24
508 0.27
509 0.27
510 0.27
511 0.25
512 0.23
513 0.2
514 0.21
515 0.21
516 0.16
517 0.17
518 0.16
519 0.16
520 0.14
521 0.13
522 0.11
523 0.1
524 0.1
525 0.09
526 0.1
527 0.1
528 0.09
529 0.09
530 0.08
531 0.1
532 0.1
533 0.09
534 0.09
535 0.09
536 0.1
537 0.1
538 0.09
539 0.07
540 0.07
541 0.08
542 0.07
543 0.07
544 0.1
545 0.1
546 0.11
547 0.12
548 0.13
549 0.13
550 0.16
551 0.2
552 0.21
553 0.25
554 0.26
555 0.28
556 0.28
557 0.28
558 0.25
559 0.22
560 0.17
561 0.18
562 0.18
563 0.17
564 0.21
565 0.23
566 0.26
567 0.26
568 0.27
569 0.23
570 0.22
571 0.24
572 0.25
573 0.28