FuNGI

A0A3D8RXH1

Protein Details

Accession

A0A3D8RXH1

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
326-345	GTPIRRKKRKGALTNPSAYS	Hydrophilic
432-456	NNTSAQAKRKGAKNKRGKNGNEAIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
330-335	RRKKRK
439-450	KRKGAKNKRGKN

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 7, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPRKQWIDKKNATTYQLFHRSQNDPLIHDPEAQDRVLHPVYGPPADAPSASSADRAKHLSDLASEFRGDAVRKNEGEAANYGIYYDDSKYDYMQHMRELGTGGGGAYFVEATNSDKGKGKSLRLEDALAQTSLEDDDTRSNWDGRSTMSSAYGAYSTASTYSRKPTYQDQQNVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEEYVDEKEDDDFFGELTADGQEVDPGDWEDTLFDHDEEDDGWESDATEKAPVQPSTSSLKPKFDVAPGELPEHDAPAPDAHPGDQDWMREFAKFKKSGKPQAAPAAPASVVPSEQRSTLASTVFTVGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSSLARTEGHRLLDDRFERLEALYALDEEEEFDDSMSMVSGMTGMTDMSTASSVAPSLIDANGNAVAPRHDFNNIMDDFLGGWDNNTSAQAKRKGAKNKRGKNGNEAIGIRMLDEVRQGLGPAKVPGRVSGRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.63
3	0.62
4	0.63
5	0.57
6	0.51
7	0.52
8	0.5
9	0.51
10	0.56
11	0.48
12	0.42
13	0.45
14	0.46
15	0.4
16	0.4
17	0.37
18	0.34
19	0.34
20	0.3
21	0.27
22	0.22
23	0.27
24	0.26
25	0.24
26	0.18
27	0.2
28	0.24
29	0.24
30	0.24
31	0.17
32	0.19
33	0.19
34	0.19
35	0.15
36	0.15
37	0.16
38	0.16
39	0.18
40	0.18
41	0.2
42	0.23
43	0.24
44	0.23
45	0.22
46	0.23
47	0.22
48	0.22
49	0.24
50	0.24
51	0.23
52	0.22
53	0.19
54	0.19
55	0.21
56	0.19
57	0.2
58	0.22
59	0.27
60	0.27
61	0.29
62	0.33
63	0.31
64	0.32
65	0.28
66	0.27
67	0.22
68	0.21
69	0.19
70	0.14
71	0.13
72	0.13
73	0.12
74	0.1
75	0.11
76	0.12
77	0.13
78	0.16
79	0.2
80	0.24
81	0.24
82	0.25
83	0.26
84	0.26
85	0.26
86	0.24
87	0.19
88	0.14
89	0.12
90	0.1
91	0.07
92	0.06
93	0.05
94	0.04
95	0.04
96	0.04
97	0.04
98	0.05
99	0.07
100	0.12
101	0.13
102	0.15
103	0.2
104	0.21
105	0.29
106	0.34
107	0.36
108	0.39
109	0.42
110	0.46
111	0.42
112	0.43
113	0.37
114	0.36
115	0.33
116	0.25
117	0.21
118	0.15
119	0.14
120	0.12
121	0.11
122	0.07
123	0.06
124	0.09
125	0.09
126	0.13
127	0.14
128	0.15
129	0.15
130	0.16
131	0.16
132	0.16
133	0.19
134	0.17
135	0.17
136	0.16
137	0.16
138	0.15
139	0.15
140	0.13
141	0.09
142	0.08
143	0.07
144	0.06
145	0.07
146	0.09
147	0.1
148	0.12
149	0.18
150	0.21
151	0.22
152	0.25
153	0.32
154	0.4
155	0.48
156	0.53
157	0.52
158	0.55
159	0.57
160	0.54
161	0.46
162	0.37
163	0.28
164	0.21
165	0.16
166	0.11
167	0.07
168	0.07
169	0.07
170	0.06
171	0.08
172	0.09
173	0.09
174	0.09
175	0.13
176	0.13
177	0.12
178	0.13
179	0.12
180	0.12
181	0.12
182	0.11
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.07
187	0.06
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.07
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.05
209	0.04
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.04
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.07
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.08
235	0.12
236	0.13
237	0.13
238	0.13
239	0.16
240	0.2
241	0.23
242	0.28
243	0.25
244	0.28
245	0.27
246	0.29
247	0.28
248	0.26
249	0.26
250	0.21
251	0.24
252	0.23
253	0.23
254	0.21
255	0.22
256	0.19
257	0.18
258	0.15
259	0.1
260	0.09
261	0.09
262	0.1
263	0.08
264	0.08
265	0.07
266	0.08
267	0.08
268	0.11
269	0.11
270	0.12
271	0.13
272	0.16
273	0.16
274	0.16
275	0.18
276	0.21
277	0.28
278	0.32
279	0.33
280	0.39
281	0.47
282	0.55
283	0.61
284	0.58
285	0.55
286	0.58
287	0.57
288	0.49
289	0.42
290	0.34
291	0.26
292	0.22
293	0.19
294	0.11
295	0.1
296	0.09
297	0.11
298	0.1
299	0.11
300	0.12
301	0.11
302	0.14
303	0.14
304	0.14
305	0.12
306	0.12
307	0.13
308	0.12
309	0.11
310	0.09
311	0.08
312	0.11
313	0.13
314	0.18
315	0.25
316	0.36
317	0.43
318	0.47
319	0.56
320	0.63
321	0.71
322	0.75
323	0.78
324	0.78
325	0.8
326	0.81
327	0.72
328	0.64
329	0.54
330	0.43
331	0.35
332	0.25
333	0.18
334	0.14
335	0.13
336	0.12
337	0.12
338	0.14
339	0.13
340	0.14
341	0.19
342	0.2
343	0.22
344	0.23
345	0.23
346	0.24
347	0.31
348	0.3
349	0.27
350	0.24
351	0.23
352	0.22
353	0.21
354	0.21
355	0.13
356	0.14
357	0.11
358	0.1
359	0.1
360	0.1
361	0.09
362	0.07
363	0.08
364	0.08
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.06
371	0.05
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.03
379	0.03
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.07
395	0.09
396	0.1
397	0.1
398	0.1
399	0.09
400	0.1
401	0.12
402	0.13
403	0.13
404	0.14
405	0.16
406	0.17
407	0.24
408	0.23
409	0.22
410	0.21
411	0.19
412	0.17
413	0.17
414	0.17
415	0.08
416	0.09
417	0.08
418	0.09
419	0.09
420	0.11
421	0.12
422	0.14
423	0.23
424	0.3
425	0.36
426	0.42
427	0.5
428	0.59
429	0.68
430	0.75
431	0.78
432	0.81
433	0.85
434	0.88
435	0.84
436	0.83
437	0.81
438	0.77
439	0.73
440	0.63
441	0.55
442	0.49
443	0.44
444	0.34
445	0.27
446	0.22
447	0.15
448	0.16
449	0.14
450	0.12
451	0.13
452	0.13
453	0.14
454	0.17
455	0.18
456	0.21
457	0.23
458	0.25
459	0.26
460	0.31

A0A3D8RXH1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer