Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8RXP8

Protein Details
Accession A0A3D8RXP8    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-53VGITKYFQRKKQSETPPPKRAPSPHydrophilic
265-293EKGTNSKKLKSQKRKRRDYRIARKAQFSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-289SKKLKSQKRKRRDYRIARKA
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 1, extr 1, pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MSLSDSDLSSLSSAPPSDEETMPMALDEPVGITKYFQRKKQSETPPPKRAPSPPHEYVLADNPDIAFIVMFRARFHEVFPRSTPHFGPQDIERGVEESTPGDHIERLLCALLGLVLNRKKDVERNHYTRPLEEAIQTHASQWPKAWEGKNPLHGGRNFASMSPEQRLQLLKSLILWSLSSSDAVQAKIKESYKQARHEDDLNQPLSVQPWGRDSLKRRYWLIEGLDDTHFRLYRESNPALKNVTWWSVAGTIPELQGVAAKLEEEKGTNSKKLKSQKRKRRDYRIARKAQFSRPEPGFSLYEGRTRGKKLKYTYSDDEDIFSDGLPPPRRSGRNTSGLSTPAEPAGPRFTASGRQVRSRAGGLYGESLLAGQREDTDIAEDDGTDRRQRTRATRMNGYAEYGMDDDEDTNSNDGQSSGNEWQGGEEEDENDFEGDDEDEVSGDESVLNGEPPSLVVQLRYGKQGDGNDTTEQRVKTGPAESQQTIVSDLPVQSAGQPAVIEQQQLGPMGNGPGGITPETRAGLDSKAAPVEAPVASAIPASNDGATREADGSAGTIVPPIQQPDGTV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.18
4 0.21
5 0.21
6 0.22
7 0.22
8 0.22
9 0.21
10 0.19
11 0.16
12 0.12
13 0.11
14 0.09
15 0.08
16 0.08
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.18
21 0.29
22 0.35
23 0.41
24 0.5
25 0.54
26 0.63
27 0.72
28 0.75
29 0.75
30 0.8
31 0.84
32 0.84
33 0.86
34 0.83
35 0.8
36 0.77
37 0.76
38 0.73
39 0.71
40 0.65
41 0.62
42 0.58
43 0.53
44 0.48
45 0.46
46 0.41
47 0.32
48 0.28
49 0.24
50 0.22
51 0.21
52 0.17
53 0.09
54 0.05
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.12
59 0.16
60 0.2
61 0.2
62 0.23
63 0.28
64 0.3
65 0.34
66 0.37
67 0.39
68 0.39
69 0.42
70 0.42
71 0.39
72 0.4
73 0.36
74 0.36
75 0.32
76 0.36
77 0.33
78 0.32
79 0.26
80 0.23
81 0.22
82 0.19
83 0.17
84 0.1
85 0.1
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.08
101 0.13
102 0.17
103 0.18
104 0.19
105 0.21
106 0.22
107 0.28
108 0.37
109 0.4
110 0.46
111 0.52
112 0.59
113 0.66
114 0.65
115 0.59
116 0.55
117 0.48
118 0.39
119 0.35
120 0.28
121 0.25
122 0.27
123 0.26
124 0.23
125 0.24
126 0.24
127 0.22
128 0.22
129 0.21
130 0.21
131 0.27
132 0.28
133 0.31
134 0.38
135 0.43
136 0.49
137 0.48
138 0.47
139 0.48
140 0.47
141 0.46
142 0.39
143 0.37
144 0.3
145 0.27
146 0.28
147 0.23
148 0.25
149 0.23
150 0.23
151 0.19
152 0.21
153 0.23
154 0.2
155 0.24
156 0.22
157 0.19
158 0.19
159 0.2
160 0.18
161 0.16
162 0.15
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.08
168 0.11
169 0.12
170 0.13
171 0.15
172 0.14
173 0.16
174 0.21
175 0.22
176 0.22
177 0.27
178 0.35
179 0.39
180 0.46
181 0.5
182 0.49
183 0.5
184 0.51
185 0.49
186 0.47
187 0.46
188 0.39
189 0.33
190 0.29
191 0.27
192 0.24
193 0.21
194 0.15
195 0.1
196 0.12
197 0.15
198 0.18
199 0.23
200 0.27
201 0.35
202 0.4
203 0.43
204 0.42
205 0.42
206 0.42
207 0.41
208 0.38
209 0.31
210 0.26
211 0.25
212 0.24
213 0.22
214 0.2
215 0.18
216 0.16
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.18
