Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8RRP3

Protein Details
Accession A0A3D8RRP3    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-150EEEGASRRKKEGRRKKSRRYAEEDEGGBasic
188-209MDEAMKKPTKRRARKQDGIDLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-142GRHKRKRTEEEGASRRKKEGRRKKSRR
156-165GGRRRKSKKA
180-184RRRAL
186-187RA
189-202DEAMKKPTKRRARK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSASPELKATATTPPIETEVETEQNAEETVQPPTPGAGGDDADADDNDAKPAVDNDNENENTNENDELENNLGDSDDESILSEVDEAQFEDFDPENVDIEDRPQLDIDEENLKLIGRHKRKRTEEEGASRRKKEGRRKKSRRYAEEDEGGSDQEAGGRRRKSKKAAIEEDEETLDPATRRRRALDRAMDEAMKKPTKRRARKQDGIDLEQMADAEIEDMRKRMTHAAQMDAINRREGKPAMHKLKMLPEVVSLLNRNQYVNSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLMTALGKLPINKETLIASGVGKVVVFYTRSKRPEPGIKRMAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYQEAEFDPTKITSRVKSVQDSAAEARARELLPPRLANRARAEISHTSYTVVPRPTMVQESKFARPLGASGEDRFRKMRARQIAATKGQGSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.26
4 0.24
5 0.21
6 0.23
7 0.23
8 0.22
9 0.21
10 0.19
11 0.19
12 0.18
13 0.15
14 0.13
15 0.12
16 0.15
17 0.16
18 0.16
19 0.15
20 0.16
21 0.15
22 0.13
23 0.13
24 0.12
25 0.11
26 0.11
27 0.12
28 0.11
29 0.12
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.11
35 0.1
36 0.1
37 0.1
38 0.12
39 0.14
40 0.15
41 0.17
42 0.19
43 0.27
44 0.28
45 0.29
46 0.28
47 0.26
48 0.25
49 0.24
50 0.22
51 0.15
52 0.15
53 0.14
54 0.15
55 0.15
56 0.14
57 0.12
58 0.11
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.09
86 0.11
87 0.15
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.15
95 0.15
96 0.14
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.13
101 0.19
102 0.26
103 0.33
104 0.42
105 0.5
106 0.6
107 0.68
108 0.76
109 0.78
110 0.77
111 0.76
112 0.77
113 0.78
114 0.78
115 0.76
116 0.7
117 0.66
118 0.64
119 0.64
120 0.64
121 0.67
122 0.68
123 0.73
124 0.82
125 0.89
126 0.92
127 0.94
128 0.91
129 0.89
130 0.86
131 0.81
132 0.76
133 0.66
134 0.57
135 0.47
136 0.38
137 0.29
138 0.21
139 0.13
140 0.1
141 0.13
142 0.14
143 0.19
144 0.24
145 0.32
146 0.4
147 0.46
148 0.51
149 0.56
150 0.63
151 0.67
152 0.71
153 0.67
154 0.64
155 0.59
156 0.52
157 0.45
158 0.35
159 0.26
160 0.17
161 0.14
162 0.1
163 0.13
164 0.18
165 0.21
166 0.23
167 0.27
168 0.32
169 0.37
170 0.46
171 0.5
172 0.47
173 0.47
174 0.47
175 0.44
176 0.39
177 0.36
178 0.34
179 0.29
180 0.26
181 0.28
182 0.36
183 0.45
184 0.55
185 0.62
186 0.68
187 0.74
188 0.81
189 0.82
190 0.81
191 0.76
192 0.69
193 0.6
194 0.49
195 0.39
196 0.31
197 0.24
198 0.15
199 0.1
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.07
209 0.1
210 0.11
211 0.16
212 0.17
213 0.19
214 0.22
215 0.22
216 0.25
217 0.26
218 0.25
219 0.22
220 0.21
221 0.2
222 0.2
223 0.2
224 0.2
225 0.24
226 0.33
227 0.37
228 0.38
229 0.39
230 0.38
231 0.44
232 0.44
233 0.36
234 0.27
235 0.21
236 0.21
237 0.2
238 0.2
239 0.14
240 0.11
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.12
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.07
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.12
275 0.11
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.14
291 0.16
292 0.15
293 0.16
294 0.13
295 0.13
296 0.13
297 0.12
298 0.1
299 0.09
300 0.1
301 0.09
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.09
307 0.11
308 0.17
309 0.24
310 0.29
311 0.31
312 0.34
313 0.4
314 0.49
315 0.53
316 0.57
317 0.58
318 0.58
319 0.59
320 0.59
321 0.55
322 0.48
323 0.41
324 0.33
325 0.32
326 0.29
327 0.26
328 0.23
329 0.22
330 0.24
331 0.24
332 0.24
333 0.19
334 0.21
335 0.25
336 0.3
337 0.38
338 0.37
339 0.39
340 0.42
341 0.43
342 0.42
343 0.41
344 0.36
345 0.28
346 0.32
347 0.32
348 0.35
349 0.31
350 0.29
351 0.29
352 0.28
353 0.29
354 0.25
355 0.24
356 0.2
357 0.27
358 0.33
359 0.36
360 0.4
361 0.41
362 0.43
363 0.41
364 0.43
365 0.38
366 0.37
367 0.34
368 0.29
369 0.26
370 0.25
371 0.23
372 0.23
373 0.27
374 0.27
375 0.32
376 0.37
377 0.37
378 0.44
379 0.46
380 0.49
381 0.48
382 0.49
383 0.45
384 0.41
385 0.46
386 0.42
387 0.46
388 0.42
389 0.37
390 0.31
391 0.32
392 0.35
393 0.34
394 0.3
395 0.25
396 0.23
397 0.26
398 0.28
399 0.33
400 0.34
401 0.31
402 0.36
403 0.41
404 0.45
405 0.46
406 0.43
407 0.36
408 0.32
409 0.3
410 0.29
411 0.3
412 0.27
413 0.26
414 0.36
415 0.37
416 0.4
417 0.41
418 0.39
419 0.41
420 0.45
421 0.51
422 0.52
423 0.57
424 0.61
425 0.69
426 0.74
427 0.71
428 0.7
429 0.65