Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8RQM0

Protein Details
Accession A0A3D8RQM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
269-291DDDGKKSKGKGKRGVRRNSDATEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-121KKKMAEPRARAARH
273-285KKSKGKGKRGVRR
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 11, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MPVPNRSHRQRAAPSAAAFEDPALTITSTRIARLPSPHSDAVPSQQSFRCSGGSIRTFGPGNASRELAPWPWKSRQINTLIGAGYQPAFEPSAACNIPGEDQTGTKVKKKMAEPRARAARHKGQMNFPSECWFSSIAVSWYLHYDVEANRGTILVRLLLLAYGDPAPHPSFPSEPLPETVRVLDEIVTDFVLEMCHGAAQHANYSRRQKIKVDDFRFALRRDPNKLGRVQELLRMERELKEARKQFDQNDDQVGNLKDAAGKKGLEDLDDDGKKSKGKGKRGVRRNSDATEDASTVKKRKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.57
3 0.52
4 0.44
5 0.35
6 0.26
7 0.19
8 0.13
9 0.13
10 0.1
11 0.1
12 0.09
13 0.1
14 0.15
15 0.15
16 0.16
17 0.17
18 0.18
19 0.22
20 0.28
21 0.33
22 0.33
23 0.4
24 0.4
25 0.39
26 0.39
27 0.37
28 0.37
29 0.39
30 0.33
31 0.31
32 0.33
33 0.34
34 0.34
35 0.34
36 0.29
37 0.23
38 0.25
39 0.28
40 0.28
41 0.28
42 0.26
43 0.28
44 0.27
45 0.25
46 0.3
47 0.27
48 0.28
49 0.27
50 0.27
51 0.25
52 0.25
53 0.28
54 0.24
55 0.25
56 0.27
57 0.3
58 0.34
59 0.42
60 0.45
61 0.47
62 0.51
63 0.5
64 0.5
65 0.46
66 0.45
67 0.36
68 0.32
69 0.28
70 0.21
71 0.16
72 0.1
73 0.09
74 0.06
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.12
84 0.14
85 0.13
86 0.14
87 0.09
88 0.09
89 0.12
90 0.18
91 0.19
92 0.23
93 0.26
94 0.27
95 0.33
96 0.39
97 0.46
98 0.51
99 0.59
100 0.58
101 0.64
102 0.71
103 0.67
104 0.64
105 0.62
106 0.6
107 0.55
108 0.57
109 0.51
110 0.49
111 0.52
112 0.54
113 0.48
114 0.39
115 0.37
116 0.32
117 0.29
118 0.23
119 0.18
120 0.14
121 0.12
122 0.13
123 0.1
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.09
132 0.07
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.03
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.1
157 0.11
158 0.13
159 0.18
160 0.17
161 0.18
162 0.19
163 0.21
164 0.2
165 0.2
166 0.18
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.1
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.03
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.06
186 0.07
187 0.11
188 0.17
189 0.19
190 0.25
191 0.32
192 0.38
193 0.42
194 0.45
195 0.45
196 0.49
197 0.57
198 0.62
199 0.6
200 0.58
201 0.55
202 0.58
203 0.58
204 0.49
205 0.45
206 0.43
207 0.43
208 0.45
209 0.5
210 0.51
211 0.52
212 0.56
213 0.53
214 0.48
215 0.48
216 0.42
217 0.41
218 0.39
219 0.36
220 0.33
221 0.32
222 0.3
223 0.27
224 0.31
225 0.31
226 0.3
227 0.37
228 0.41
229 0.43
230 0.49
231 0.51
232 0.51
233 0.55
234 0.56
235 0.5
236 0.51
237 0.47
238 0.39
239 0.41
240 0.37
241 0.28
242 0.22
243 0.19
244 0.17
245 0.18
246 0.21
247 0.18
248 0.17
249 0.17
250 0.23
251 0.23
252 0.2
253 0.2
254 0.21
255 0.27
256 0.28
257 0.29
258 0.25
259 0.27
260 0.29
261 0.3
262 0.35
263 0.34
264 0.43
265 0.52
266 0.61
267 0.69
268 0.77
269 0.84
270 0.85
271 0.86
272 0.83
273 0.77
274 0.72
275 0.64
276 0.58
277 0.5
278 0.42
279 0.36
280 0.34
281 0.36