221 0.25
222 0.27
223 0.31
224 0.31
225 0.33
226 0.34
227 0.31
228 0.28
229 0.23
230 0.22
231 0.16
232 0.15
233 0.14
234 0.13
235 0.13
236 0.11
237 0.11
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.07
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.12
254 0.14
255 0.18
256 0.21
257 0.23
258 0.29
259 0.38
260 0.48
261 0.55
262 0.64
263 0.7
264 0.78
265 0.86
266 0.9
267 0.91
268 0.92
269 0.92
270 0.92
271 0.92
272 0.91
273 0.83
274 0.81
275 0.75
276 0.71
277 0.67
278 0.59
279 0.54
280 0.46
281 0.45
282 0.38
283 0.36
284 0.29
285 0.22
286 0.24
287 0.18
288 0.2
289 0.2
290 0.21
291 0.21
292 0.23
293 0.3
294 0.3
295 0.35
296 0.36
297 0.44
298 0.47
299 0.53
300 0.54
301 0.52
302 0.5
303 0.44
304 0.41
305 0.32
306 0.27
307 0.19
308 0.14
309 0.11
310 0.1
311 0.15
312 0.18
313 0.18
314 0.2
315 0.26
316 0.29
317 0.32
318 0.39
319 0.4
320 0.46
321 0.47
322 0.46
323 0.42
324 0.41
325 0.38
326 0.3
327 0.24
328 0.15
329 0.14
330 0.12
331 0.11
332 0.13
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.12
337 0.17
338 0.22
339 0.27
340 0.26
341 0.31
342 0.32
343 0.32
344 0.33
345 0.29
346 0.25
347 0.2
348 0.18
349 0.14
350 0.14
351 0.13
352 0.1
353 0.09
354 0.08
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.04
359 0.04
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.08
368 0.08
369 0.11
370 0.13
371 0.14
372 0.15
373 0.17
374 0.22
375 0.26
376 0.32
377 0.41
378 0.47
379 0.5
380 0.57
381 0.58
382 0.59
383 0.55
384 0.5
385 0.39
386 0.31
387 0.26
388 0.18
389 0.14
390 0.09
391 0.09
392 0.07
393 0.07
394 0.09
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.08
403 0.11
404 0.12
405 0.14
406 0.14
407 0.14
408 0.14
409 0.14
410 0.15
411 0.12
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.11
416 0.11
417 0.1
418 0.09
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.05
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.04
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.09
443 0.13
444 0.19
445 0.2
446 0.24
447 0.23
448 0.22
449 0.26
450 0.29
451 0.3
452 0.29
453 0.3
454 0.3
455 0.3
456 0.33
457 0.34
458 0.31
459 0.27
460 0.24
461 0.23
462 0.22
463 0.24
464 0.25
465 0.25
466 0.31
467 0.31
468 0.31
469 0.3
470 0.27
471 0.27
472 0.23
473 0.19
474 0.15
475 0.15
476 0.14
477 0.14
478 0.13
479 0.11
480 0.14
481 0.13
482 0.11
483 0.11
484 0.1
485 0.15
486 0.15
487 0.15
488 0.12
489 0.15
490 0.15
491 0.16
492 0.16
493 0.12
494 0.12
495 0.13
496 0.13
497 0.1
498 0.09
499 0.09
500 0.11
501 0.12
502 0.11
503 0.12
504 0.14
505 0.15
506 0.15
507 0.15
508 0.15
509 0.15
510 0.17
511 0.18
512 0.18
513 0.18
514 0.17
515 0.16
516 0.15
517 0.17
518 0.14
519 0.13
520 0.11
521 0.1
522 0.1
523 0.11
524 0.1
525 0.08
526 0.1
527 0.1
528 0.11
529 0.12
530 0.13
531 0.15
532 0.15
533 0.16
534 0.15
535 0.14
536 0.13
537 0.12
538 0.11
539 0.1
540 0.1
541 0.08
542 0.08
543 0.08
544 0.1
545 0.12
546 0.15
547 0.16