FuNGI

A0A3D8SVD0

Protein Details

Accession

A0A3D8SVD0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-26	ATAISKTTSHPPKMKRPPPPFVQTG	Hydrophilic
402-421	SPLHRDPPPSPKRRKRTIAE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
412-416	PKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 10.333, mito 7.5, cyto_mito 5.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MATAISKTTSHPPKMKRPPPPFVQTGVNGTRPQPSSSSPPTTSKRLPGAGQSAATSSTSHPVPNGVNGIGNSSNTPTKGPLGRPRKDAQRPGEQGVKVQRQTPKTPSLESDRRLGKVFPEPHVKTTPYILKKFAKSPPSLILHLHPTHFRFEQQDGSFPYNSEMKVIIEHIRAGTVPHDMMEELLRANVRFYEGCLIVRVIDHKSVSAQARKSTAPSSNDNNTPFSIHNYNEHITPSAYVPYPKQNQLVSEKSTGNETTTEQSDSKDNVDGVSQDNSQEAGSASLKQAPPKPRVFTTVLHPTTRSLQAELTLLATTPDPKAAKQAAPVSARPQPPPGTVPPSPGASAQPEGGPVAKRQKMLIEPHELLECESKLTRALAPPLFLEPVSSLEDVHILLKYMESPLHRDPPPSPKRRKRTIAELAADEALAAEEERFMLIMDERLEPTTSGAAGGPKSAAVDDTGGAVPFEPRFSRFKTLENIRIQHEEKNRRENETKMKQEMVKRQQQEQERERRRITEQRQAEEQAKEENRRQQLAAQQAQAQLAAQQQNRQLMAQANGVSQPTQSSPVVRNQTPLNTSSPLVGNAMATQGSVPMAMTSSMQGAGSPQRPPSALQHAHPNMMSHPMVPSRSQQGQSRHGTPQMTQGTPAMSQATPIMRNVTPTQRMSHASPPRSSMAPTPVMNQAVMATPQMGNQVPLNAQQQQQLMLQRQQLLAQQGQHLNHSQLTPQQFAQLQANMLAQNNIQNHQQQQMMQQQQQNPQAAQQKFANPQAYQAQMMRAQLMQMQIAQQQQQQRQQQSQQQQQPQQQGQQQPQLQQGQMLQNSPQLNAQQQQILMAAAQANGGHMPQNMQGVNMPPRVNASQARYGQIYQQRLLRLRQEMATRLMPQYGPPTQYPPQVAQEYSVGLENAAKGFVQDMIRRERVELTAMQQRQQAQAVAHAQALQQQQHNMMQNGMGK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.75
2	0.81
3	0.82
4	0.83
5	0.83
6	0.84
7	0.83
8	0.76
9	0.69
10	0.67
11	0.59
12	0.58
13	0.54
14	0.5
15	0.44
16	0.41
17	0.44
18	0.4
19	0.39
20	0.34
21	0.33
22	0.37
23	0.43
24	0.49
25	0.46
26	0.52
27	0.55
28	0.6
29	0.61
30	0.6
31	0.59
32	0.55
33	0.53
34	0.52
35	0.52
36	0.48
37	0.43
38	0.37
39	0.31
40	0.28
41	0.26
42	0.2
43	0.16
44	0.17
45	0.17
46	0.17
47	0.16
48	0.19
49	0.2
50	0.22
51	0.24
52	0.2
53	0.22
54	0.21
55	0.25
56	0.22
57	0.22
58	0.19
59	0.19
60	0.22
61	0.2
62	0.21
63	0.19
64	0.24
65	0.29
66	0.36
67	0.43
68	0.5
69	0.55
70	0.6
71	0.65
72	0.7
73	0.74
74	0.76
75	0.73
76	0.73
77	0.73
78	0.72
79	0.72
80	0.62
81	0.58
82	0.59
83	0.6
84	0.51
85	0.52
86	0.54
87	0.52
88	0.58
89	0.59
90	0.58
91	0.53
92	0.55
93	0.53
94	0.56
95	0.58
96	0.54
97	0.55
98	0.51
99	0.49
100	0.48
101	0.44
102	0.39
103	0.4
104	0.43
105	0.41
106	0.46
107	0.47
108	0.5
109	0.54
110	0.51
111	0.43
112	0.45
113	0.49
114	0.46
115	0.47
116	0.49
117	0.51
118	0.54
119	0.59
120	0.6
121	0.58
122	0.53
123	0.54
124	0.55
125	0.53
126	0.5
127	0.45
128	0.41
129	0.41
130	0.4
131	0.39
132	0.35
133	0.32
134	0.35
135	0.34
136	0.33
137	0.29
138	0.3
139	0.36
140	0.33
141	0.37
142	0.36
143	0.39
144	0.37
145	0.33
146	0.33
147	0.28
148	0.27
149	0.22
150	0.19
151	0.15
152	0.15
153	0.18
154	0.19
155	0.17
156	0.18
157	0.16
158	0.16
159	0.15
160	0.15
161	0.14
162	0.12
163	0.11
164	0.1
165	0.11
166	0.1
167	0.11
168	0.11
169	0.1
170	0.08
171	0.1
172	0.1
173	0.1
174	0.11
175	0.1
176	0.12
177	0.11
178	0.13
179	0.16
180	0.16
181	0.17
182	0.18
183	0.17
184	0.15
185	0.16
186	0.17
187	0.14
188	0.16
189	0.16
190	0.15
191	0.16
192	0.21
193	0.26
194	0.3
195	0.3
196	0.3
197	0.33
198	0.34
199	0.36
200	0.35
201	0.36
202	0.34
203	0.36
204	0.39
205	0.42
206	0.46
207	0.45
208	0.43
209	0.37
210	0.35
211	0.3
212	0.29
213	0.27
214	0.23
215	0.25
216	0.28
217	0.28
218	0.27
219	0.27
220	0.23
221	0.2
222	0.2
223	0.17
224	0.15
225	0.15
226	0.16
227	0.17
228	0.24
229	0.29
230	0.32
231	0.34
232	0.33
233	0.36
234	0.41
235	0.44
236	0.39
237	0.38
238	0.36
239	0.32
240	0.34
241	0.3
242	0.24
243	0.2
244	0.18
245	0.17
246	0.18
247	0.2
248	0.17
249	0.18
250	0.2
251	0.2
252	0.2
253	0.19
254	0.17
255	0.15
256	0.15
257	0.15
258	0.14
259	0.15
260	0.14
261	0.12
262	0.12
263	0.12
264	0.11
265	0.11
266	0.09
267	0.08
268	0.09
269	0.1
270	0.1
271	0.15
272	0.17
273	0.2
274	0.27
275	0.31
276	0.37
277	0.42
278	0.45
279	0.41
280	0.46
281	0.46
282	0.41
283	0.41
284	0.45
285	0.42
286	0.39
287	0.38
288	0.34
289	0.34
290	0.37
291	0.31
292	0.21
293	0.19
294	0.19
295	0.19
296	0.18
297	0.15
298	0.1
299	0.09
300	0.08
301	0.08
302	0.08
303	0.07
304	0.11
305	0.11
306	0.11
307	0.17
308	0.2
309	0.21
310	0.24
311	0.28
312	0.3
313	0.32
314	0.33
315	0.32
316	0.35
317	0.37
318	0.33
319	0.34
320	0.3
321	0.29
322	0.31
323	0.31
324	0.32
325	0.3
326	0.32
327	0.3
328	0.29
329	0.28
330	0.25
331	0.22
332	0.17
333	0.18
334	0.15
335	0.13
336	0.11
337	0.11
338	0.12
339	0.12
340	0.13
341	0.2
342	0.23
343	0.23
344	0.23
345	0.26
346	0.3
347	0.35
348	0.36
349	0.34
350	0.32
351	0.33
352	0.33
353	0.29
354	0.25
355	0.22
356	0.17
357	0.12
358	0.11
359	0.1
360	0.1
361	0.11
362	0.12
363	0.11
364	0.17
365	0.16
366	0.17
367	0.17
368	0.17
369	0.17
370	0.15
371	0.13
372	0.09
373	0.1
374	0.12
375	0.11
376	0.1
377	0.09
378	0.1
379	0.1
380	0.1
381	0.07
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.06
386	0.06
387	0.08
388	0.08
389	0.13
390	0.16
391	0.22
392	0.23
393	0.24
394	0.27
395	0.36
396	0.45
397	0.5
398	0.57
399	0.61
400	0.69
401	0.77
402	0.82
403	0.76
404	0.77
405	0.77
406	0.74
407	0.66
408	0.58
409	0.5
410	0.42
411	0.36
412	0.26
413	0.16
414	0.08
415	0.05
416	0.04
417	0.03
418	0.03
419	0.03
420	0.03
421	0.03
422	0.03
423	0.03
424	0.04
425	0.05
426	0.07
427	0.07
428	0.08
429	0.09
430	0.09
431	0.09
432	0.09
433	0.08
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.07
438	0.06
439	0.07
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.05
444	0.05
445	0.04
446	0.05
447	0.04
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.06
455	0.07
456	0.06
457	0.08
458	0.11
459	0.14
460	0.2
461	0.21
462	0.24
463	0.3
464	0.35
465	0.41
466	0.42
467	0.41
468	0.38
469	0.41
470	0.39
471	0.38
472	0.41
473	0.43
474	0.43
475	0.5
476	0.49
477	0.5
478	0.52
479	0.51
480	0.53
481	0.52
482	0.53
483	0.46
484	0.47
485	0.46
486	0.49
487	0.54
488	0.51
489	0.5
490	0.47
491	0.5
492	0.53
493	0.56
494	0.58
495	0.57
496	0.6
497	0.6
498	0.63
499	0.59
500	0.56
501	0.55
502	0.56
503	0.53
504	0.51
505	0.49
506	0.46
507	0.48
508	0.48
509	0.46
510	0.38
511	0.33
512	0.31
513	0.29
514	0.29
515	0.3
516	0.35
517	0.33
518	0.34
519	0.33
520	0.29
521	0.31
522	0.36
523	0.35
524	0.3
525	0.29
526	0.29
527	0.29
528	0.25
529	0.2
530	0.13
531	0.13
532	0.17
533	0.15
534	0.17
535	0.19
536	0.22
537	0.22
538	0.21
539	0.19
540	0.17
541	0.18
542	0.17
543	0.16
544	0.14
545	0.14
546	0.14
547	0.13
548	0.1
549	0.09
550	0.08
551	0.1
552	0.1
553	0.12
554	0.14
555	0.21
556	0.26
557	0.25
558	0.27
559	0.25
560	0.28
561	0.28
562	0.27
563	0.23
564	0.2
565	0.2
566	0.19
567	0.18
568	0.15
569	0.14
570	0.12
571	0.09
572	0.08
573	0.08
574	0.07
575	0.06
576	0.05
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.03
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.05
586	0.05
587	0.06
588	0.05
589	0.05
590	0.06
591	0.11
592	0.13
593	0.14
594	0.15
595	0.16
596	0.17
597	0.19
598	0.22
599	0.28
600	0.28
601	0.27
602	0.37
603	0.37
604	0.38
605	0.36
606	0.32
607	0.23
608	0.25
609	0.24
610	0.14
611	0.15
612	0.15
613	0.16
614	0.17
615	0.19
616	0.2
617	0.24
618	0.27
619	0.32
620	0.36
621	0.43
622	0.46
623	0.48
624	0.44
625	0.44
626	0.41
627	0.36
628	0.39
629	0.35
630	0.31
631	0.27
632	0.25
633	0.23
634	0.22
635	0.22
636	0.16
637	0.1
638	0.11
639	0.12
640	0.14
641	0.13
642	0.13
643	0.17
644	0.14
645	0.18
646	0.21
647	0.25
648	0.28
649	0.29
650	0.3
651	0.3
652	0.33
653	0.34
654	0.4
655	0.41
656	0.41
657	0.4
658	0.42
659	0.41
660	0.38
661	0.36
662	0.3
663	0.27
664	0.28
665	0.27
666	0.26
667	0.28
668	0.27
669	0.26
670	0.22
671	0.17
672	0.13
