Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8QMS4

Protein Details
Accession A0A3D8QMS4    Localization Confidence Low Confidence Score 6.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-72WLETERAKRNQENNFQRRRRRSQRLDVKIGHGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 16, cyto_nucl 12.833, nucl 7.5, mito_nucl 5.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MSGEKIYEGVFAVHKPQGVTSADVIRKLQEHFNPSDLFKPWLETERAKRNQENNFQRRRRRSQRLDVKIGHGGTLDPLATGVLVAGVGKGTKFLNSFLGCTKSYETVVIFGAETDTYDVSGKIVRRAPYEHITREAVEKALEQFRGKIMQRPPIFSALRVQGKKLYEYAREGKEPPIEIQSRPVEVTDLRVVEWYEPGTHEYKWPEKEAPADEKAVAEKLLAKDDSLPVATAAADADASSKRKSPPVEGSKGDEATSDTSAVKKQKVSTEGDAAPAPEKSDVPEAEEEKTAETKPESPEESKPLPPPPAVKITMTVSSGFYVRSLAHDLGKALGSCGLMCSLIRSRQADFTLEPDRILEYRDLEAGEEVWGPKVKGFLEEWEQKRAAEEGKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.19
4 0.23
5 0.23
6 0.25
7 0.24
8 0.3
9 0.31
10 0.32
11 0.33
12 0.3
13 0.31
14 0.31
15 0.35
16 0.32
17 0.36
18 0.37
19 0.41
20 0.41
21 0.4
22 0.42
23 0.37
24 0.35
25 0.28
26 0.3
27 0.28
28 0.31
29 0.34
30 0.36
31 0.43
32 0.5
33 0.58
34 0.61
35 0.66
36 0.68
37 0.73
38 0.76
39 0.79
40 0.78
41 0.81
42 0.83
43 0.86
44 0.88
45 0.89
46 0.9
47 0.9
48 0.89
49 0.9
50 0.91
51 0.91
52 0.9
53 0.83
54 0.76
55 0.71
56 0.61
57 0.5
58 0.39
59 0.3
60 0.21
61 0.18
62 0.14
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.05
68 0.04
69 0.03
70 0.03
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.04
75 0.04
76 0.05
77 0.06
78 0.08
79 0.09
80 0.1
81 0.17
82 0.17
83 0.19
84 0.21
85 0.25
86 0.23
87 0.24
88 0.25
89 0.21
90 0.2
91 0.2
92 0.17
93 0.15
94 0.15
95 0.13
96 0.11
97 0.09
98 0.09
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.1
108 0.11
109 0.15
110 0.2
111 0.21
112 0.24
113 0.27
114 0.31
115 0.35
116 0.4
117 0.37
118 0.36
119 0.35
120 0.34
121 0.33
122 0.29
123 0.22
124 0.17
125 0.15
126 0.15
127 0.17
128 0.18
129 0.16
130 0.16
131 0.17
132 0.22
133 0.22
134 0.26
135 0.27
136 0.34
137 0.35
138 0.38
139 0.38
140 0.39
141 0.39
142 0.32
143 0.33
144 0.31
145 0.37
146 0.34
147 0.32
148 0.3
149 0.31
150 0.31
151 0.3
152 0.27
153 0.22
154 0.27
155 0.32
156 0.31
157 0.32
158 0.32
159 0.31
160 0.3
161 0.29
162 0.25
163 0.24
164 0.23
165 0.21
166 0.26
167 0.24
168 0.22
169 0.22
170 0.2
171 0.15
172 0.14
173 0.16
174 0.13
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.11
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.12
188 0.15
189 0.2
190 0.22
191 0.24
192 0.23
193 0.22
194 0.26
195 0.27
196 0.28
197 0.25
198 0.24
199 0.22
200 0.21
201 0.2
202 0.17
203 0.13
204 0.08
205 0.1
206 0.1
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.12
211 0.13
212 0.14
213 0.11
214 0.1
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.05
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.05
224 0.07
225 0.09
226 0.1
227 0.13
228 0.15
229 0.19
230 0.21
231 0.25
232 0.34
233 0.4
234 0.45
235 0.44
236 0.48
237 0.47
238 0.46
239 0.4
240 0.3
241 0.23
242 0.19
243 0.18
244 0.14
245 0.11
246 0.11
247 0.16
248 0.19
249 0.2
250 0.21
251 0.24
252 0.28
253 0.32
254 0.37
255 0.36
256 0.38
257 0.36
258 0.35
259 0.32
260 0.27
261 0.24
262 0.19
263 0.16
264 0.11
265 0.1
266 0.11
267 0.15
268 0.15
269 0.17
270 0.21
271 0.22
272 0.23
273 0.24
274 0.22
275 0.19
276 0.21
277 0.17
278 0.15
279 0.16
280 0.18
281 0.2
282 0.24
283 0.27
284 0.28
285 0.32
286 0.37
287 0.39
288 0.39
289 0.4
290 0.4
291 0.4
292 0.39
293 0.38
294 0.36
295 0.39
296 0.37
297 0.33
298 0.32
299 0.31
300 0.32
301 0.29
302 0.26
303 0.2
304 0.19
305 0.18
306 0.15
307 0.12
308 0.11
309 0.1
310 0.12
311 0.15
312 0.16
313 0.17
314 0.18
315 0.18
316 0.19
317 0.2
318 0.18
319 0.14
320 0.14
321 0.12
322 0.11
323 0.11
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.13
328 0.16
329 0.2
330 0.25
331 0.27
332 0.29
333 0.34
334 0.36
335 0.35
336 0.31
337 0.32
338 0.32
339 0.3
340 0.28
341 0.23
342 0.24
343 0.21
344 0.23
345 0.19
346 0.17
347 0.18
348 0.2
349 0.19
350 0.17
351 0.17
352 0.15
353 0.14
354 0.14
355 0.13
356 0.14
357 0.16
358 0.16
359 0.16
360 0.19
361 0.18
362 0.2
363 0.21
364 0.24
365 0.3
366 0.4
367 0.42
368 0.46
369 0.46
370 0.42
371 0.43
372 0.4