FuNGI

A0A3D8RXM9

Protein Details

Accession

A0A3D8RXM9

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MASDKAEKKRKRASDRHERPTKKPALD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-23	AEKKRKRASDRHERPTKK
323-329	KGRGNKR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MASDKAEKKRKRASDRHERPTKKPALDLQSLPPLSASLIHDDNELAPVLLNTPGVTSQPNIRLNPYLKTRSHSSTHHSGNDGIASTELLLQSSEHPKLDFIGREANDDADSQLKHYVAVVDPASKTWEFVEIRRVTLRGAVRKAAETEEEEEESEDEDTKTMREQRNDLTYTFGTKKSRKATQSQAENAQLSNAPSGTATAAESALLSSMPAESALDIAAKSAAVQAEVQAAKPLPQANLDAKHPSEVYPLETLIPNGNATLRQLPIKDWQDTISAGLTVATTSRYVSSRIDDIVESGNTTYLQILRFILVLLELARALRSGKGRGNKRLPSRDDLRRILSGGSKSSSDNSTDDLSSSQSTIPDPIIDGIRRKFAPNGSTVSPNDILLLETTICALTLHLPPQPVKDGVPTPNGGNSPNEMATDPSDLRDDLQLDNAKITQYFRELGCRVDKPRETEFAKFGIRGGKAEAATRRVARLKIPVEFPKVSRAGGSRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.9
3	0.92
4	0.92
5	0.88
6	0.84
7	0.84
8	0.83
9	0.75
10	0.71
11	0.69
12	0.66
13	0.66
14	0.63
15	0.58
16	0.58
17	0.54
18	0.47
19	0.38
20	0.31
21	0.24
22	0.25
23	0.21
24	0.16
25	0.18
26	0.18
27	0.19
28	0.19
29	0.19
30	0.17
31	0.15
32	0.1
33	0.08
34	0.08
35	0.09
36	0.09
37	0.09
38	0.07
39	0.08
40	0.09
41	0.1
42	0.11
43	0.11
44	0.17
45	0.25
46	0.31
47	0.31
48	0.34
49	0.4
50	0.41
51	0.47
52	0.48
53	0.48
54	0.44
55	0.48
56	0.51
57	0.49
58	0.52
59	0.49
60	0.48
61	0.5
62	0.54
63	0.52
64	0.48
65	0.44
66	0.4
67	0.38
68	0.3
69	0.22
70	0.16
71	0.12
72	0.1
73	0.11
74	0.1
75	0.08
76	0.08
77	0.08
78	0.12
79	0.18
80	0.19
81	0.18
82	0.19
83	0.19
84	0.21
85	0.25
86	0.22
87	0.19
88	0.25
89	0.25
90	0.28
91	0.28
92	0.27
93	0.23
94	0.22
95	0.2
96	0.16
97	0.15
98	0.13
99	0.15
100	0.14
101	0.13
102	0.13
103	0.15
104	0.11
105	0.15
106	0.15
107	0.15
108	0.15
109	0.16
110	0.19
111	0.17
112	0.17
113	0.14
114	0.2
115	0.18
116	0.19
117	0.29
118	0.26
119	0.29
120	0.3
121	0.3
122	0.23
123	0.27
124	0.32
125	0.29
126	0.31
127	0.32
128	0.31
129	0.32
130	0.33
131	0.29
132	0.25
133	0.2
134	0.21
135	0.2
136	0.19
137	0.18
138	0.17
139	0.16
140	0.14
141	0.12
142	0.1
143	0.08
144	0.07
145	0.07
146	0.07
147	0.11
148	0.18
149	0.22
150	0.24
151	0.27
152	0.32
153	0.39
154	0.41
155	0.37
156	0.34
157	0.3
158	0.32
159	0.31
160	0.31
161	0.3
162	0.32
163	0.38
164	0.4
165	0.47
166	0.47
167	0.51
168	0.57
169	0.59
170	0.63
171	0.6
172	0.58
173	0.54
174	0.5
175	0.43
176	0.34
177	0.27
178	0.19
179	0.16
180	0.11
181	0.08
182	0.07
183	0.08
184	0.07
185	0.06
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.09
215	0.1
216	0.1
217	0.09
218	0.09
219	0.1
220	0.12
221	0.13
222	0.09
223	0.1
224	0.13
225	0.15
226	0.17
227	0.18
228	0.18
229	0.17
230	0.18
231	0.17
232	0.15
233	0.14
234	0.12
235	0.13
236	0.11
237	0.11
238	0.11
239	0.11
240	0.11
241	0.09
242	0.09
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.06
247	0.07
248	0.09
249	0.09
250	0.1
251	0.1
252	0.12
253	0.19
254	0.22
255	0.23
256	0.21
257	0.21
258	0.21
259	0.21
260	0.2
261	0.13
262	0.09
263	0.08
264	0.07
265	0.06
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.04
270	0.05
271	0.06
272	0.07
273	0.09
274	0.1
275	0.12
276	0.12
277	0.13
278	0.13
279	0.12
280	0.12
281	0.13
282	0.11
283	0.1
284	0.09
285	0.09
286	0.08
287	0.08
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.08
292	0.08
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.07
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.05
305	0.06
306	0.08
307	0.1
308	0.14
309	0.19
310	0.27
311	0.34
312	0.44
313	0.52
314	0.56
315	0.63
316	0.68
317	0.68
318	0.67
319	0.68
320	0.67
321	0.66
322	0.63
323	0.57
324	0.49
325	0.46
326	0.4
327	0.37
328	0.3
329	0.24
330	0.22
331	0.19
332	0.19
333	0.2
334	0.2
335	0.18
336	0.17
337	0.17
338	0.17
339	0.16
340	0.16
341	0.15
342	0.15
343	0.13
344	0.13
345	0.12
346	0.1
347	0.11
348	0.12
349	0.11
350	0.1
351	0.1
352	0.11
353	0.13
354	0.15
355	0.19
356	0.19
357	0.25
358	0.25
359	0.26
360	0.29
361	0.3
362	0.31
363	0.29
364	0.32
365	0.3
366	0.34
367	0.33
368	0.34
369	0.3
370	0.27
371	0.24
372	0.19
373	0.17
374	0.12
375	0.13
376	0.08
377	0.07
378	0.08
379	0.07
380	0.07
381	0.06
382	0.06
383	0.08
384	0.11
385	0.13
386	0.15
387	0.17
388	0.18
389	0.22
390	0.25
391	0.23
392	0.21
393	0.24
394	0.27
395	0.29
396	0.32
397	0.3
398	0.28
399	0.31
400	0.31
401	0.27
402	0.24
403	0.23
404	0.22
405	0.21
406	0.21
407	0.17
408	0.18
409	0.18
410	0.21
411	0.19
412	0.17
413	0.18
414	0.17
415	0.18
416	0.19
417	0.19
418	0.15
419	0.22
420	0.25
421	0.24
422	0.25
423	0.25
424	0.22
425	0.22
426	0.23
427	0.19
428	0.18
429	0.2
430	0.2
431	0.27
432	0.27
433	0.3
434	0.36
435	0.39
436	0.41
437	0.47
438	0.51
439	0.49
440	0.53
441	0.57
442	0.54
443	0.53
444	0.51
445	0.47
446	0.46
447	0.4
448	0.37
449	0.36
450	0.33
451	0.29
452	0.3
453	0.29
454	0.27
455	0.33
456	0.36
457	0.32
458	0.37
459	0.38
460	0.4
461	0.4
462	0.42
463	0.4
464	0.45
465	0.46
466	0.46
467	0.52
468	0.53
469	0.55
470	0.57
471	0.54
472	0.53
473	0.5
474	0.45
475	0.41

A0A3D8RXM9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer