Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8R9P9

Protein Details
Accession A0A3D8R9P9    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-100EETGKKRKRGGGKRHVDPNABasic
221-244AKEPTPPPTKQRRRSEGKPSKDVSHydrophilic
254-295NESPEKRRRGAAKKDEPSKSIGGGDSKRSRKKRKSDVGDDDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-96KKRKRGGGKRHV
227-287PPTKQRRRSEGKPSKDVSSPVVEKKGRNESPEKRRRGAAKKDEPSKSIGGGDSKRSRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.166, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MAKIGSKTVTVDVEELTKARDSFLSKLAQLQSLTLELSREYINHTNAILGTGNEAEVDLVATINTLAASLKGNAQAADADEETGKKRKRGGGKRHVDPNAPKRTLTPFFLYMHHNRASIAAELGDDAKPRDVSAEGTRRWAEMPESQKEVWKKLYADNLATYREKVALYKAGLSFEKDDDNDKAADQLHLDVAAAEGSDEEEEEEEEEEEEQEQESSPEPAKEPTPPPTKQRRRSEGKPSKDVSSPVVEKKGRNESPEKRRRGAAKKDEPSKSIGGGDSKRSRKKRKSDVGDDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.16
4 0.17
5 0.16
6 0.16
7 0.19
8 0.2
9 0.22
10 0.27
11 0.29
12 0.26
13 0.33
14 0.33
15 0.33
16 0.3
17 0.27
18 0.24
19 0.21
20 0.21
21 0.15
22 0.14
23 0.1
24 0.12
25 0.11
26 0.1
27 0.15
28 0.2
29 0.21
30 0.22
31 0.22
32 0.21
33 0.21
34 0.22
35 0.17
36 0.11
37 0.11
38 0.1
39 0.1
40 0.08
41 0.08
42 0.06
43 0.05
44 0.06
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.03
53 0.03
54 0.04
55 0.06
56 0.06
57 0.09
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.13
65 0.11
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.13
70 0.21
71 0.22
72 0.22
73 0.27
74 0.33
75 0.43
76 0.53
77 0.61
78 0.64
79 0.71
80 0.76
81 0.8
82 0.77
83 0.72
84 0.71
85 0.69
86 0.68
87 0.6
88 0.53
89 0.46
90 0.5
91 0.47
92 0.41
93 0.36
94 0.29
95 0.29
96 0.31
97 0.34
98 0.31
99 0.32
100 0.3
101 0.26
102 0.23
103 0.23
104 0.22
105 0.17
106 0.14
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.1
120 0.16
121 0.22
122 0.21
123 0.25
124 0.25
125 0.25
126 0.25
127 0.22
128 0.18
129 0.17
130 0.21
131 0.21
132 0.24
133 0.24
134 0.27
135 0.28
136 0.28
137 0.25
138 0.23
139 0.22
140 0.21
141 0.27
142 0.25
143 0.25
144 0.26
145 0.25
146 0.25
147 0.24
148 0.21
149 0.16
150 0.15
151 0.14
152 0.12
153 0.12
154 0.13
155 0.13
156 0.16
157 0.16
158 0.17
159 0.17
160 0.18
161 0.18
162 0.15
163 0.16
164 0.13
165 0.16
166 0.15
167 0.16
168 0.15
169 0.13
170 0.14
171 0.12
172 0.12
173 0.1
174 0.09
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.09
204 0.1
205 0.11
206 0.12
207 0.14
208 0.15
209 0.2
210 0.23
211 0.3
212 0.36
213 0.38
214 0.46
215 0.56
216 0.65
217 0.7
218 0.77
219 0.78
220 0.79
221 0.84
222 0.87
223 0.86
224 0.84
225 0.83
226 0.75
227 0.69
228 0.64
229 0.57
230 0.49
231 0.47
232 0.43
233 0.39
234 0.44
235 0.44
236 0.42
237 0.48
238 0.55
239 0.5
240 0.52
241 0.57
242 0.58
243 0.66
244 0.74
245 0.74
246 0.67
247 0.71
248 0.74
249 0.75
250 0.76
251 0.75
252 0.77
253 0.79
254 0.85
255 0.82
256 0.74
257 0.69
258 0.61
259 0.51
260 0.43
261 0.36
262 0.34
263 0.33
264 0.4
265 0.45
266 0.52
267 0.6
268 0.68
269 0.76
270 0.79
271 0.86
272 0.88
273 0.9
274 0.91
275 0.92