Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8RFI2

Protein Details
Accession A0A3D8RFI2    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-100SHTPSPGPGRKNKKTKAPLHSAGHydrophilic
482-508EDKGKSAEPRERKQTWRRVQDDRDDNEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-95GPGRKNKKTKAP
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSLKQLSSILPLDDESLTEILAYTATLSKEEGAEHLKNLLGDSPAAFEFISAFNSRRDDPTRASTSASVSQSPRPSPSHTPSPGPGRKNKKTKAPLHSAGPPRQPADFGNVAGGYRKGDMDDDYMSEWSGSGSGSRTLDVGLGSSSLRVPSHQGSAASSRTQSPTPTTTAPPGRAGKAPPSAAGPVISDLLPNVKSKAAKPSRTGGGGGSSSGTSTPKGSSLTTSNISDLTAAIAALEVSTNPTLGGERRKCTCYGTLHPVFNAAPNCLNCGKIICSLEGLQPCSFCGRALLSNDEIQSMIRELRAERGQEKMRAHNESQHRDGGPGMGPGSSSSQSPSKLDAARAHRDKLLQFQAQNAKRTRVVDEAADFETPSVASTLWMTPSQRALALKKQQRIMREMEEKAKPEWEKKKTIMSLDIKGGRVRKVYQAAPAETPAPVEDEETEDLTYDVGRQRSGGEALSRNPLLAAGGLMRPVWKAPEDKGKSAEPRERKQTWRRVQDDRDDNEQWILDGGLHGYSESTMDVEQDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.13
4 0.12
5 0.1
6 0.1
7 0.08
8 0.08
9 0.07
10 0.06
11 0.09
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.12
16 0.13
17 0.14
18 0.16
19 0.19
20 0.2
21 0.2
22 0.21
23 0.21
24 0.21
25 0.21
26 0.2
27 0.15
28 0.14
29 0.13
30 0.15
31 0.13
32 0.14
33 0.13
34 0.1
35 0.11
36 0.11
37 0.14
38 0.13
39 0.14
40 0.17
41 0.21
42 0.23
43 0.28
44 0.32
45 0.34
46 0.37
47 0.44
48 0.47
49 0.45
50 0.46
51 0.41
52 0.4
53 0.42
54 0.39
55 0.35
56 0.32
57 0.37
58 0.4
59 0.41
60 0.41
61 0.37
62 0.41
63 0.45
64 0.5
65 0.53
66 0.51
67 0.53
68 0.54
69 0.62
70 0.63
71 0.61
72 0.64
73 0.64
74 0.7
75 0.76
76 0.77
77 0.78
78 0.8
79 0.83
80 0.83
81 0.83
82 0.78
83 0.73
84 0.75
85 0.72
86 0.7
87 0.67
88 0.61
89 0.53
90 0.48
91 0.44
92 0.36
93 0.35
94 0.29
95 0.23
96 0.21
97 0.2
98 0.19
99 0.19
100 0.19
101 0.13
102 0.11
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.12
107 0.13
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.14
113 0.12
114 0.11
115 0.08
116 0.07
117 0.06
118 0.05
119 0.07
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.06
129 0.07
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.12
137 0.13
138 0.16
139 0.17
140 0.17
141 0.18
142 0.22
143 0.24
144 0.21
145 0.2
146 0.19
147 0.2
148 0.21
149 0.2
150 0.2
151 0.21
152 0.23
153 0.25
154 0.25
155 0.29
156 0.32
157 0.32
158 0.34
159 0.34
160 0.33
161 0.33
162 0.33
163 0.31
164 0.33
165 0.31
166 0.26
167 0.25
168 0.24
169 0.21
170 0.2
171 0.15
172 0.1
173 0.11
174 0.1
175 0.08
176 0.07
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.12
182 0.13
183 0.15
184 0.26
185 0.32
186 0.35
187 0.38
188 0.42
189 0.42
190 0.42
191 0.41
192 0.31
193 0.26
194 0.21
195 0.18
196 0.14
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.12
208 0.14
209 0.16
210 0.18
211 0.18
212 0.17
213 0.16
