Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8SVT9

Protein Details
Accession A0A3D8SVT9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
567-586EMVKEQQQNQPQNRNRGPREHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
581-609NRGPREGGRGDRGGRGGRGRGRGRGRGGN
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13.5, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016181  Acyl_CoA_acyltransferase  
IPR019467  Hat1_N  
IPR037113  Hat1_N_sf  
IPR017380  Hist_AcTrfase_B-typ_cat-su  
IPR034101  Lsm4  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0000781  C:chromosome, telomeric region  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0016573  P:histone acetylation  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
GO:0031509  P:subtelomeric heterochromatin formation  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10394  Hat1_N  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01723  LSm4  
Amino Acid Sequences MSTEDEWSCDANDAVQITIVQPDQQKPKTLSTFHPQFTYPIFGEDERIFGYKGLIIRLRFAAHNLRPHLHVSHDEKFTAVEDAEPTDVTGALKDFLPEEALSSLSEFESAVQEEDEKDFVPPGELAHSYSVRGRDYEIWAASLADPQVQLLLNRFQIMVSFFIEAGTPLTTDDPEWTLDRWTVYFVYEKVEPPTPKGSSYSIVGYATTYRWWFYKRDRSEQPTTKDWPFPAAEPVRPRELPSRLRIAQFLILPPHQGTGHGVNLYNTIHKACLDDSTIAELTVEDPNESFDVLRDSADYQILRPELLKNNININPDPWGEASKKTKRVPTLSLLPLKTLSDIRTAFKIEPTQFAHIQEMFLLSQIPLKNRRKGGANMARLLVKKHRDDDPNNRRYYWWRMLTKQRLYKRSRDVLIQLKMSERHTALEDTVTNVEDGYEQLFGFFDEREERLKAQQEEAEASNNREQRTKRKFTVEDEDDEEDESAAAKRPKLPLGLLTAAQGHPMLVELKNGETLNGHLANCDNWMNLILREVVQTSPEGDRFFKLPEVYVRGNNIKYLRIPEEIIEMVKEQQQNQPQNRNRGPREGGRGDRGGRGGRGRGRGRGRGGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.11
4 0.11
5 0.14
6 0.13
7 0.15
8 0.19
9 0.25
10 0.34
11 0.37
12 0.44
13 0.45
14 0.54
15 0.57
16 0.57
17 0.56
18 0.57
19 0.62
20 0.58
21 0.57
22 0.49
23 0.44
24 0.43
25 0.42
26 0.32
27 0.26
28 0.27
29 0.24
30 0.28
31 0.25
32 0.24
33 0.2
34 0.21
35 0.19
36 0.16
37 0.17
38 0.15
39 0.17
40 0.2
41 0.23
42 0.22
43 0.25
44 0.27
45 0.29
46 0.26
47 0.29
48 0.33
49 0.34
50 0.42
51 0.43
52 0.43
53 0.43
54 0.45
55 0.43
56 0.37
57 0.39
58 0.38
59 0.41
60 0.41
61 0.39
62 0.36
63 0.35
64 0.32
65 0.26
66 0.19
67 0.13
68 0.12
69 0.13
70 0.14
71 0.13
72 0.12
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.11
84 0.1
85 0.11
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.09
92 0.09
93 0.07
94 0.07
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.09
99 0.1
100 0.11
101 0.12
102 0.12
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.16
114 0.17
115 0.16
116 0.19
117 0.22
118 0.19
119 0.19
120 0.21
121 0.21
122 0.24
123 0.28
124 0.25
125 0.23
126 0.22
127 0.23
128 0.2
129 0.18
130 0.14
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.1
135 0.09
136 0.1
137 0.11
138 0.14
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.13
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.14
167 0.13
168 0.13
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.12
173 0.14
174 0.15
175 0.16
176 0.18
177 0.24
178 0.23
179 0.25
180 0.31
181 0.29
182 0.28
183 0.29
184 0.28
185 0.24
186 0.25
187 0.23
188 0.18
189 0.17
190 0.16
191 0.14
192 0.13
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.14
199 0.18
200 0.25
201 0.36
202 0.4
203 0.48
204 0.55
205 0.61
206 0.69
207 0.72
208 0.68
209 0.64
210 0.63
211 0.57
212 0.52
213 0.45
214 0.39
215 0.32
216 0.28
217 0.3
218 0.28
219 0.28
220 0.29
221 0.32
222 0.33
223 0.32
224 0.34
225 0.32
226 0.36
227 0.38
228 0.38
229 0.43
230 0.4
231 0.41
232 0.39
233 0.34
234 0.3
235 0.26
236 0.24
237 0.19
238 0.16
239 0.16
240 0.16
241 0.15
242 0.12
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.12
250 0.14
251 0.14
252 0.12
253 0.1
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.08
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.12
264 0.12
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.05
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.1
285 0.1
286 0.08
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.12
292 0.14
293 0.18
294 0.2
295 0.19
296 0.25
297 0.27
298 0.29
299 0.26
300 0.23
301 0.22
302 0.2
303 0.2
304 0.14
305 0.14
306 0.13
307 0.17
308 0.25
309 0.29
310 0.36
311 0.38
312 0.42
313 0.45
314 0.48
315 0.47
316 0.44
317 0.45
318 0.43
319 0.46
320 0.41
321 0.37
322 0.33
323 0.3
324 0.26
325 0.2
326 0.15
327 0.15
328 0.16
329 0.16
330 0.17
331 0.19
332 0.18
333 0.19
334 0.23
335 0.19
336 0.22
337 0.24
338 0.26
339 0.26
340 0.26
341 0.27
342 0.22
343 0.21
344 0.16
345 0.14
346 0.1
347 0.09
348 0.08
349 0.06
350 0.09
351 0.11
352 0.14
353 0.23
354 0.29
355 0.35
356 0.37
357 0.4
358 0.41
359 0.43
360 0.5
361 0.5
362 0.49
363 0.44
364 0.43
365 0.44
366 0.39
367 0.38
368 0.34
369 0.31
370 0.29
371 0.31
372 0.36
373 0.41
374 0.47
375 0.56
376 0.61
377 0.63
378 0.62
379 0.59
380 0.54
381 0.52
382 0.53
383 0.51
384 0.48
385 0.45
386 0.5
387 0.59
388 0.67
389 0.71
390 0.71
391 0.7
392 0.71
393 0.71
394 0.73
395 0.72
396 0.7
397 0.63
398 0.58
399 0.57
400 0.56
401 0.55
402 0.49
403 0.4
404 0.36
405 0.36
406 0.34
407 0.31
408 0.23
409 0.2
410 0.2
411 0.2
412 0.18
413 0.18
414 0.16
415 0.15
416 0.15
417 0.14
418 0.12
419 0.1
420 0.1
421 0.08
422 0.08
423 0.07
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.09
433 0.11
434 0.14
435 0.16
436 0.17
437 0.21
438 0.28
439 0.28
440 0.29
441 0.3
442 0.28
443 0.29
444 0.29
445 0.3
446 0.24
447 0.26
448 0.29
449 0.3
450 0.29
451 0.32
452 0.35
453 0.4
454 0.49
455 0.54
456 0.54
457 0.6
458 0.63
459 0.64
460 0.71
461 0.65
462 0.59
463 0.54
464 0.51
465 0.42
466 0.39
467 0.32
468 0.21
469 0.17
470 0.14
471 0.1
472 0.12
473 0.14
474 0.15
475 0.19
476 0.23
477 0.26
478 0.28
479 0.29
480 0.27
481 0.31
482 0.32
483 0.28
484 0.26
485 0.25
486 0.22
487 0.22
488 0.18
489 0.11
490 0.09
491 0.09
492 0.11
493 0.08
494 0.1
495 0.11
496 0.12
497 0.16
498 0.16
499 0.15
500 0.13
501 0.14
502 0.18
503 0.2
504 0.19
505 0.16
506 0.17
507 0.17
508 0.19
509 0.19
510 0.13
511 0.1
512 0.12
513 0.13
514 0.12
515 0.14
516 0.13
517 0.12
518 0.13
519 0.14
520 0.13
521 0.12
522 0.13
523 0.13
524 0.16
525 0.18
526 0.19
527 0.19
528 0.21
529 0.22
530 0.24
531 0.25
532 0.22
533 0.23
534 0.27
535 0.33
536 0.34
537 0.36
538 0.4
539 0.42
540 0.42
541 0.44
542 0.4
543 0.37
544 0.36
545 0.39
546 0.37
547 0.33
548 0.34
549 0.29
550 0.32
551 0.29
552 0.27
553 0.22
554 0.19
555 0.18
556 0.23
557 0.24
558 0.22
559 0.28
560 0.37
561 0.45
562 0.53
563 0.62
564 0.64
565 0.72
566 0.79
567 0.82
568 0.78
569 0.77
570 0.75
571 0.73
572 0.75
573 0.73
574 0.7
575 0.67
576 0.68
577 0.61
578 0.59
579 0.55
580 0.49
581 0.46
582 0.45
583 0.46
584 0.46
585 0.53
586 0.54
587 0.58
588 0.62
589 0.65