Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8T5H2

Protein Details
Accession A0A3D8T5H2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-276PTVASLLQKPRKRRRRRTAKAQPDSTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
258-269KPRKRRRRRTAK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MSDELDAKRRLSTLDRPISPPPTRPLTRNGPTGNDSLAALEAGKEETQNAVERISARLRRYVVDRNNIPKQVSLITIDAWKALYNRNCHPTGRHFVIHQHDHPIAGPHYDLRLQFSESSSLSWSVMYGLPGDPNSRRLNRNATETRVHALWNHLIETASARTGSMIIWDTGEYEVLPDKPKGSNIGPETDESEPETHSASGVGGSGLPESEKLRNAFQNSKIHLRLHGTRLPHDYTIFLRRDKTDFRSAPTVASLLQKPRKRRRRRTAKAQPDSTSDSESDTDITLLSDTKSPGTGKRQRDVNIGNEPEPEHSDAEGGDKDVDFQIRLNNAYPGAVNDIGSIHQRRWFIMLDRAGCGFVPEKLAGANGEYTGEKRWIRGVDKRFGTRTGFEPFHVHGPEVERSVVTGRRGPDVLRDEGAEGFVSRRGWKPVIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.51
3 0.54
4 0.59
5 0.65
6 0.62
7 0.58
8 0.54
9 0.54
10 0.54
11 0.53
12 0.55
13 0.56
14 0.59
15 0.62
16 0.58
17 0.54
18 0.54
19 0.53
20 0.46
21 0.37
22 0.3
23 0.22
24 0.19
25 0.14
26 0.1
27 0.09
28 0.08
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.1
34 0.12
35 0.16
36 0.15
37 0.14
38 0.16
39 0.17
40 0.2
41 0.27
42 0.31
43 0.3
44 0.35
45 0.36
46 0.38
47 0.43
48 0.48
49 0.48
50 0.52
51 0.58
52 0.6
53 0.66
54 0.67
55 0.62
56 0.53
57 0.47
58 0.39
59 0.34
60 0.28
61 0.21
62 0.19
63 0.2
64 0.19
65 0.17
66 0.15
67 0.14
68 0.13
69 0.2
70 0.24
71 0.27
72 0.33
73 0.39
74 0.41
75 0.41
76 0.45
77 0.46
78 0.49
79 0.49
80 0.45
81 0.4
82 0.44
83 0.51
84 0.52
85 0.46
86 0.43
87 0.38
88 0.36
89 0.36
90 0.33
91 0.25
92 0.2
93 0.18
94 0.14
95 0.15
96 0.18
97 0.18
98 0.18
99 0.19
100 0.2
101 0.2
102 0.2
103 0.22
104 0.19
105 0.2
106 0.17
107 0.16
108 0.14
109 0.13
110 0.12
111 0.1
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.14
119 0.13
120 0.18
121 0.23
122 0.27
123 0.3
124 0.33
125 0.41
126 0.41
127 0.49
128 0.49
129 0.47
130 0.45
131 0.44
132 0.42
133 0.34
134 0.31
135 0.23
136 0.22
137 0.2
138 0.18
139 0.17
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.15
144 0.13
145 0.1
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.06
160 0.05
161 0.07
162 0.08
163 0.1
164 0.09
165 0.11
166 0.12
167 0.13
168 0.16
169 0.16
170 0.21
171 0.21
172 0.24
173 0.23
174 0.23
175 0.25
176 0.22
177 0.21
178 0.16
179 0.15
180 0.11
181 0.11
182 0.12
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.06
197 0.08
198 0.1
199 0.11
200 0.14
201 0.17
202 0.21
203 0.25
204 0.29
205 0.34
206 0.34
207 0.38
208 0.38
209 0.36
210 0.34
211 0.34
212 0.32
213 0.3
214 0.31
215 0.27
216 0.27
217 0.31
218 0.31
219 0.27
220 0.24
221 0.2
222 0.19
223 0.25
224 0.24
225 0.22
226 0.22
227 0.23
228 0.26
229 0.29
230 0.31
231 0.34
232 0.33
233 0.35
234 0.38
235 0.37
236 0.34
237 0.3
238 0.25
239 0.17
240 0.19
241 0.18
242 0.2
243 0.27
244 0.31
245 0.41
246 0.51
247 0.61
248 0.69
249 0.78
250 0.82
251 0.86
252 0.92
253 0.94
254 0.94
255 0.95
256 0.93
257 0.87
258 0.78
259 0.71
260 0.67
261 0.56
262 0.47
263 0.36
264 0.28
265 0.23
266 0.21
267 0.17
268 0.11
269 0.1
270 0.08
271 0.08
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.11
279 0.12
280 0.16
281 0.26
282 0.33
283 0.37
284 0.43
285 0.48
286 0.49
287 0.55
288 0.54
289 0.5
290 0.5
291 0.47
292 0.42
293 0.38
294 0.36
295 0.3
296 0.29
297 0.25
298 0.17
299 0.15
300 0.14
301 0.13
302 0.15
303 0.13
304 0.11
305 0.1
306 0.09
307 0.1
308 0.11
309 0.12
310 0.09
311 0.1
312 0.13
313 0.15
314 0.16
315 0.16
316 0.17
317 0.16
318 0.16
319 0.16
320 0.13
321 0.15
322 0.14
323 0.13
324 0.11
325 0.12
326 0.12
327 0.17
328 0.18
329 0.15
330 0.19
331 0.2
332 0.2
333 0.23
334 0.25
335 0.23
336 0.3
337 0.34
338 0.31
339 0.32
340 0.32
341 0.29
342 0.26
343 0.24
344 0.17
345 0.13
346 0.14
347 0.13
348 0.12
349 0.12
350 0.13
351 0.11
352 0.12
353 0.12
354 0.09
355 0.1
356 0.1
357 0.11
358 0.13
359 0.19
360 0.18
361 0.18
362 0.23
363 0.28
364 0.33
365 0.41
366 0.46
367 0.49
368 0.56
369 0.61
370 0.59
371 0.57
372 0.55
373 0.49
374 0.46
375 0.44
376 0.39
377 0.34
378 0.36
379 0.34
380 0.37
381 0.35
382 0.31
383 0.26
384 0.29
385 0.31
386 0.29
387 0.28
388 0.2
389 0.21
390 0.25
391 0.26
392 0.25
393 0.26
394 0.25
395 0.29
396 0.31
397 0.3
398 0.34
399 0.36
400 0.36
401 0.33
402 0.32
403 0.29
404 0.29
405 0.29
406 0.2
407 0.16
408 0.13
409 0.15
410 0.16
411 0.18
412 0.22
413 0.27