Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8QC86

Protein Details
Accession A0A3D8QC86    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MAPDKKDKKRKAVAATTVDSHydrophilic
36-62AENPKSILKKNKTKGAKENKASKPKTDHydrophilic
91-110KKADKETKAKPSAKKSKKEDBasic
182-204KIPDSKKAKRKILKLQKQNKAESHydrophilic
317-336KGRTREKWTKNIEQEQKRRLBasic
393-422DAEKTDDTPKKSKKEKKEKKKAIAEAPVESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-16KKDKKRKAVAAT
18-74VDSPAKKTKKVEAKAAEPAENPKSILKKNKTKGAKENKASKPKTDGDAPRSIKPRKR
91-126KKADKETKAKPSAKKSKKEDGTAAPVKEKSGKKAKK
186-195SKKAKRKILK
306-339PWNRIEQKRLNKGRTREKWTKNIEQEQKRRLAKA
401-447PKKSKKEKKEKKKAIAEAPVESPKPKAAAAASPATKSKKKSKSKSKA
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 13.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPDKKDKKRKAVAATTVDSPAKKTKKVEAKAAEPAENPKSILKKNKTKGAKENKASKPKTDGDAPRSIKPRKRAADYMSDEESEEEVPVKKADKETKAKPSAKKSKKEDGTAAPVKEKSGKKAKKLEIVPSDSEDEEVAPAVEESEEEDDQTTALIRGFESSGDEDESGDEAIDPDAPVPKIPDSKKAKRKILKLQKQNKAESSGNPGVVYVGRIPHGFYEHQMRAYFTQFGEITKLRLSRNRHTGKSKHYAFIEFASESVAKIVAATMDNYLMYGHILKCKYVPSEQLHPELWKGANRRFKATPWNRIEQKRLNKGRTREKWTKNIEQEQKRRLAKAEKLKELGYEMPLPELKSIDEVPFQEPEEEVKAVEGEQEAEAKAIEAPAEPAKADAEKTDDTPKKSKKEKKEKKKAIAEAPVESPKPKAAAAASPATKSKKKSKSKSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.76
3 0.69
4 0.63
5 0.57
6 0.47
7 0.41
8 0.42
9 0.4
10 0.42
11 0.43
12 0.49
13 0.56
14 0.62
15 0.68
16 0.66
17 0.66
18 0.7
19 0.7
20 0.63
21 0.54
22 0.55
23 0.48
24 0.42
25 0.37
26 0.33
27 0.35
28 0.39
29 0.48
30 0.51
31 0.58
32 0.65
33 0.73
34 0.78
35 0.79
36 0.83
37 0.84
38 0.84
39 0.83
40 0.85
41 0.86
42 0.87
43 0.82
44 0.76
45 0.73
46 0.67
47 0.63
48 0.61
49 0.6
50 0.56
51 0.63
52 0.62
53 0.61
54 0.64
55 0.68
56 0.65
57 0.65
58 0.69
59 0.66
60 0.7
61 0.7
62 0.67
63 0.69
64 0.69
65 0.66
66 0.58
67 0.51
68 0.43
69 0.37
70 0.32
71 0.22
72 0.16
73 0.12
74 0.11
75 0.12
76 0.13
77 0.14
78 0.16
79 0.23
80 0.3
81 0.38
82 0.44
83 0.51
84 0.6
85 0.68
86 0.73
87 0.73
88 0.76
89 0.78
90 0.8
91 0.82
92 0.79
93 0.8
94 0.79
95 0.77
96 0.73
97 0.68
98 0.68
99 0.64
100 0.58
101 0.52
102 0.45
103 0.41
104 0.43
105 0.39
106 0.37
107 0.42
108 0.47
109 0.51
110 0.61
111 0.65
112 0.66
113 0.68
114 0.69
115 0.66
116 0.65
117 0.58
118 0.51
119 0.47
120 0.38
121 0.34
122 0.25
123 0.17
124 0.12
125 0.1
126 0.07
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.09
168 0.11
169 0.17
170 0.19
171 0.28
172 0.35
173 0.45
174 0.54
175 0.61
176 0.68
177 0.69
178 0.76
179 0.77
180 0.8
181 0.79
182 0.81
183 0.82
184 0.81
185 0.81
186 0.76
187 0.68
188 0.62
189 0.54
190 0.45
191 0.44
192 0.37
193 0.31
194 0.27
195 0.25
196 0.19
197 0.17
198 0.16
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.17
209 0.17
210 0.19
211 0.19
212 0.19
213 0.18
214 0.2
215 0.2
216 0.13
217 0.15
218 0.13
219 0.13
220 0.15
221 0.14
222 0.14
223 0.15
224 0.18
225 0.16
226 0.22
227 0.28
228 0.31
229 0.41
230 0.47
231 0.5
232 0.54
233 0.59
234 0.61
235 0.64
236 0.6
237 0.53
238 0.49
239 0.45
240 0.38
241 0.34
242 0.29
243 0.19
244 0.16
245 0.14
246 0.13
247 0.11
248 0.1
249 0.08
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.07
264 0.07
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.14
269 0.16
270 0.19
271 0.19
272 0.25
273 0.25
274 0.33
275 0.36
276 0.38
277 0.37
278 0.35
279 0.34
280 0.3
281 0.26
282 0.23
283 0.24
284 0.28
285 0.35
286 0.36
287 0.41
288 0.4
289 0.41
290 0.48
291 0.52
292 0.55
293 0.53
294 0.6
295 0.62
296 0.66
297 0.71
298 0.68
299 0.7
300 0.7
301 0.73
302 0.73
303 0.72
304 0.76
305 0.79
306 0.79
307 0.78
308 0.78
309 0.77
310 0.78
311 0.79
312 0.8
313 0.78
314 0.78
315 0.79
316 0.79
317 0.8
318 0.78
319 0.79
320 0.72
321 0.66
322 0.62
323 0.6
324 0.58
325 0.6
326 0.62
327 0.59
328 0.59
329 0.57
330 0.52
331 0.47
332 0.41
333 0.33
334 0.27
335 0.2
336 0.21
337 0.22
338 0.22
339 0.19
340 0.18
341 0.15
342 0.15
343 0.16
344 0.15
345 0.16
346 0.17
347 0.19
348 0.2
349 0.2
350 0.18
351 0.17
352 0.18
353 0.18
354 0.17
355 0.14
356 0.13
357 0.13
358 0.12
359 0.13
360 0.11
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.08
370 0.07
371 0.06
372 0.09
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.14
378 0.14
379 0.15
380 0.13
381 0.16
382 0.17
383 0.2
384 0.3
385 0.34
386 0.38
387 0.48
388 0.54
389 0.59
390 0.68
391 0.75
392 0.76
393 0.82
394 0.88
395 0.9
396 0.93
397 0.94
398 0.94
399 0.95
400 0.93
401 0.91
402 0.89
403 0.82
404 0.74
405 0.69
406 0.64
407 0.56
408 0.48
409 0.4
410 0.33
411 0.31
412 0.27
413 0.24
414 0.21
415 0.25
416 0.29
417 0.36
418 0.35
419 0.36
420 0.42
421 0.45
422 0.48
423 0.49
424 0.55
425 0.57
426 0.66
427 0.74