214 0.15
215 0.13
216 0.11
217 0.08
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.02
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.08
233 0.17
234 0.19
235 0.22
236 0.25
237 0.27
238 0.27
239 0.29
240 0.32
241 0.28
242 0.3
243 0.36
244 0.37
245 0.36
246 0.35
247 0.35
248 0.29
249 0.27
250 0.23
251 0.15
252 0.14
253 0.13
254 0.16
255 0.15
256 0.15
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.14
261 0.14
262 0.12
263 0.12
264 0.13
265 0.16
266 0.17
267 0.18
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.13
273 0.1
274 0.09
275 0.08
276 0.11
277 0.12
278 0.15
279 0.15
280 0.17
281 0.17
282 0.16
283 0.15
284 0.12
285 0.11
286 0.09
287 0.08
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.12
292 0.15
293 0.16
294 0.16
295 0.22
296 0.25
297 0.3
298 0.32
299 0.35
300 0.36
301 0.39
302 0.39
303 0.4
304 0.45
305 0.45
306 0.45
307 0.42
308 0.38
309 0.33
310 0.33
311 0.27
312 0.2
313 0.15
314 0.12
315 0.09
316 0.08
317 0.09
318 0.11
319 0.1
320 0.09
321 0.1
322 0.12
323 0.14
324 0.15
325 0.17
326 0.19
327 0.2
328 0.23
329 0.28
330 0.32
331 0.4
332 0.42
333 0.42
334 0.39
335 0.4
336 0.38
337 0.38
338 0.39
339 0.33
340 0.31
341 0.35
342 0.43
343 0.45
344 0.51
345 0.46
346 0.42
347 0.41
348 0.43
349 0.39
350 0.33
351 0.3
352 0.26
353 0.25
354 0.24
355 0.22
356 0.21
357 0.17
358 0.13
359 0.12
360 0.1
361 0.09
362 0.06
363 0.05
364 0.05
365 0.07
366 0.08
367 0.09
368 0.12
369 0.12
370 0.13
371 0.15
372 0.16
373 0.17
374 0.19
375 0.21
376 0.28
377 0.37
378 0.42
379 0.46
380 0.51
381 0.51
382 0.53
383 0.53
384 0.49
385 0.48
386 0.48
387 0.47
388 0.48
389 0.49
390 0.48
391 0.45
392 0.46
393 0.41
394 0.43
395 0.49
396 0.48
397 0.51
398 0.52
399 0.6
400 0.57
401 0.58
402 0.58
403 0.53
404 0.5
405 0.51
406 0.51
407 0.44
408 0.44
409 0.43
410 0.37
411 0.36
412 0.34
413 0.34
414 0.36
415 0.36
416 0.4
417 0.43
418 0.42
419 0.41
420 0.4
421 0.34
422 0.28
423 0.26
424 0.19
425 0.15
426 0.12
427 0.12
428 0.11
429 0.13
430 0.15
431 0.15
432 0.15
433 0.13
434 0.13
435 0.12
436 0.11
437 0.1
438 0.13
439 0.13
440 0.14
441 0.14
442 0.15
443 0.18
444 0.19
445 0.19
446 0.2
447 0.22
448 0.24
449 0.3
450 0.29
451 0.26
452 0.25
453 0.22
454 0.17
455 0.14
456 0.12
457 0.08
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.11
464 0.13
465 0.14
466 0.17
467 0.22
468 0.33
469 0.38
470 0.42
471 0.45
472 0.5
473 0.54
474 0.6
475 0.64
476 0.62
477 0.65
478 0.7
479 0.73
480 0.76
481 0.78
482 0.81
483 0.82
484 0.83
485 0.82
486 0.82
487 0.83
488 0.84
489 0.83
490 0.77
491 0.75
492 0.66
493 0.61
494 0.53
495 0.45
496 0.35
497 0.26
498 0.2
499 0.13
500 0.11
501 0.1
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.07
506 0.07
507 0.08
508 0.07
509 0.08
510 0.07