FuNGI

A0A3D8SUH3

Protein Details

Accession

A0A3D8SUH3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
408-432	QEAEYRRKLKQKRQERKGKNQDGGP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
413-441	RRKLKQKRQERKGKNQDGGPKAARGPPGP
490-512	GRGRGRGSDRGGRGGRGRGRGGR

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 13.5, cyto 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MTEPHNQNNPGVAPEDVPAKLIDMIDTPPIALTPADEGSDFYNTPFVVGTPATTAQKPEDKDDNMVTEAPVSSNPPPMIPGLSLVNDGLNQNQTSPTPGAKENPNGTDPMILSTETTNESQPATVQNGSETKIEETAKPAVGGTDAMEVEQEHKQPQGGSGANGGLEESDKTATGTNGTENATVESAATGQAEQEQEEEHPEWEMDSDPYESSSDSSDSDFSDDSDEDEDYPILSPEEQARILMQGELGSDDEGDGKGKAGAPLKTANEIMEDCLPIPDITITPEMKIILLGNVEAVVENTVLIAANVTGEYQVLESGSLLCLEDRRVAGVVSETLGRVENPLYTVRFPTTAEVEERGLSKGAVVYYVVEHSTFVFTQPLKGLKGSDASNFHDEEVAEDEVEFSDDEQEAEYRRKLKQKRQERKGKNQDGGPKAARGPPGPSKLSHSELNYDDNEDGYTPLARPKNLHEMMRQEAPVENDGFNRNSGYGGRGRGRGSDRGGRGGRGRGRGGRDQSHHDRQPYHQQERSEAQSQSQPQPQPQPYPAFNPQQYPAYSTLPQQPQQQQPYTQAAMPTAPFNFQMPYQQAYQQPNPYQQMSPTPHINPMFLAALQQQQQVQQYQQTQAQAQPQQQQSGVGQPQQNQAMNFDQVKAQLDLLRHLSNGQNQWPPRQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.23
3	0.18
4	0.18
5	0.16
6	0.16
7	0.16
8	0.15
9	0.15
10	0.12
11	0.14
12	0.15
13	0.15
14	0.13
15	0.12
16	0.12
17	0.11
18	0.1
19	0.09
20	0.1
21	0.11
22	0.12
23	0.12
24	0.13
25	0.14
26	0.17
27	0.17
28	0.14
29	0.16
30	0.15
31	0.15
32	0.14
33	0.12
34	0.12
35	0.12
36	0.12
37	0.13
38	0.17
39	0.19
40	0.19
41	0.21
42	0.24
43	0.3
44	0.31
45	0.34
46	0.39
47	0.39
48	0.42
49	0.43
50	0.41
51	0.37
52	0.35
53	0.29
54	0.23
55	0.2
56	0.17
57	0.15
58	0.15
59	0.15
60	0.2
61	0.2
62	0.19
63	0.2
64	0.2
65	0.21
66	0.18
67	0.18
68	0.15
69	0.16
70	0.16
71	0.15
72	0.14
73	0.14
74	0.14
75	0.14
76	0.15
77	0.14
78	0.14
79	0.15
80	0.15
81	0.18
82	0.2
83	0.19
84	0.2
85	0.22
86	0.26
87	0.3
88	0.37
89	0.38
90	0.4
91	0.4
92	0.37
93	0.35
94	0.33
95	0.28
96	0.23
97	0.19
98	0.15
99	0.14
100	0.14
101	0.15
102	0.14
103	0.15
104	0.13
105	0.13
106	0.13
107	0.13
108	0.13
109	0.15
110	0.16
111	0.16
112	0.16
113	0.18
114	0.2
115	0.21
116	0.21
117	0.2
118	0.17
119	0.2
120	0.22
121	0.19
122	0.21
123	0.23
124	0.22
125	0.21
126	0.19
127	0.15
128	0.14
129	0.14
130	0.11
131	0.1
132	0.09
133	0.09
134	0.09
135	0.09
136	0.12
137	0.14
138	0.15
139	0.13
140	0.14
141	0.15
142	0.15
143	0.17
144	0.2
145	0.18
146	0.17
147	0.18
148	0.18
149	0.16
150	0.16
151	0.14
152	0.08
153	0.08
154	0.07
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.07
159	0.09
160	0.09
161	0.1
162	0.1
163	0.1
164	0.12
165	0.14
166	0.14
167	0.13
168	0.14
169	0.13
170	0.12
171	0.1
172	0.08
173	0.07
174	0.06
175	0.06
176	0.05
177	0.05
178	0.08
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.09
183	0.09
184	0.12
185	0.13
186	0.11
187	0.11
188	0.11
189	0.1
190	0.1
191	0.11
192	0.08
193	0.08
194	0.09
195	0.09
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.09
200	0.1
201	0.1
202	0.09
203	0.1
204	0.1
205	0.1
206	0.11
207	0.11
208	0.1
209	0.11
210	0.1
211	0.1
212	0.11
213	0.11
214	0.09
215	0.1
216	0.1
217	0.08
218	0.08
219	0.07
220	0.06
221	0.06
222	0.07
223	0.08
224	0.1
225	0.1
226	0.1
227	0.1
228	0.11
229	0.11
230	0.1
231	0.08
232	0.06
233	0.06
234	0.07
235	0.07
236	0.06
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.06
242	0.05
243	0.05
244	0.06
245	0.07
246	0.1
247	0.13
248	0.14
249	0.15
250	0.2
251	0.2
252	0.21
253	0.21
254	0.18
255	0.16
256	0.15
257	0.15
258	0.12
259	0.11
260	0.09
261	0.09
262	0.09
263	0.07
264	0.07
265	0.06
266	0.05
267	0.07
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.11
272	0.11
273	0.1
274	0.1
275	0.08
276	0.06
277	0.06
278	0.05
279	0.05
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.02
293	0.02
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.05
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.05
320	0.06
321	0.05
322	0.05
323	0.06
324	0.05
325	0.06
326	0.06
327	0.05
328	0.07
329	0.08
330	0.09
331	0.1
332	0.11
333	0.11
334	0.11
335	0.11
336	0.11
337	0.12
338	0.12
339	0.12
340	0.13
341	0.13
342	0.12
343	0.13
344	0.12
345	0.1
346	0.09
347	0.08
348	0.08
349	0.07
350	0.06
351	0.06
352	0.05
353	0.06
354	0.07
355	0.07
356	0.05
357	0.06
358	0.06
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.09
363	0.09
364	0.1
365	0.13
366	0.14
367	0.14
368	0.14
369	0.14
370	0.12
371	0.15
372	0.15
373	0.17
374	0.18
375	0.2
376	0.22
377	0.21
378	0.2
379	0.19
380	0.17
381	0.15
382	0.15
383	0.12
384	0.1
385	0.09
386	0.09
387	0.08
388	0.09
389	0.07
390	0.04
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.06
395	0.07
396	0.08
397	0.11
398	0.13
399	0.15
400	0.19
401	0.28
402	0.36
403	0.45
404	0.53
405	0.62
406	0.71
407	0.79
408	0.86
409	0.87
410	0.9
411	0.92
412	0.9
413	0.83
414	0.78
415	0.76
416	0.69
417	0.65
418	0.55
419	0.46
420	0.39
421	0.38
422	0.35
423	0.27
424	0.28
425	0.29
426	0.33
427	0.33
428	0.32
429	0.34
430	0.37
431	0.39
432	0.37
433	0.31
434	0.3
435	0.3
436	0.33
437	0.28
438	0.25
439	0.21
440	0.18
441	0.17
442	0.13
443	0.11
444	0.08
445	0.08
446	0.07
447	0.13
448	0.16
449	0.16
450	0.18
451	0.22
452	0.32
453	0.35
454	0.37
455	0.35
456	0.38
457	0.41
458	0.43
459	0.38
460	0.28
461	0.27
462	0.26
463	0.24
464	0.21
465	0.18
466	0.16
467	0.19
468	0.19
469	0.17
470	0.16
471	0.14
472	0.13
473	0.13
474	0.14
475	0.15
476	0.2
477	0.23
478	0.25
479	0.26
480	0.3
481	0.34
482	0.35
483	0.37
484	0.39
485	0.38
486	0.43
487	0.43
488	0.4
489	0.4
490	0.43
491	0.43
492	0.4
493	0.43
494	0.4
495	0.44
496	0.49
497	0.52
498	0.51
499	0.5
500	0.53
501	0.58
502	0.62
503	0.62
504	0.59
505	0.56
506	0.53
507	0.61
508	0.62
509	0.61
510	0.55
511	0.52
512	0.53
513	0.55
514	0.56
515	0.51
516	0.41
517	0.36
518	0.38
519	0.41
520	0.42
521	0.44
522	0.41
523	0.39
524	0.49
525	0.51
526	0.5
527	0.51
528	0.51
529	0.47
530	0.51
531	0.54
532	0.53
533	0.5
534	0.48
535	0.45
536	0.44
537	0.42
538	0.39
539	0.35
540	0.31
541	0.31
542	0.3
543	0.37
544	0.37
545	0.41
546	0.45
547	0.49
548	0.54
549	0.6
550	0.61
551	0.55
552	0.54
553	0.56
554	0.5
555	0.44
556	0.36
557	0.3
558	0.27
559	0.25
560	0.22
561	0.17
562	0.16
563	0.16
564	0.16
565	0.16
566	0.15
567	0.2
568	0.21
569	0.23
570	0.24
571	0.28
572	0.33
573	0.39
574	0.45
575	0.46
576	0.48
577	0.52
578	0.54
579	0.53
580	0.48
581	0.43
582	0.46
583	0.44
584	0.45
585	0.43
586	0.41
587	0.45
588	0.45
589	0.43
590	0.34
591	0.3
592	0.27
593	0.21
594	0.21
595	0.16
596	0.2
597	0.22
598	0.23
599	0.21
600	0.23
601	0.27
602	0.28
603	0.28
604	0.3
605	0.32
606	0.34
607	0.37
608	0.37
609	0.35
610	0.36
611	0.42
612	0.41
613	0.43
614	0.47
615	0.47
616	0.47
617	0.45
618	0.43
619	0.37
620	0.4
621	0.38
622	0.36
623	0.36
624	0.37
625	0.43
626	0.46
627	0.48
628	0.4
629	0.4
630	0.37
631	0.39
632	0.36
633	0.31
634	0.27
635	0.26
636	0.28
637	0.26
638	0.24
639	0.22
640	0.22
641	0.25
642	0.28
643	0.27
644	0.24
645	0.26
646	0.29
647	0.33
648	0.37
649	0.39
650	0.43

A0A3D8SUH3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer