Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8QH79

Protein Details
Accession A0A3D8QH79    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
494-514SAKPTGHGKSHHKHQCRAHRHBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000743  Glyco_hydro_28  
IPR024535  Pectate_lyase_SF_prot  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
Gene Ontology GO:0005576  C:extracellular region  
GO:0004650  F:polygalacturonase activity  
GO:0005975  P:carbohydrate metabolic process  
GO:0071555  P:cell wall organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF00295  Glyco_hydro_28  
PF12708  Pectate_lyase_3  
Amino Acid Sequences MHISRLLFFLTPLLVKGQLSGSVGPLTSASSKSQTKTCNVLDYGAVADKSTDIGPALSSAWDECADGGVVYIPPGDYAIETWVKLSGGKACAIQLDGIIYRTGTDGGNMIMIEHSSDFEFFSSTSEGAFQGYGYEFHAKGSSDGPRILRLYDVTDFSVHDVALVDSPLFHFSIDTCTNGEVYNMAIRGGNMGGLDGIDVWSTNVWIHDVEVTNKDECVTVKSPSKNILVENIYCNWSGGCAMGSLGTDTDISDIVYRNIYTWNSNQMYMVKSNGGSGTVSNLVLENFIGHGNAYSLDIDGAWSSMSTIDGDGVELKNVTVRNWKGTEENGSQRGPIKVKCASGAPCTDVTIEDFAMWTESGDEQTYLCENAFGTGFCLEDGDGDSTFTSTLTASAAPASYSAPSMDADLQTAFGTDSEIPIPTIPTSFYPGATPYSALVGASASSTSVASSGAEEKVIASPASSSSTATPAASTASAAPTAPTGVDAVSASTASAKPTGHGKSHHKHQCRAHRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.15
4 0.15
5 0.16
6 0.17
7 0.17
8 0.16
9 0.16
10 0.16
11 0.15
12 0.14
13 0.14
14 0.14
15 0.15
16 0.16
17 0.21
18 0.25
19 0.28
20 0.34
21 0.37
22 0.39
23 0.45
24 0.46
25 0.46
26 0.43
27 0.42
28 0.36
29 0.32
30 0.3
31 0.25
32 0.22
33 0.14
34 0.14
35 0.12
36 0.13
37 0.12
38 0.1
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.1
44 0.08
45 0.09
46 0.08
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.11
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.14
73 0.15
74 0.16
75 0.17
76 0.17
77 0.17
78 0.18
79 0.18
80 0.16
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.07
108 0.09
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.13
122 0.12
123 0.13
124 0.15
125 0.14
126 0.14
127 0.17
128 0.2
129 0.19
130 0.22
131 0.23
132 0.25
133 0.25
134 0.24
135 0.22
136 0.18
137 0.19
138 0.18
139 0.19
140 0.16
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.12
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.06
152 0.05
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.12
160 0.13
161 0.14
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.13
167 0.08
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.03
183 0.04
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.13
198 0.15
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.13
203 0.12
204 0.16
205 0.15
206 0.16
207 0.22
208 0.24
209 0.25
210 0.28
211 0.3
212 0.26
213 0.25
214 0.27
215 0.23
216 0.22
217 0.23
218 0.2
219 0.19
220 0.18
221 0.17
222 0.12
223 0.1
224 0.09
225 0.07
226 0.06
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.18
250 0.19
251 0.19
252 0.19
253 0.19
254 0.2
255 0.18
256 0.18
257 0.11
258 0.1
259 0.11
260 0.1
261 0.09
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.16
307 0.17
308 0.21
309 0.23
310 0.24
311 0.23
312 0.25
313 0.31
314 0.28
315 0.32
316 0.31
317 0.3
318 0.3
319 0.3
320 0.33
321 0.29
322 0.26
323 0.26
324 0.25
325 0.26
326 0.26
327 0.28
328 0.27
329 0.27
330 0.27
331 0.25
332 0.22
333 0.22
334 0.21
335 0.17
336 0.16
337 0.13
338 0.11
339 0.09
340 0.08
341 0.07
342 0.08
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.08
349 0.08
350 0.07
351 0.08
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.07
357 0.08
358 0.08
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.08
365 0.06
366 0.06
367 0.08
368 0.09
369 0.08
370 0.08
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.07
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.08
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.1
392 0.11
393 0.11
394 0.11
395 0.11
396 0.12
397 0.1
398 0.11
399 0.09
400 0.07
401 0.09
402 0.07
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.1
407 0.1
408 0.11
409 0.1
410 0.1
411 0.1
412 0.11
413 0.16
414 0.17
415 0.17
416 0.17
417 0.18
418 0.2
419 0.19
420 0.19
421 0.13
422 0.14
423 0.14
424 0.12
425 0.11
426 0.08
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.05
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.07
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.11
443 0.12
444 0.14
445 0.12
446 0.09
447 0.1
448 0.11
449 0.15
450 0.15
451 0.14
452 0.14
453 0.17
454 0.18
455 0.17
456 0.16
457 0.12
458 0.14
459 0.12
460 0.12
461 0.11
462 0.11
463 0.12
464 0.11
465 0.11
466 0.1
467 0.11
468 0.1
469 0.09
470 0.08
471 0.07
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.1
479 0.11
480 0.11
481 0.14
482 0.14
483 0.15
484 0.23
485 0.27
486 0.3
487 0.38
488 0.46
489 0.52
490 0.63
491 0.71
492 0.72
493 0.75
494 0.81