FuNGI

A0A3D8R9D8

Protein Details

Accession

A0A3D8R9D8

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-40	TQKNAPAPKKAPKPAAPRLKL	Hydrophilic
244-263	SAEKTEKRSRNDRNDRNDKA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-39	PAPKKAPKPAAPRLK
200-238	EKKANKAKEASNKSSRQRSEREPKAEKIQSKKLLQRPEK
501-523	KANPGAEKGRGKGRGEPKPPNPA
551-578	GGGGGGGGSSDGRRGRRSGRGKGGSKAN

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, mito 11, cyto_nucl 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3 cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MTQILSKSSGGVLQIPASATQKNAPAPKKAPKPAAPRLKLLVRRLPPGLTQEEFEAALGEAWKVGAGKVSWSQYKPGKISKDPAKPSRPSRAYLYVVSSEHITPLSDKVRSTSFLDARNTANDPVLLGPPNLEFAPYAKIPGSRVRKDARQGTIDQEPEFIQFLESLTQPITKPAAESTAEDENKKEAITTTPLVQYIKEKKANKAKEASNKSSRQRSEREPKAEKIQSKKLLQRPEKEVSPVSAEKTEKRSRNDRNDRNDKATKEAVKVANKQAASVSSKQAAKASSAQNAPKDTTTAQPATERRRERGNAAAVGKILQRDLGLAPSSNRRRGGRGTSGASGESEPRPEPAAATEVKKETPTRSPKASPAAQDAKAKRSNTPQPSETPTSQRSETSTPAQPTSTPRGPRGRGKQSSATTPTTPTSTATQAFLKHANPSQGVTEPLLETAFSPFGKVVKVEIDKKKGFGYVDFAEPESLQKAISASPVTVAQSQVVVLERKANPGAEKGRGKGRGEPKPPNPAAPAEANTNSNRGGKSNEGSGGSGSGGGGGGGGGGGSSDGRRGRRSGRGKGGSKANGGSGGGGGGSSNANANASEGKNAETK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.16
3	0.18
4	0.19
5	0.18
6	0.17
7	0.19
8	0.23
9	0.28
10	0.36
11	0.38
12	0.45
13	0.51
14	0.59
15	0.66
16	0.7
17	0.73
18	0.73
19	0.78
20	0.8
21	0.84
22	0.78
23	0.74
24	0.72
25	0.72
26	0.7
27	0.68
28	0.67
29	0.61
30	0.62
31	0.59
32	0.55
33	0.49
34	0.48
35	0.45
36	0.37
37	0.33
38	0.3
39	0.29
40	0.26
41	0.23
42	0.18
43	0.12
44	0.12
45	0.11
46	0.09
47	0.07
48	0.07
49	0.08
50	0.07
51	0.07
52	0.09
53	0.09
54	0.13
55	0.18
56	0.23
57	0.28
58	0.29
59	0.36
60	0.39
61	0.46
62	0.48
63	0.5
64	0.53
65	0.53
66	0.61
67	0.64
68	0.67
69	0.69
70	0.73
71	0.74
72	0.75
73	0.77
74	0.79
75	0.72
76	0.66
77	0.64
78	0.63
79	0.58
80	0.53
81	0.5
82	0.42
83	0.39
84	0.36
85	0.31
86	0.24
87	0.21
88	0.18
89	0.14
90	0.11
91	0.16
92	0.2
93	0.19
94	0.19
95	0.21
96	0.23
97	0.25
98	0.27
99	0.31
100	0.31
101	0.35
102	0.38
103	0.38
104	0.37
105	0.38
106	0.37
107	0.29
108	0.26
109	0.2
110	0.17
111	0.17
112	0.17
113	0.15
114	0.13
115	0.13
116	0.12
117	0.14
118	0.13
119	0.11
120	0.09
121	0.09
122	0.14
123	0.13
124	0.14
125	0.14
126	0.15
127	0.18
128	0.26
129	0.34
130	0.33
131	0.4
132	0.44
133	0.49
134	0.55
135	0.61
136	0.57
137	0.52
138	0.5
139	0.49
140	0.49
141	0.45
142	0.38
143	0.31
144	0.26
145	0.23
146	0.22
147	0.17
148	0.11
149	0.09
150	0.09
151	0.1
152	0.09
153	0.09
154	0.09
155	0.11
156	0.1
157	0.13
158	0.14
159	0.12
160	0.12
161	0.12
162	0.15
163	0.14
164	0.15
165	0.17
166	0.24
167	0.25
168	0.25
169	0.25
170	0.23
171	0.22
172	0.21
173	0.17
174	0.1
175	0.11
176	0.15
177	0.16
178	0.17
179	0.18
180	0.2
181	0.19
182	0.19
183	0.24
184	0.28
185	0.34
186	0.39
187	0.4
188	0.47
189	0.57
190	0.62
191	0.61
192	0.6
193	0.6
194	0.63
195	0.68
196	0.68
197	0.67
198	0.68
199	0.68
200	0.7
201	0.67
202	0.63
203	0.6
204	0.62
205	0.64
206	0.65
207	0.69
208	0.65
209	0.65
210	0.67
211	0.68
212	0.63
213	0.6
214	0.6
215	0.58
216	0.59
217	0.64
218	0.6
219	0.65
220	0.66
221	0.65
222	0.63
223	0.6
224	0.56
225	0.51
226	0.45
227	0.36
228	0.35
229	0.3
230	0.24
231	0.24
232	0.24
233	0.24
234	0.31
235	0.37
236	0.37
237	0.42
238	0.5
239	0.55
240	0.65
241	0.73
242	0.73
243	0.76
244	0.8
245	0.79
246	0.77
247	0.74
248	0.63
249	0.57
250	0.54
251	0.46
252	0.38
253	0.4
254	0.38
255	0.37
256	0.4
257	0.39
258	0.38
259	0.35
260	0.33
261	0.27
262	0.25
263	0.23
264	0.21
265	0.19
266	0.2
267	0.2
268	0.21
269	0.22
270	0.2
271	0.18
272	0.21
273	0.21
274	0.21
275	0.24
276	0.26
277	0.26
278	0.27
279	0.26
280	0.21
281	0.2
282	0.17
283	0.15
284	0.17
285	0.16
286	0.15
287	0.18
288	0.23
289	0.28
290	0.34
291	0.34
292	0.32
293	0.38
294	0.39
295	0.37
296	0.39
297	0.37
298	0.34
299	0.32
300	0.31
301	0.25
302	0.24
303	0.22
304	0.16
305	0.12
306	0.08
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.08
311	0.07
312	0.07
313	0.09
314	0.17
315	0.21
316	0.24
317	0.27
318	0.27
319	0.3
320	0.34
321	0.39
322	0.37
323	0.37
324	0.36
325	0.34
326	0.34
327	0.31
328	0.27
329	0.22
330	0.17
331	0.13
332	0.13
333	0.11
334	0.11
335	0.13
336	0.12
337	0.12
338	0.1
339	0.13
340	0.13
341	0.15
342	0.16
343	0.16
344	0.17
345	0.18
346	0.19
347	0.19
348	0.26
349	0.33
350	0.35
351	0.39
352	0.41
353	0.43
354	0.48
355	0.49
356	0.42
357	0.41
358	0.43
359	0.41
360	0.45
361	0.43
362	0.43
363	0.45
364	0.44
365	0.4
366	0.42
367	0.48
368	0.49
369	0.52
370	0.48
371	0.46
372	0.52
373	0.54
374	0.48
375	0.45
376	0.41
377	0.38
378	0.37
379	0.34
380	0.31
381	0.28
382	0.29
383	0.28
384	0.3
385	0.29
386	0.29
387	0.29
388	0.27
389	0.29
390	0.34
391	0.35
392	0.33
393	0.37
394	0.44
395	0.48
396	0.55
397	0.6
398	0.62
399	0.61
400	0.63
401	0.65
402	0.6
403	0.63
404	0.59
405	0.53
406	0.44
407	0.41
408	0.37
409	0.3
410	0.28
411	0.22
412	0.2
413	0.19
414	0.19
415	0.19
416	0.2
417	0.2
418	0.21
419	0.23
420	0.21
421	0.22
422	0.23
423	0.25
424	0.24
425	0.23
426	0.23
427	0.22
428	0.22
429	0.19
430	0.18
431	0.14
432	0.14
433	0.12
434	0.1
435	0.09
436	0.09
437	0.11
438	0.09
439	0.1
440	0.1
441	0.11
442	0.11
443	0.11
444	0.11
445	0.16
446	0.21
447	0.3
448	0.37
449	0.44
450	0.44
451	0.46
452	0.46
453	0.42
454	0.38
455	0.3
456	0.29
457	0.23
458	0.25
459	0.25
460	0.24
461	0.22
462	0.2
463	0.2
464	0.15
465	0.13
466	0.09
467	0.09
468	0.09
469	0.09
470	0.12
471	0.11
472	0.1
473	0.11
474	0.13
475	0.14
476	0.15
477	0.14
478	0.12
479	0.11
480	0.11
481	0.11
482	0.13
483	0.12
484	0.11
485	0.19
486	0.19
487	0.23
488	0.24
489	0.25
490	0.24
491	0.3
492	0.34
493	0.35
494	0.38
495	0.38
496	0.44
497	0.49
498	0.5
499	0.51
500	0.56
501	0.58
502	0.62
503	0.69
504	0.68
505	0.72
506	0.72
507	0.67
508	0.6
509	0.53
510	0.48
511	0.43
512	0.38
513	0.33
514	0.34
515	0.33
516	0.31
517	0.31
518	0.3
519	0.29
520	0.27
521	0.23
522	0.25
523	0.27
524	0.28
525	0.3
526	0.31
527	0.29
528	0.29
529	0.27
530	0.24
531	0.19
532	0.16
533	0.12
534	0.08
535	0.07
536	0.06
537	0.05
538	0.04
539	0.03
540	0.03
541	0.03
542	0.02
543	0.02
544	0.03
545	0.04
546	0.04
547	0.09
548	0.14
549	0.18
550	0.21
551	0.26
552	0.33
553	0.42
554	0.51
555	0.57
556	0.63
557	0.7
558	0.71
559	0.74
560	0.77
561	0.72
562	0.67
563	0.58
564	0.49
565	0.42
566	0.37
567	0.3
568	0.21
569	0.15
570	0.11
571	0.09
572	0.07
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.07
577	0.08
578	0.09
579	0.09
580	0.11
581	0.16
582	0.16
583	0.19
584	0.19

A0A3D8R9D8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer