Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8REF3

Protein Details
Accession A0A3D8REF3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
751-776YYGARAEDRRVRRNIKRRKDAGDEDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
760-769RVRRNIKRRK
Subcellular Location(s) mito 17, cyto 7, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0016310  P:phosphorylation  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MTKRKAEKQAAIAGTRSVSWLSSDAAETYNDCLAPISAFAARKARLQQTQTQTVVTTETTTHTEPAGEPPSKKPRRSLEESQAQSTPKEDAKRTTKRGTVKVEKTQRADNGTAARETRRKKVEVEVEQRETEASSSEESEGEDAVEENAAGVIAVPAAEDGCEFPADNTMTVEFPLSKMRLNKSNIVYSDEDTLCVRIREKLSIVLIGHYDLWVKRGVVSLMGAKLHPSPRVYRVYAPSTHSLPVIKCVTGVDGGAEVEFKSCHSGITRLRDLSPLYQRVWNSGNTPADKLSLKMAGQDARRTFSVLHTSADDSLKRHLRPLHLEKQWSAAIKVLSQRAGRLQVLVCGPKASGKSTFGRYLLNHLLSPAPQTETNYANTDGVAFLDLDPGQPEFMPMGQVYLAHLRSPVFGPPFTHPSLNNEREGSIIRAHHIGATSPKEDPDHYVLAATNLMEQYRALLATYPQCPLIINYPGWIFGTGLEVATYLIRSLGLSDVVYMSEKGPMEVVEPLSQAASASRTPLTILPSQPTEFVSRSSAQLRSMQMQSYFHMAQPKGVSHPMWAEKPVFKNRPFRVRYAGENRGVHGVMTLGSQISPELLCESLEGAVVGVVAVEGPDALPSPHPDSTTTNVESQAADNDDDETSNADVDMDDVDGAKTNLTIPHLATLTTPTKESLPYISTGPGSSTPLHPSSSSTLGLAIVRSINPTTQTLDLVTPIAPSRLIQSLEQGHALVLVRGVLDNPNWAVAEEYYGARAEDRRVRRNIKRRKDAGDEDDGDAAQDQKVLGLLKERIRRAKEVPFMTVVEDHGRRRQEEVEQQRALWKLRKKAGIESEDEVGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.33
3 0.27
4 0.18
5 0.14
6 0.13
7 0.14
8 0.13
9 0.14
10 0.15
11 0.15
12 0.15
13 0.16
14 0.15
15 0.16
16 0.17
17 0.15
18 0.14
19 0.13
20 0.13
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.14
25 0.15
26 0.18
27 0.24
28 0.25
29 0.29
30 0.36
31 0.42
32 0.45
33 0.5
34 0.56
35 0.58
36 0.65
37 0.61
38 0.55
39 0.48
40 0.41
41 0.37
42 0.29
43 0.22
44 0.14
45 0.15
46 0.18
47 0.19
48 0.19
49 0.17
50 0.18
51 0.18
52 0.24
53 0.29
54 0.29
55 0.3
56 0.38
57 0.49
58 0.56
59 0.59
60 0.6
61 0.63
62 0.68
63 0.75
64 0.75
65 0.74
66 0.76
67 0.77
68 0.72
69 0.65
70 0.57
71 0.49
72 0.41
73 0.35
74 0.3
75 0.33
76 0.32
77 0.37
78 0.47
79 0.56
80 0.62
81 0.66
82 0.67
83 0.69
84 0.74
85 0.75
86 0.76
87 0.74
88 0.77
89 0.79
90 0.8
91 0.75
92 0.73
93 0.68
94 0.63
95 0.56
96 0.51
97 0.46
98 0.41
99 0.4
100 0.36
101 0.37
102 0.39
103 0.41
104 0.46
105 0.47
106 0.47
107 0.47
108 0.54
109 0.58
110 0.61
111 0.66
112 0.65
113 0.63
114 0.61
115 0.58
116 0.49
117 0.39
118 0.29
119 0.21
120 0.14
121 0.1
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.08
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.13
157 0.13
158 0.13
159 0.14
160 0.09
161 0.1
162 0.15
163 0.15
164 0.18
165 0.23
166 0.28
167 0.34
168 0.38
169 0.45
170 0.44
171 0.5
172 0.47
173 0.47
174 0.44
175 0.37
176 0.39
177 0.32
178 0.28
179 0.22
180 0.23
181 0.19
182 0.18
183 0.18
184 0.17
185 0.19
186 0.21
187 0.22
188 0.24
189 0.24
190 0.27
191 0.26
192 0.22
193 0.2
194 0.18
195 0.16
196 0.12
197 0.14
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.14
209 0.15
210 0.14
211 0.13
212 0.17
213 0.19
214 0.2
215 0.2
216 0.22
217 0.28
218 0.34
219 0.35
220 0.36
221 0.39
222 0.41
223 0.42
224 0.43
225 0.4
226 0.36
227 0.34
228 0.3
229 0.27
230 0.22
231 0.25
232 0.23
233 0.19
234 0.18
235 0.17
236 0.17
237 0.15
238 0.14
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.1
252 0.16
253 0.21
254 0.29
255 0.33
256 0.31
257 0.32
258 0.33
259 0.33
260 0.34
261 0.36
262 0.32
263 0.29
264 0.32
265 0.31
266 0.33
267 0.33
268 0.28
269 0.23
270 0.26
271 0.28
272 0.26
273 0.27
274 0.24
275 0.24
276 0.23
277 0.21
278 0.17
279 0.16
280 0.14
281 0.15
282 0.17
283 0.19
284 0.21
285 0.26
286 0.25
287 0.25
288 0.25
289 0.24
290 0.22
291 0.21
292 0.26
293 0.21
294 0.21
295 0.19
296 0.2
297 0.21
298 0.23
299 0.21
300 0.15
301 0.2
302 0.24
303 0.23
304 0.27
305 0.28
306 0.31
307 0.39
308 0.46
309 0.49
310 0.48
311 0.5
312 0.46
313 0.46
314 0.44
315 0.36
316 0.28
317 0.21
318 0.18
319 0.17
320 0.21
321 0.19
322 0.2
323 0.19
324 0.2
325 0.19
326 0.22
327 0.2
328 0.19
329 0.17
330 0.16
331 0.19
332 0.19
333 0.16
334 0.13
335 0.13
336 0.14
337 0.15
338 0.13
339 0.13
340 0.16
341 0.19
342 0.22
343 0.25
344 0.23
345 0.25
346 0.23
347 0.27
348 0.28
349 0.25
350 0.22
351 0.2
352 0.19
353 0.17
354 0.18
355 0.13
356 0.1
357 0.1
358 0.11
359 0.13
360 0.15
361 0.16
362 0.17
363 0.17
364 0.15
365 0.15
366 0.13
367 0.11
368 0.09
369 0.07
370 0.05
371 0.04
372 0.06
373 0.06
374 0.05
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.05
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.11
395 0.12
396 0.11
397 0.11
398 0.13
399 0.15
400 0.19
401 0.2
402 0.2
403 0.18
404 0.23
405 0.31
406 0.31
407 0.3
408 0.26
409 0.25
410 0.25
411 0.26
412 0.21
413 0.15
414 0.13
415 0.12
416 0.12
417 0.12
418 0.12
419 0.11
420 0.1
421 0.11
422 0.13
423 0.14
424 0.13
425 0.14
426 0.14
427 0.14
428 0.16
429 0.16
430 0.15
431 0.14
432 0.14
433 0.13
434 0.13
435 0.13
436 0.1
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.05
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.05
446 0.05
447 0.06
448 0.1
449 0.12
450 0.11
451 0.11
452 0.11
453 0.12
454 0.12
455 0.14
456 0.14
457 0.12
458 0.13
459 0.13
460 0.13
461 0.13
462 0.13
463 0.09
464 0.06
465 0.08
466 0.07
467 0.07
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.04
474 0.03
475 0.04
476 0.04
477 0.04
478 0.04
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.08
488 0.09
489 0.08
490 0.08
491 0.08
492 0.09
493 0.1
494 0.11
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.09
499 0.08
500 0.07
501 0.06
502 0.07
503 0.06
504 0.08
505 0.08
506 0.08
507 0.09
508 0.11
509 0.14
510 0.16
511 0.17
512 0.17
513 0.19
514 0.2