673	0.13
674	0.11
675	0.08
676	0.08
677	0.09
678	0.11
679	0.11
680	0.11
681	0.11
682	0.12
683	0.12
684	0.15
685	0.17
686	0.18
687	0.19
688	0.22
689	0.22
690	0.22
691	0.25
692	0.26
693	0.27
694	0.28
695	0.3
696	0.28
697	0.28
698	0.28
699	0.28
700	0.27
701	0.25
702	0.23
703	0.25
704	0.26
705	0.27
706	0.27
707	0.26
708	0.24
709	0.23
710	0.22
711	0.19
712	0.2
713	0.23
714	0.23
715	0.21
716	0.23
717	0.23
718	0.24
719	0.26
720	0.23
721	0.2
722	0.19
723	0.2
724	0.17
725	0.16
726	0.15
727	0.12
728	0.15
729	0.16
730	0.17
731	0.18
732	0.2
733	0.21
734	0.24
735	0.26
736	0.22
737	0.27
738	0.34
739	0.38
740	0.4
741	0.43
742	0.46
743	0.51
744	0.56
745	0.53
746	0.44
747	0.44
748	0.48
749	0.43
750	0.41
751	0.38
752	0.38
753	0.39
754	0.45
755	0.44
756	0.35
757	0.38
758	0.39
759	0.37
760	0.33
761	0.3
762	0.27
763	0.25
764	0.26
765	0.23
766	0.18
767	0.16
768	0.17
769	0.17
770	0.14
771	0.12
772	0.13
773	0.15
774	0.17
775	0.19
776	0.21
777	0.27
778	0.33
779	0.4
780	0.47
781	0.49
782	0.54
783	0.59
784	0.64
785	0.66
786	0.7
787	0.71
788	0.72
789	0.74
790	0.74
791	0.76
792	0.71
793	0.68
794	0.65
795	0.63
796	0.61
797	0.62
798	0.58
799	0.53
800	0.56
801	0.53
802	0.47
803	0.41
804	0.4
805	0.38
806	0.36
807	0.33
808	0.28
809	0.29
810	0.3
811	0.28
812	0.26
813	0.22
814	0.24
815	0.25
816	0.27
817	0.24
818	0.23
819	0.23
820	0.21
821	0.19
822	0.15
823	0.13
824	0.11
825	0.08
826	0.09
827	0.08
828	0.08
829	0.08
830	0.08
831	0.09
832	0.08
833	0.1
834	0.12
835	0.17
836	0.16
837	0.16
838	0.18
839	0.22
840	0.28
841	0.31
842	0.29
843	0.25
844	0.3
845	0.3
846	0.33
847	0.33
848	0.33
849	0.36
850	0.39
851	0.42
852	0.39
853	0.39
854	0.42
855	0.44
856	0.43
857	0.37
858	0.39
859	0.43
860	0.45
861	0.49
862	0.48
863	0.46
864	0.45
865	0.46
866	0.47
867	0.44
868	0.45
869	0.44
870	0.41
871	0.37
872	0.36
873	0.31
874	0.28
875	0.32
876	0.31
877	0.31
878	0.29
879	0.35
880	0.36
881	0.42
882	0.43
883	0.4
884	0.42
885	0.42
886	0.41
887	0.36
888	0.34
889	0.29
890	0.27
891	0.24
892	0.17
893	0.13
894	0.14
895	0.13
896	0.12
897	0.11
898	0.1
899	0.08
900	0.09
901	0.13
902	0.17
903	0.2
904	0.25
905	0.32
906	0.37
907	0.37
908	0.38
909	0.38
910	0.35
911	0.35
912	0.32
913	0.29
914	0.35
915	0.36
916	0.37
917	0.37
918	0.38
919	0.37
920	0.38
921	0.35
922	0.26
923	0.31
924	0.32
925	0.3
926	0.28
927	0.26
928	0.23
929	0.26
930	0.3
931	0.28
932	0.27
933	0.28
934	0.31
935	0.36
936	0.42
937	0.37
938	0.33

A0A3D8SVD0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer