Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8SWY0

Protein Details
Accession A0A3D8SWY0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-56GTYQNHAPRRRPRPSAAQVRRDLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
554-593GGPQGRGRGQAPGRGGPRGGGGGGAQRGGGQRGRGQPANR
Subcellular Location(s) cyto 15.5, cyto_nucl 11.5, nucl 6.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences METLSSALADLDLGSQGIGGKTFDELIAEEENGTYQNHAPRRRPRPSAAQVRRDLENEFLTPSPRFSSEWLNRLQRRWDVSTDYNDLFEVAGTQTRTIVRFDREGLEGRVTGYHEVTVPANSANAKNSTSLLRRPAGRADFVRGAAGFFPFAPGGLDGVEAIAEMETEIQTAGPSGAAGKQAGLDRIINFGTEGGLLEVAPGFSRGLKFEETKSKEAAEEDEEVENTLQQEESNINPDQDETSSDVGGVKIDDEESADEDEEEEDIDSLLPVEFPSLEPRAPLLSALQKKAGKEWAHLVDVNKEITNFHELVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFKNEFDDVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTQEFASWVGRTKKKDIYVISTAKRPVPLEHYLWAGKDKFKIVDSNKRFLENGWKQADDIISGKDKLKAQKAAEAQAQSQASRGGPQGRGRGQAPGRGGPRGGGGGGAQRGGGQRGRGQPANRGTGNIARTGRGGGRTTAAQDRTVWVQVVQHLRKENLLPACIFVFSKKRCEQNADSLSNQDFCNAAEKSLIHMTIEKSLTRLKAEDRTLPQILRLRELLSRGIAVHHGGLLPIMKEIVEILFAKTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGKSFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDNVGYVIVVNSGRDEAPPAGALRKMILGDPTKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHEKQVQLSEASLEKIKREPCEICDVDIATSHDASIEYAKLTSELHLNLLSSPVGKRLLMPKRLVVYQKDGYRTAGVIVREVGGGANPVIQILEIGKLTSKRHPSEILPFLPAFRGFLNPLPTRAADMTLKVFKIPITDIECVTNTIVKLSGPTWYLNIKKEAMRFADKELSKLCSSWTTPVWDELDWARIKELQLRDILDKRRDQASIAQSCDCLKCPNFLKHFEMQRDEWQIKENISQLKQLMSDQNLQLLPDYEQRIQVLKDLGFVDEQSRVQLKGKVACEIHSADELVLTELILENVLAEYEPEEIVALLSAFVFQEKTENVPTLTPRLEKGKEAIVRISEKVNDVQIQHQVLQSTEDINDFASQPRFGLAEVVYEWAKGMSFNRITDLTDVMEGTIVRTITRLDETCREVKNAAKLVGDPTLYAKMQEAQEKIKRDVIFAASLYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.06
3 0.07
4 0.08
5 0.08
6 0.08
7 0.08
8 0.09
9 0.1
10 0.1
11 0.09
12 0.09
13 0.12
14 0.13
15 0.13
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.13
20 0.12
21 0.12
22 0.14
23 0.22
24 0.3
25 0.38
26 0.46
27 0.56
28 0.66
29 0.73
30 0.77
31 0.76
32 0.8
33 0.82
34 0.85
35 0.84
36 0.84
37 0.82
38 0.78
39 0.74
40 0.65
41 0.56
42 0.49
43 0.42
44 0.34
45 0.29
46 0.26
47 0.26
48 0.25
49 0.26
50 0.24
51 0.23
52 0.23
53 0.23
54 0.33
55 0.37
56 0.42
57 0.48
58 0.55
59 0.58
60 0.61
61 0.66
62 0.62
63 0.61
64 0.59
65 0.56
66 0.53
67 0.54
68 0.55
69 0.54
70 0.48
71 0.41
72 0.36
73 0.32
74 0.24
75 0.19
76 0.14
77 0.09
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.15
82 0.17
83 0.19
84 0.21
85 0.25
86 0.25
87 0.28
88 0.3
89 0.31
90 0.31
91 0.34
92 0.34
93 0.32
94 0.28
95 0.25
96 0.25
97 0.23
98 0.22
99 0.19
100 0.17
101 0.14
102 0.16
103 0.16
104 0.14
105 0.14
106 0.12
107 0.13
108 0.15
109 0.16
110 0.18
111 0.19
112 0.19
113 0.2
114 0.21
115 0.26
116 0.28
117 0.32
118 0.35
119 0.37
120 0.4
121 0.42
122 0.48
123 0.46
124 0.47
125 0.45
126 0.45
127 0.44
128 0.41
129 0.4
130 0.32
131 0.29
132 0.23
133 0.21
134 0.15
135 0.11
136 0.12
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.09
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.03
151 0.03
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.12
168 0.14
169 0.15
170 0.16
171 0.16
172 0.15
173 0.18
174 0.18
175 0.15
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.09
180 0.08
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.08
191 0.09
192 0.1
193 0.13
194 0.17
195 0.19
196 0.24
197 0.34
198 0.39
199 0.41
200 0.41
201 0.39
202 0.37
203 0.36
204 0.33
205 0.25
206 0.22
207 0.21
208 0.21
209 0.2
210 0.19
211 0.18
212 0.16
213 0.13
214 0.11
215 0.09
216 0.07
217 0.09
218 0.09
219 0.11
220 0.14
221 0.15
222 0.14
223 0.14
224 0.15
225 0.16
226 0.14
227 0.15
228 0.14
229 0.15
230 0.14
231 0.14
232 0.14
233 0.13
234 0.12
235 0.1
236 0.07
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.09
249 0.08
250 0.07
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.11
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.15
270 0.13
271 0.2
272 0.25
273 0.27
274 0.33
275 0.33
276 0.34
277 0.37
278 0.42
279 0.34
280 0.32
281 0.37
282 0.35
283 0.35
284 0.37
285 0.35
286 0.32
287 0.32
288 0.31
289 0.24
290 0.2
291 0.18
292 0.17
293 0.21
294 0.17
295 0.15
296 0.17
297 0.16
298 0.18
299 0.19
300 0.17
301 0.14
302 0.16
303 0.16
304 0.14
305 0.15
306 0.14
307 0.14
308 0.14
309 0.15
310 0.15
311 0.17
312 0.19
313 0.17
314 0.17
315 0.17
316 0.17
317 0.19
318 0.18
319 0.17
320 0.15
321 0.15
322 0.14
323 0.14
324 0.13
325 0.1
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.07
353 0.08
354 0.1
355 0.11
356 0.18
357 0.19
358 0.21
359 0.23
360 0.26
361 0.26
362 0.3
363 0.37
364 0.38
365 0.46
366 0.47
367 0.52
368 0.54
369 0.54
370 0.6
371 0.53
372 0.48
373 0.45
374 0.45
375 0.38
376 0.33
377 0.32
378 0.22
379 0.19
380 0.15
381 0.09
382 0.06
383 0.07
384 0.07
385 0.06
386 0.07
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.11
406 0.1
407 0.09
408 0.1
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.08
417 0.07
418 0.07
419 0.09
420 0.07
421 0.06
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.09
426 0.09
427 0.07
428 0.09
429 0.09
430 0.07
431 0.07
432 0.08
433 0.09
434 0.08
435 0.08
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.05
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.04
453 0.05
454 0.05
455 0.06
456 0.07
457 0.06
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.11
463 0.12
464 0.12
465 0.17
466 0.24
467 0.29
468 0.32
469 0.36
470 0.39
471 0.4
472 0.45
473 0.42
474 0.41
475 0.44
476 0.47
477 0.44
478 0.43
479 0.41
480 0.37
481 0.37
482 0.31
483 0.25
484 0.25
485 0.27
486 0.25
487 0.24
488 0.26
489 0.24
490 0.24
491 0.25
492 0.21
493 0.19
494 0.19
495 0.19
496 0.18
497 0.18
498 0.25
499 0.27
500 0.36
501 0.39
502 0.43
503 0.43
504 0.43
505 0.42
506 0.35
507 0.41
508 0.35
509 0.38
510 0.34
511 0.33
512 0.32
513 0.33
514 0.33
515 0.23
516 0.19
517 0.13
518 0.12
519 0.13
520 0.14
521 0.16
522 0.19
523 0.23
524 0.27
525 0.31
526 0.3
527 0.35
528 0.37
529 0.36
530 0.37
531 0.33
532 0.28
533 0.27
534 0.26
535 0.2
536 0.18
537 0.16
538 0.12
539 0.13
540 0.14
541 0.13
542 0.16
543 0.2
544 0.25
545 0.26
546 0.29
547 0.28
548 0.33
549 0.3
550 0.3
551 0.29
552 0.28
553 0.27
554 0.25
555 0.25
556 0.19
557 0.18
558 0.14
559 0.12
560 0.07
561 0.06
562 0.08
563 0.08
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.08
568 0.09
569 0.1
570 0.09
571 0.14
572 0.18
573 0.22
574 0.24
575 0.25
576 0.3
577 0.33
578 0.37
579 0.33
580 0.29
581 0.27
582 0.28
583 0.28
584 0.26
585 0.22
586 0.17
587 0.17
588 0.17
589 0.17
590 0.15
591 0.16
592 0.11
593 0.12
594 0.12
595 0.14
596 0.17
597 0.17
598 0.15
599 0.14
600 0.15
601 0.15
602 0.16
603 0.14
604 0.1
605 0.1
606 0.13
607 0.21
608 0.21
609 0.22
610 0.23
611 0.24
612 0.25
613 0.24
614 0.25
615 0.18
616 0.18
617 0.16
618 0.15
619 0.15
620 0.14
621 0.13
622 0.1
623 0.16
624 0.16
625 0.23
626 0.26
627 0.31
628 0.32
629 0.39
630 0.4
631 0.43
632 0.49
633 0.44
634 0.41
635 0.38
636 0.36
637 0.31
638 0.28
639 0.19
640 0.12
641 0.09
642 0.13
643 0.12
644 0.11
645 0.11
646 0.11
647 0.12
648 0.14
649 0.13
650 0.09
651 0.11
652 0.11
653 0.14
654 0.15
655 0.13
656 0.13
657 0.15
658 0.16
659 0.15
660 0.16
661 0.14
662 0.19
663 0.21
664 0.26
665 0.26
666 0.3
667 0.31
668 0.3
669 0.31
670 0.29
671 0.28
672 0.24
673 0.22
674 0.19
675 0.18
676 0.2
677 0.17
678 0.12
679 0.12
680 0.1
681 0.1
682 0.09
683 0.08
684 0.07
685 0.06
686 0.06
687 0.05
688 0.05
689 0.05
690 0.05
691 0.04
692 0.04
693 0.04
694 0.04
695 0.04
696 0.04
697 0.05
698 0.05
699 0.05
700 0.06
701 0.06
702 0.07
703 0.06
704 0.08
705 0.07
706 0.07
707 0.06
708 0.06
709 0.08
710 0.08
711 0.09
712 0.08
713 0.08
714 0.08
715 0.08
716 0.07
717 0.06
718 0.07
719 0.07
720 0.07
721 0.07
722 0.06
723 0.07
724 0.07
725 0.07
726 0.08
727 0.1
728 0.12
729 0.18
730 0.19
731 0.24
732 0.25
733 0.25
734 0.29
735 0.32
736 0.32
737 0.33
738 0.36
739 0.32
740 0.35
741 0.35
742 0.32
743 0.3
744 0.27
745 0.22
746 0.18
747 0.17
748 0.13
749 0.13
750 0.11
751 0.08
752 0.09
753 0.11
754 0.11
755 0.12
756 0.13
757 0.13
758 0.14
759 0.15
760 0.14
761 0.11
762 0.11
763 0.1
764 0.09
765 0.07
766 0.07
767 0.05
768 0.05
769 0.05
770 0.05
771 0.06
772 0.06
773 0.08
774 0.07
775 0.07
776 0.08
777 0.09
778 0.09
779 0.1
780 0.1
781 0.08
782 0.09
783 0.09
784 0.09
785 0.13
786 0.13
787 0.16
788 0.18
789 0.21
790 0.23
791 0.25
792 0.26
793 0.25
794 0.28
795 0.32
796 0.32
797 0.37
798 0.36
799 0.38
800 0.38
801 0.36
802 0.32
803 0.25
804 0.22
805 0.15
806 0.13
807 0.09
808 0.07
809 0.06
810 0.05
811 0.06
812 0.06
813 0.07
814 0.09
815 0.11
816 0.13
817 0.14
818 0.14
819 0.15
820 0.16
821 0.18
822 0.17
823 0.2
824 0.2
825 0.2
826 0.21
827 0.2
828 0.19
829 0.17
830 0.17
831 0.15
832 0.15
833 0.15
834 0.16
835 0.16
836 0.16
837 0.17
838 0.17
839 0.14
840 0.12
841 0.12
842 0.1
843 0.11
844 0.14
845 0.13
846 0.13
847 0.18
848 0.21
849 0.21
850 0.25
851 0.26
852 0.26
853 0.34
854 0.34
855 0.3
856 0.29
857 0.27
858 0.23
859 0.23
860 0.21
861 0.13
862 0.12
863 0.1
864 0.09
865 0.09
866 0.09
867 0.08
868 0.07
869 0.07
870 0.07
871 0.07
872 0.07
873 0.08
874 0.08
875 0.09
876 0.09
877 0.1
878 0.11
879 0.11
880 0.1
881 0.11
882 0.1
883 0.09
884 0.09
885 0.1
886 0.11
887 0.11
888 0.13
889 0.21
890 0.29
891 0.34
892 0.36
893 0.37
894 0.39
895 0.43
896 0.45
897 0.39
898 0.38
899 0.38
900 0.4
901 0.4
902 0.38
903 0.35
904 0.32
905 0.29
906 0.24
907 0.22
908 0.17
909 0.15
910 0.14
911 0.13
912 0.12
913 0.12
914 0.09
915 0.06
916 0.06
917 0.05
918 0.06
919 0.05
920 0.05
921 0.05
922 0.05
923 0.05
924 0.05
925 0.07
926 0.05
927 0.06
928 0.08
929 0.11
930 0.14
931 0.21
932 0.28
933 0.28
934 0.32
935 0.35
936 0.37
937 0.43
938 0.47
939 0.42
940 0.37
941 0.35
942 0.32
943 0.31
944 0.27
945 0.2
946 0.14
947 0.14
948 0.13
949 0.17
950 0.24
951 0.22
952 0.24
953 0.25
954 0.25
955 0.25
956 0.24
957 0.24
958 0.17
959 0.18
960 0.21
961 0.22
962 0.22
963 0.19
964 0.19
965 0.16
966 0.18
967 0.17
968 0.17
969 0.19
970 0.21
971 0.21
972 0.23
973 0.23
974 0.22
975 0.22
976 0.18
977 0.13
978 0.12
979 0.12
980 0.1
981 0.11
982 0.1
983 0.12
984 0.12
985 0.12
986 0.14
987 0.19
988 0.23
989 0.25
990 0.29
991 0.29
992 0.31
993 0.33
994 0.36
995 0.35
996 0.38
997 0.36
998 0.37
999 0.43
1000 0.39
1001 0.39
1002 0.36
1003 0.36
1004 0.3
1005 0.29
1006 0.26
1007 0.22
1008 0.24
1009 0.25
1010 0.25
1011 0.26
1012 0.26
1013 0.29
1014 0.29
1015 0.24
1016 0.24
1017 0.21
1018 0.25
1019 0.21
1020 0.21
1021 0.19
1022 0.19
1023 0.2
1024 0.25
1025 0.27
1026 0.24
1027 0.26
1028 0.28
1029 0.33
1030 0.37
1031 0.44
1032 0.43
1033 0.44
1034 0.44
1035 0.44
1036 0.42
1037 0.39
1038 0.4
1039 0.42
1040 0.42
1041 0.41
1042 0.38
1043 0.35
1044 0.37
1045 0.37
1046 0.3
1047 0.27
1048 0.22
1049 0.26
1050 0.32
1051 0.4
1052 0.43
1053 0.46
1054 0.51
1055 0.53
1056 0.59
1057 0.58
1058 0.57
1059 0.51
1060 0.53
1061 0.56
1062 0.51
1063 0.44
1064 0.41
1065 0.37
1066 0.34
1067 0.34
1068 0.32
1069 0.31
1070 0.32
1071 0.34
1072 0.3
1073 0.3
1074 0.3
1075 0.3
1076 0.3
1077 0.26
1078 0.3
1079 0.27
1080 0.31
1081 0.29
1082 0.28
1083 0.26
1084 0.22
1085 0.21
1086 0.21
1087 0.25
1088 0.21
1089 0.23
1090 0.24
1091 0.26
1092 0.25
1093 0.26
1094 0.25
1095 0.2
1096 0.23
1097 0.21
1098 0.21
1099 0.19
1100 0.19
1101 0.17
1102 0.16
1103 0.16
1104 0.16
1105 0.17
1106 0.18
1107 0.2
1108 0.25
1109 0.27
1110 0.32
1111 0.33
1112 0.36
1113 0.35
1114 0.35
1115 0.36
1116 0.33
1117 0.31
1118 0.25
1119 0.24
1120 0.17
1121 0.17
1122 0.16
1123 0.13
1124 0.11
1125 0.09
1126 0.07
1127 0.07
1128 0.07
1129 0.06
1130 0.05
1131 0.04
1132 0.04
1133 0.05
1134 0.04
1135 0.04
1136 0.05
1137 0.06
1138 0.06
1139 0.06
1140 0.06
1141 0.06
1142 0.06
1143 0.06
1144 0.06
1145 0.04
1146 0.04
1147 0.05
1148 0.05
1149 0.05
1150 0.06
1151 0.05
1152 0.09
1153 0.1
1154 0.14
1155 0.17
1156 0.19
1157 0.2
1158 0.23
1159 0.26
1160 0.27
1161 0.3
1162 0.28
1163 0.28
1164 0.34
1165 0.36
1166 0.35
1167 0.35
1168 0.39
1169 0.39
1170 0.4
1171 0.41
1172 0.38
1173 0.39
1174 0.38
1175 0.39
1176 0.32
1177 0.31
1178 0.3
1179 0.3
1180 0.28
1181 0.27
1182 0.29
1183 0.31
1184 0.32
1185 0.31
1186 0.31
1187 0.27
1188 0.25
1189 0.25
1190 0.22
1191 0.18
1192 0.16
1193 0.15
1194 0.13
1195 0.13
1196 0.15
1197 0.13
1198 0.16
1199 0.17
1200 0.17
1201 0.16
1202 0.17
1203 0.17
1204 0.15
1205 0.18
1206 0.13
1207 0.14
1208 0.14
1209 0.17
1210 0.15
1211 0.15
1212 0.15
1213 0.12
1214 0.12
1215 0.1
1216 0.12
1217 0.18
1218 0.21
1219 0.22
1220 0.25
1221 0.26
1222 0.28
1223 0.28
1224 0.28
1225 0.2
1226 0.18
1227 0.17
1228 0.14
1229 0.14
1230 0.12
1231 0.11
1232 0.13
1233 0.11
1234 0.1
1235 0.11
1236 0.12
1237 0.13
1238 0.19
1239 0.2
1240 0.22
1241 0.28
1242 0.34
1243 0.4
1244 0.42
1245 0.42
1246 0.39
1247 0.42
1248 0.46
1249 0.46
1250 0.43
1251 0.37
1252 0.36
1253 0.37
1254 0.39
1255 0.34
1256 0.26
1257 0.23
1258 0.25
1259 0.24
1260 0.23
1261 0.22
1262 0.23
1263 0.27
1264 0.32
1265 0.33
1266 0.36
1267 0.43
1268 0.48
1269 0.5
1270 0.51
1271 0.47
1272 0.43
1273 0.44
1274 0.39
1275 0.36