Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8RA48

Protein Details
Accession A0A3D8RA48    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
292-317ERQESRRRFRERSPPPRRRNEGRELFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
246-252RRRRGSE
297-311RRRFRERSPPPRRRN
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDMDMDLDLGPLPEPELIDTEQTLQASTAVPVDGAILDPQTAETQSEKVHIRGVDELTTDNIREFAISNFPHEQPARIEWIDDTSANIVYSAPEIGLQALAAMTHDGELEGGSSGDTAISNGLGDIPALRLRSAKVLASHPDSVLQVRSAVKTDKKKPRAHEASRFYMMHPEHDPRERLRRELASDRRRSVGDSDGDYQRRRFDGRELRRRRERDNEGGISASMYDDSGAGSADRSDGDGDWDRGRRRRGSERRDRDMELFPDEGARSGRLRHRSASPGRDTLMMEGGYIEERQESRRRFRERSPPPRRRNEGRELFGSSDADANSRELFPNKTANTYLKKELFPSKVSNHRRSDAIDVADETADLFARRISIPLVDGAHDTNNNASKRNRNIELFPSDKSERASVHIRGAAGGGQDQGFAIRGSAENGMSIKGRGGASVRELFPSKYHNNAGKELFSDKIEGRGGPRRKAEDMFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.12
4 0.13
5 0.14
6 0.15
7 0.17
8 0.18
9 0.18
10 0.17
11 0.14
12 0.14
13 0.13
14 0.13
15 0.11
16 0.09
17 0.09
18 0.08
19 0.09
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.08
27 0.09
28 0.09
29 0.1
30 0.11
31 0.13
32 0.14
33 0.19
34 0.21
35 0.2
36 0.25
37 0.24
38 0.25
39 0.27
40 0.28
41 0.25
42 0.23
43 0.23
44 0.21
45 0.22
46 0.2
47 0.16
48 0.14
49 0.12
50 0.12
51 0.12
52 0.1
53 0.17
54 0.17
55 0.22
56 0.25
57 0.26
58 0.31
59 0.31
60 0.32
61 0.27
62 0.3
63 0.32
64 0.27
65 0.28
66 0.22
67 0.25
68 0.24
69 0.21
70 0.19
71 0.14
72 0.15
73 0.14
74 0.13
75 0.1
76 0.08
77 0.09
78 0.08
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.06
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.11
119 0.15
120 0.16
121 0.17
122 0.18
123 0.21
124 0.25
125 0.29
126 0.29
127 0.25
128 0.25
129 0.24
130 0.22
131 0.19
132 0.15
133 0.13
134 0.14
135 0.14
136 0.15
137 0.19
138 0.25
139 0.33
140 0.43
141 0.51
142 0.59
143 0.64
144 0.67
145 0.74
146 0.77
147 0.77
148 0.77
149 0.73
150 0.7
151 0.68
152 0.64
153 0.53
154 0.49
155 0.41
156 0.34
157 0.31
158 0.28
159 0.27
160 0.31
161 0.33
162 0.3
163 0.4
164 0.38
165 0.37
166 0.39
167 0.38
168 0.39
169 0.47
170 0.53
171 0.53
172 0.57
173 0.56
174 0.53
175 0.5
176 0.46
177 0.39
178 0.34
179 0.27
180 0.24
181 0.26
182 0.29
183 0.32
184 0.32
185 0.31
186 0.27
187 0.26
188 0.25
189 0.22
190 0.26
191 0.34
192 0.43
193 0.53
194 0.59
195 0.66
196 0.73
197 0.76
198 0.73
199 0.72
200 0.68
201 0.66
202 0.65
203 0.58
204 0.49
205 0.45
206 0.39
207 0.29
208 0.22
209 0.14
210 0.06
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.08
226 0.09
227 0.11
228 0.13
229 0.17
230 0.19
231 0.24
232 0.28
233 0.29
234 0.33
235 0.43
236 0.51
237 0.57
238 0.66
239 0.7
240 0.73
241 0.73
242 0.7
243 0.62
244 0.56
245 0.48
246 0.39
247 0.31
248 0.23
249 0.21
250 0.18
251 0.15
252 0.12
253 0.11
254 0.09
255 0.12
256 0.18
257 0.23
258 0.25
259 0.27
260 0.3
261 0.37
262 0.43
263 0.47
264 0.45
265 0.41
266 0.4
267 0.39
268 0.35
269 0.28
270 0.24
271 0.17
272 0.12
273 0.1
274 0.1
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.06
279 0.07
280 0.11
281 0.18
282 0.22
283 0.3
284 0.39
285 0.47
286 0.5
287 0.57
288 0.65
289 0.68
290 0.75
291 0.78
292 0.8
293 0.83
294 0.88
295 0.88
296 0.86
297 0.83
298 0.82
299 0.79
300 0.73
301 0.66
302 0.59
303 0.52
304 0.45
305 0.37
306 0.27
307 0.2
308 0.16
309 0.14
310 0.12
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.12
315 0.12
316 0.14
317 0.16
318 0.23
319 0.22
320 0.24
321 0.26
322 0.31
323 0.35
324 0.37
325 0.41
326 0.38
327 0.38
328 0.4
329 0.45
330 0.43
331 0.4
332 0.42
333 0.41
334 0.48
335 0.56
336 0.61
337 0.58
338 0.57
339 0.55
340 0.52
341 0.51
342 0.46
343 0.38
344 0.31
345 0.26
346 0.25
347 0.22
348 0.19
349 0.14
350 0.09
351 0.08
352 0.07
353 0.06
354 0.05
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.1
360 0.1
361 0.13
362 0.13
363 0.12
364 0.13
365 0.14
366 0.15
367 0.15
368 0.15
369 0.16
370 0.22
371 0.22
372 0.26
373 0.29
374 0.35
375 0.44
376 0.51
377 0.52
378 0.49
379 0.53
380 0.55
381 0.58
382 0.52
383 0.46
384 0.45
385 0.41
386 0.39
387 0.37
388 0.33
389 0.26
390 0.29
391 0.34
392 0.29
393 0.33
394 0.33
395 0.31
396 0.28
397 0.27
398 0.24
399 0.18
400 0.17
401 0.13
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.09
406 0.09
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.09
412 0.11
413 0.11
414 0.12
415 0.12
416 0.14
417 0.14
418 0.14
419 0.12
420 0.15
421 0.15
422 0.15
423 0.16
424 0.17
425 0.22
426 0.28
427 0.28
428 0.28
429 0.3
430 0.3
431 0.3
432 0.36
433 0.34
434 0.35
435 0.42
436 0.45
437 0.48
438 0.52
439 0.53
440 0.47
441 0.46
442 0.42
443 0.36
444 0.3
445 0.3
446 0.24
447 0.26
448 0.26
449 0.25
450 0.28
451 0.36
452 0.42
453 0.46
454 0.52
455 0.53
456 0.56