Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8SVC2

Protein Details
Accession A0A3D8SVC2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
528-556TDDKMAPAGKQKKKWSKGKVKDKAQHAVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
535-550AGKQKKKWSKGKVKDK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.333, nucl 10.5, cyto 9, cyto_mito 7.999, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004977  Ribosomal_S25  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03297  Ribosomal_S25  
Amino Acid Sequences MSRICPTPTSSIDAAGSTSSPIALSDDGEFAAQINGKDLIIHLNPTSSDFKEVQIVRVKEVGCKFLRFSRRQGTAKSRRLFCANDTRIVTWDLDPLQQYAEIENVEPGALNIDYGADENEIVAFHAFNTKLTIFGLDSGRSHIIKSPKFSHQNGFGYRPKTGQLAILLKPETSDLLTVHEAQSYEVIGRDTLPTVDAQGLKWSPDGRWIAIWETASAGTKVLIFTADGQLFRTYTGLPESDGLFDLGVRSIEWSPIAAHNGLSPALAVGKVDGTVDLLGTKTFSCSSTLSHVLQSDQYSPSIWRERYAAGGMALEYAESPSSSAFSNFPEPMGTPRGVSLMGFSHDGNLLSTVDQTRPNIVWIWSLEKTPSLISVLIHEHAVRQVIWHHSCTQLLITTANNALPGVRYWSSHRSPCIVRIPIPRSESGKYDVRWLSSDGTENSRFWFGSQDDYILGFVALDEERGPEFKGMNTLGGRMSSGSQVTEPGPVTSPGLRVTIHVTAVFPTRILHLGLTSDAFSLAALNNHTDDKMAPAGKQKKKWSKGKVKDKAQHAVVLEKATAERLNKDVQSYRLITVATLVDRLKINGSLARKALADLEEKGQIKKVVGHSKMNIYTRAVTAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.2
3 0.18
4 0.12
5 0.12
6 0.09
7 0.08
8 0.08
9 0.1
10 0.09
11 0.1
12 0.11
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.11
17 0.09
18 0.11
19 0.12
20 0.11
21 0.12
22 0.13
23 0.13
24 0.13
25 0.13
26 0.17
27 0.16
28 0.19
29 0.16
30 0.17
31 0.18
32 0.22
33 0.26
34 0.21
35 0.25
36 0.23
37 0.24
38 0.3
39 0.31
40 0.33
41 0.38
42 0.38
43 0.35
44 0.39
45 0.39
46 0.37
47 0.39
48 0.4
49 0.34
50 0.36
51 0.36
52 0.4
53 0.5
54 0.47
55 0.53
56 0.55
57 0.61
58 0.63
59 0.69
60 0.72
61 0.72
62 0.78
63 0.78
64 0.73
65 0.68
66 0.68
67 0.62
68 0.58
69 0.58
70 0.52
71 0.5
72 0.49
73 0.46
74 0.42
75 0.41
76 0.36
77 0.26
78 0.27
79 0.21
80 0.21
81 0.2
82 0.19
83 0.18
84 0.17
85 0.17
86 0.13
87 0.13
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.07
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.08
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.1
113 0.11
114 0.11
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.15
119 0.16
120 0.11
121 0.15
122 0.17
123 0.14
124 0.15
125 0.18
126 0.21
127 0.19
128 0.2
129 0.21
130 0.27
131 0.3
132 0.36
133 0.38
134 0.44
135 0.51
136 0.53
137 0.54
138 0.54
139 0.58
140 0.56
141 0.57
142 0.53
143 0.49
144 0.47
145 0.42
146 0.35
147 0.3
148 0.26
149 0.22
150 0.22
151 0.24
152 0.25
153 0.28
154 0.26
155 0.24
156 0.24
157 0.22
158 0.17
159 0.12
160 0.12
161 0.08
162 0.11
163 0.13
164 0.13
165 0.13
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.09
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.08
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.16
189 0.16
190 0.13
191 0.2
192 0.21
193 0.17
194 0.18
195 0.19
196 0.19
197 0.2
198 0.2
199 0.13
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.11
204 0.09
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.07
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.08
221 0.08
222 0.1
223 0.08
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.09
243 0.11
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.09
249 0.08
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.03
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.08
272 0.09
273 0.1
274 0.14
275 0.17
276 0.17
277 0.17
278 0.17
279 0.16
280 0.17
281 0.17
282 0.15
283 0.12
284 0.12
285 0.11
286 0.12
287 0.15
288 0.19
289 0.18
290 0.17
291 0.18
292 0.18
293 0.19
294 0.19
295 0.15
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.07
300 0.07
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.04
309 0.04
310 0.06
311 0.06
312 0.08
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.13
319 0.15
320 0.14
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.11
325 0.1
326 0.09
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.06
338 0.07
339 0.08
340 0.09
341 0.1
342 0.11
343 0.12
344 0.12
345 0.13
346 0.13
347 0.13
348 0.13
349 0.12
350 0.17
351 0.15
352 0.15
353 0.15
354 0.14
355 0.14
356 0.12
357 0.12
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.1
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.1
366 0.09
367 0.1
368 0.11
369 0.08
370 0.07
371 0.1
372 0.16
373 0.18
374 0.19
375 0.2
376 0.21
377 0.21
378 0.21
379 0.18
380 0.13
381 0.12
382 0.11
383 0.09
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.09
388 0.08
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.1
393 0.1
394 0.12
395 0.16
396 0.23
397 0.28
398 0.31
399 0.32
400 0.32
401 0.33
402 0.38
403 0.42
404 0.38
405 0.39
406 0.44
407 0.46
408 0.47
409 0.48
410 0.45
411 0.41
412 0.4
413 0.37
414 0.33
415 0.35
416 0.3
417 0.35
418 0.33
419 0.31
420 0.3
421 0.3
422 0.27
423 0.23
424 0.26
425 0.2
426 0.24
427 0.25
428 0.24
429 0.24
430 0.23
431 0.21
432 0.18
433 0.21
434 0.16
435 0.19
436 0.19
437 0.18
438 0.17
439 0.18
440 0.17
441 0.12
442 0.11
443 0.06
444 0.05
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.07
451 0.08
452 0.09
453 0.09
454 0.1
455 0.1
456 0.14
457 0.14
458 0.17
459 0.17
460 0.17
461 0.16
462 0.16
463 0.16
464 0.12
465 0.13
466 0.11
467 0.11
468 0.1
469 0.1
470 0.12
471 0.12
472 0.14
473 0.14
474 0.13
475 0.14
476 0.14
477 0.16
478 0.16
479 0.17
480 0.15
481 0.16
482 0.15
483 0.15
484 0.18
485 0.18
486 0.18
487 0.17
488 0.15
489 0.15
490 0.19
491 0.18
492 0.14
493 0.12
494 0.13
495 0.14
496 0.14
497 0.13
498 0.1
499 0.11
500 0.12
501 0.12
502 0.11
503 0.1
504 0.09
505 0.08
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.09
510 0.09
511 0.1
512 0.12
513 0.13
514 0.13
515 0.12
516 0.12
517 0.13
518 0.18
519 0.18
520 0.19
521 0.28
522 0.38
523 0.46
524 0.54
525 0.61
526 0.66
527 0.75
528 0.83
529 0.85
530 0.86
531 0.89
532 0.92
533 0.91
534 0.91
535 0.89
536 0.87
537 0.85
538 0.76
539 0.7
540 0.6
541 0.54
542 0.46
543 0.4
544 0.32
545 0.24
546 0.22
547 0.19
548 0.21
549 0.18
550 0.19
551 0.2
552 0.26
553 0.26
554 0.31
555 0.33
556 0.33
557 0.38
558 0.38
559 0.36
560 0.32
561 0.31
562 0.25
563 0.23
564 0.23
565 0.17
566 0.18
567 0.17
568 0.18
569 0.19
570 0.2
571 0.2
572 0.18
573 0.2
574 0.22
575 0.25
576 0.27
577 0.28
578 0.29
579 0.26
580 0.26
581 0.27
582 0.25
583 0.24
584 0.21
585 0.24
586 0.29
587 0.3
588 0.3
589 0.31
590 0.31
591 0.29
592 0.33
593 0.39
594 0.42
595 0.46
596 0.52
597 0.52
598 0.59
599 0.64
600 0.62
601 0.56
602 0.49
603 0.47