Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8S5S9

Protein Details
Accession A0A3D8S5S9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-57TPATGEKRGRGRPRKYPVGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-106GEKRGRGRPRKYPVGSTPVRPEGPKRGRGRPPKAATGTATPKAKATPTSNTPGSSSRGRGRPKKS
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR002740  EVE_domain  
IPR000116  HMGA  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR015947  PUA-like_sf  
IPR047197  THYN1-like_EVE  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF01878  EVE  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
CDD cd21133  EVE  
Amino Acid Sequences MALGRKRKSESVSAAGETETPSKRVAKGSASTPATPATPATGEKRGRGRPRKYPVGSTPVRPEGPKRGRGRPPKAATGTATPKAKATPTSNTPGSSSRGRGRPKKSPGASDSTPAADGNTDQNTGRSYWLMKAEPESRIEKGKDVKFSIDDLRAAKEPEPWDGVRNPVARKHMQSMKKGDLAFFYHSNCKIPGIAGVMEIVQEHSPDESAFDPSHPYYDEKSKREDPKWFVVHVEFRRKFDELITLQQLKSHSSAKAPLENLQMLKQGRLSVSAVTPSQWDFIMSLVKEGDKTGSADDSSKENEPGKENESAKEDEGAEKTAEAAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.4
3 0.35
4 0.29
5 0.28
6 0.23
7 0.2
8 0.22
9 0.24
10 0.26
11 0.3
12 0.32
13 0.32
14 0.34
15 0.37
16 0.44
17 0.45
18 0.42
19 0.39
20 0.37
21 0.31
22 0.27
23 0.23
24 0.17
25 0.15
26 0.17
27 0.21
28 0.28
29 0.29
30 0.34
31 0.42
32 0.49
33 0.58
34 0.65
35 0.69
36 0.7
37 0.78
38 0.83
39 0.79
40 0.78
41 0.74
42 0.73
43 0.68
44 0.63
45 0.61
46 0.57
47 0.54
48 0.48
49 0.46
50 0.47
51 0.52
52 0.55
53 0.54
54 0.58
55 0.66
56 0.75
57 0.79
58 0.78
59 0.76
60 0.76
61 0.73
62 0.67
63 0.59
64 0.56
65 0.54
66 0.49
67 0.46
68 0.37
69 0.35
70 0.33
71 0.32
72 0.3
73 0.28
74 0.28
75 0.31
76 0.37
77 0.38
78 0.37
79 0.38
80 0.35
81 0.35
82 0.31
83 0.31
84 0.31
85 0.37
86 0.45
87 0.51
88 0.56
89 0.62
90 0.66
91 0.72
92 0.68
93 0.68
94 0.63
95 0.62
96 0.56
97 0.49
98 0.42
99 0.33
100 0.3
101 0.23
102 0.18
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.12
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.11
114 0.11
115 0.12
116 0.16
117 0.16
118 0.16
119 0.19
120 0.22
121 0.22
122 0.24
123 0.24
124 0.21
125 0.25
126 0.25
127 0.25
128 0.29
129 0.31
130 0.32
131 0.31
132 0.31
133 0.28
134 0.29
135 0.29
136 0.22
137 0.21
138 0.17
139 0.18
140 0.18
141 0.18
142 0.16
143 0.17
144 0.16
145 0.16
146 0.18
147 0.17
148 0.18
149 0.18
150 0.19
151 0.2
152 0.22
153 0.22
154 0.22
155 0.27
156 0.27
157 0.28
158 0.32
159 0.36
160 0.38
161 0.43
162 0.45
163 0.44
164 0.46
165 0.44
166 0.38
167 0.32
168 0.29
169 0.26
170 0.22
171 0.2
172 0.2
173 0.21
174 0.22
175 0.2
176 0.18
177 0.15
178 0.14
179 0.13
180 0.11
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.07
195 0.07
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.12
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.15
204 0.16
205 0.26
206 0.33
207 0.32
208 0.39
209 0.46
210 0.53
211 0.56
212 0.61
213 0.57
214 0.59
215 0.6
216 0.54
217 0.48
218 0.43
219 0.47
220 0.46
221 0.51
222 0.44
223 0.43
224 0.46
225 0.45
226 0.41
227 0.34
228 0.36
229 0.27
230 0.31
231 0.35
232 0.34
233 0.32
234 0.34
235 0.34
236 0.27
237 0.28
238 0.25
239 0.19
240 0.19
241 0.26
242 0.27
243 0.32
244 0.31
245 0.32
246 0.34
247 0.35
248 0.34
249 0.3
250 0.32
251 0.27
252 0.27
253 0.24
254 0.22
255 0.2
256 0.21
257 0.2
258 0.17
259 0.17
260 0.19
261 0.18
262 0.16
263 0.17
264 0.16
265 0.16
266 0.14
267 0.13
268 0.1
269 0.11
270 0.16
271 0.15
272 0.15
273 0.15
274 0.16
275 0.16
276 0.16
277 0.17
278 0.12
279 0.14
280 0.14
281 0.15
282 0.16
283 0.17
284 0.18
285 0.2
286 0.22
287 0.23
288 0.25
289 0.27
290 0.29
291 0.32
292 0.35
293 0.35
294 0.4
295 0.39
296 0.39
297 0.39
298 0.39
299 0.36
300 0.35
301 0.33
302 0.29
303 0.29
304 0.28
305 0.23
306 0.2