515 0.2
516 0.2
517 0.19
518 0.16
519 0.17
520 0.18
521 0.17
522 0.19
523 0.21
524 0.21
525 0.19
526 0.23
527 0.24
528 0.24
529 0.25
530 0.24
531 0.22
532 0.22
533 0.21
534 0.22
535 0.21
536 0.19
537 0.24
538 0.22
539 0.23
540 0.24
541 0.24
542 0.22
543 0.23
544 0.22
545 0.16
546 0.21
547 0.22
548 0.21
549 0.22
550 0.23
551 0.25
552 0.31
553 0.4
554 0.42
555 0.44
556 0.52
557 0.56
558 0.64
559 0.63
560 0.6
561 0.58
562 0.54
563 0.57
564 0.56
565 0.57
566 0.54
567 0.51
568 0.49
569 0.43
570 0.4
571 0.31
572 0.23
573 0.16
574 0.09
575 0.09
576 0.08
577 0.05
578 0.05
579 0.05
580 0.05
581 0.05
582 0.05
583 0.05
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.07
589 0.06
590 0.06
591 0.06
592 0.05
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.03
597 0.02
598 0.02
599 0.02
600 0.02
601 0.02
602 0.02
603 0.03
604 0.03
605 0.04
606 0.05
607 0.09
608 0.13
609 0.15
610 0.16
611 0.18
612 0.22
613 0.26
614 0.31
615 0.3
616 0.27
617 0.26
618 0.26
619 0.25
620 0.22
621 0.2
622 0.15
623 0.14
624 0.12
625 0.13
626 0.12
627 0.12
628 0.11
629 0.1
630 0.09
631 0.08
632 0.08
633 0.06
634 0.06
635 0.06
636 0.07
637 0.05
638 0.05
639 0.05
640 0.05
641 0.06
642 0.07
643 0.06
644 0.06
645 0.07
646 0.09
647 0.1
648 0.12
649 0.11
650 0.15
651 0.15
652 0.15
653 0.14
654 0.18
655 0.2
656 0.2
657 0.2
658 0.17
659 0.18
660 0.19
661 0.2
662 0.18
663 0.16
664 0.17
665 0.17
666 0.18
667 0.18
668 0.17
669 0.18
670 0.15
671 0.17
672 0.17
673 0.18
674 0.21
675 0.22
676 0.23
677 0.21
678 0.23
679 0.24
680 0.26
681 0.24
682 0.2
683 0.18
684 0.18
685 0.18
686 0.15
687 0.12
688 0.1
689 0.1
690 0.12
691 0.12
692 0.12
693 0.14
694 0.16
695 0.17
696 0.17
697 0.18
698 0.17
699 0.17
700 0.16
701 0.15
702 0.14
703 0.12
704 0.12
705 0.12
706 0.1
707 0.1
708 0.12
709 0.16
710 0.17
711 0.16
712 0.22
713 0.25
714 0.27
715 0.27
716 0.24
717 0.2
718 0.2
719 0.2
720 0.14
721 0.1
722 0.08
723 0.08
724 0.08
725 0.09
726 0.09
727 0.09
728 0.11
729 0.12
730 0.13
731 0.13
732 0.13
733 0.13
734 0.12
735 0.14
736 0.13
737 0.13
738 0.12
739 0.13
740 0.13
741 0.13
742 0.15
743 0.19
744 0.26
745 0.34
746 0.42
747 0.5
748 0.6
749 0.69
750 0.77
751 0.82
752 0.84
753 0.87
754 0.86
755 0.85
756 0.85
757 0.83
758 0.79
759 0.77
760 0.69
761 0.6
762 0.54
763 0.46
764 0.37
765 0.29
766 0.23
767 0.13
768 0.11
769 0.09
770 0.08
771 0.1
772 0.11
773 0.11
774 0.16
775 0.22
776 0.29
777 0.37
778 0.43
779 0.5
780 0.53
781 0.59
782 0.58
783 0.62
784 0.64
785 0.6
786 0.57
787 0.52
788 0.48
789 0.44
790 0.4
791 0.32
792 0.31
793 0.32
794 0.31
795 0.35
796 0.39
797 0.37
798 0.4
799 0.42
800 0.43
801 0.49
802 0.55
803 0.58
804 0.56
805 0.55
806 0.57
807 0.57
808 0.54
809 0.51
810 0.49
811 0.49
812 0.56
813 0.63
814 0.6
815 0.65
816 0.7
817 0.67
818 0.64
819 0.58