Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8S6C6

Protein Details
Accession A0A3D8S6C6    Localization Confidence High Confidence Score 25
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
123-142SYMRRLAKEEQKEQKKRRAEBasic
410-437FPPMLPRKLRVVRAKKVTKKPSENQGASHydrophilic
484-515GSSRIRVRGKSRGSKVKKDGRSKKRAAAYKAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
415-431PRKLRVVRAKKVTKKPS
487-524RIRVRGKSRGSKVKKDGRSKKRAAAYKAAGGKRSEIGK
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKKSKTQKEAPAAESAGSSLPFLGGKASVDPSLASLFEQSAGPVKVPEVPRLGAAPKTKKPKLENDEDEEELSGPGDDSAAEDEPMEDTPQSPDAAPEDGPAVSEPPSRKRKRATGDDLEDSYMRRLAKEEQKEQKKRRAELPASPEAESEDDEKESVQSEEDESEEEEDVEVPKHEAMASEGGDDDEIAKSNRTIFLSNVSTKAITSKSAKKELMKHLSSFLSTLPESTGPHKIESVRFRSTAFASGGKIPKRAAFAKQEIHDDTTPSTNAYAVYSTAQAAKKAPAALNGTMILDRHLRVDNVAHPSKVDHKRCVFVGNLDFIDNEKGTEEGEKKKKNRAPADVEEGLWRTFNAHTKGTQSGPAGRGNVESVRVVRDRSTRVGKGFAYVQFYDQNCVEEALLLNDKRFPPMLPRKLRVVRAKKVTKKPSENQGASKGTDRTLQGRAGKLLGRSSEARLKAADRKSISQNSLVFEGNRATADGSSRIRVRGKSRGSKVKKDGRSKKRAAAYKAAGGKRSEIGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.44
3 0.35
4 0.26
5 0.19
6 0.16
7 0.1
8 0.1
9 0.09
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.12
15 0.14
16 0.14
17 0.14
18 0.14
19 0.14
20 0.15
21 0.14
22 0.12
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.11
27 0.1
28 0.15
29 0.15
30 0.15
31 0.14
32 0.15
33 0.2
34 0.22
35 0.27
36 0.25
37 0.25
38 0.26
39 0.28
40 0.3
41 0.29
42 0.36
43 0.4
44 0.44
45 0.53
46 0.57
47 0.62
48 0.66
49 0.71
50 0.71
51 0.73
52 0.72
53 0.7
54 0.71
55 0.64
56 0.58
57 0.48
58 0.4
59 0.29
60 0.21
61 0.14
62 0.09
63 0.07
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.08
76 0.08
77 0.11
78 0.12
79 0.13
80 0.12
81 0.12
82 0.13
83 0.15
84 0.14
85 0.12
86 0.12
87 0.11
88 0.12
89 0.11
90 0.1
91 0.1
92 0.15
93 0.17
94 0.25
95 0.36
96 0.41
97 0.48
98 0.55
99 0.63
100 0.68
101 0.75
102 0.75
103 0.75
104 0.75
105 0.73
106 0.66
107 0.59
108 0.5
109 0.4
110 0.32
111 0.25
112 0.19
113 0.14
114 0.15
115 0.22
116 0.3
117 0.38
118 0.46
119 0.53
120 0.64
121 0.74
122 0.79
123 0.8
124 0.8
125 0.76
126 0.74
127 0.74
128 0.69
129 0.67
130 0.67
131 0.66
132 0.6
133 0.56
134 0.47
135 0.38
136 0.34
137 0.27
138 0.21
139 0.14
140 0.12
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.1
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.09
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.11
182 0.12
183 0.13
184 0.12
185 0.17
186 0.21
187 0.22
188 0.22
189 0.2
190 0.19
191 0.18
192 0.2
193 0.15
194 0.14
195 0.18
196 0.25
197 0.29
198 0.36
199 0.38
200 0.4
201 0.48
202 0.54
203 0.58
204 0.52
205 0.47
206 0.44
207 0.42
208 0.38
209 0.3
210 0.21
211 0.15
212 0.13
213 0.12
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.13
218 0.19
219 0.17
220 0.17
221 0.19
222 0.2
223 0.25
224 0.29
225 0.33
226 0.29
227 0.29
228 0.29
229 0.29
230 0.28
231 0.26
232 0.21
233 0.17
234 0.15
235 0.2
236 0.24
237 0.23
238 0.23
239 0.21
240 0.21
241 0.24
242 0.25
243 0.24
244 0.25
245 0.28
246 0.32
247 0.33
248 0.34
249 0.31
250 0.33
251 0.29
252 0.23
253 0.2
254 0.17
255 0.15
256 0.12
257 0.11
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.13
271 0.14
272 0.15
273 0.15
274 0.15
275 0.18
276 0.18
277 0.18
278 0.17
279 0.15
280 0.14
281 0.13
282 0.11
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.15
291 0.21
292 0.22
293 0.2
294 0.19
295 0.21
296 0.3
297 0.37
298 0.37
299 0.37
300 0.38
301 0.41
302 0.41
303 0.42
304 0.34
305 0.29
306 0.26
307 0.22
308 0.2
309 0.18
310 0.17
311 0.15
312 0.17
313 0.12
314 0.1
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.11
319 0.14
320 0.21
321 0.3
322 0.37
323 0.4
324 0.5
325 0.53
326 0.59
327 0.63
328 0.62
329 0.62
330 0.6
331 0.65
332 0.56
333 0.54
334 0.46
335 0.4
336 0.31
337 0.23
338 0.18
339 0.11
340 0.12
341 0.18
342 0.2
343 0.2
344 0.21
345 0.24
346 0.27
347 0.26
348 0.28
349 0.23
350 0.25
351 0.26
352 0.27
353 0.25
354 0.22
355 0.22
356 0.2
357 0.19
358 0.16
359 0.14
360 0.13
361 0.16
362 0.16
363 0.17
364 0.19
365 0.23
366 0.26
367 0.31
368 0.37
369 0.37
370 0.38
371 0.41
372 0.37
373 0.34
374 0.35
375 0.31
376 0.29
377 0.26
378 0.26
379 0.28
380 0.28
381 0.28
382 0.25
383 0.23
384 0.18
385 0.19
386 0.16
387 0.12
388 0.11
389 0.12
390 0.16
391 0.15
392 0.15
393 0.19
394 0.19
395 0.21
396 0.21
397 0.19
398 0.24
399 0.35
400 0.45
401 0.49
402 0.52
403 0.6
404 0.66
405 0.74
406 0.74
407 0.72
408 0.71
409 0.73
410 0.8
411 0.81
412 0.84
413 0.86
414 0.86
415 0.86
416 0.84
417 0.84
418 0.84
419 0.79
420 0.74
421 0.72
422 0.65
423 0.57
424 0.55
425 0.46
426 0.36
427 0.36
428 0.33
429 0.29
430 0.29
431 0.33
432 0.33
433 0.35
434 0.35
435 0.33
436 0.34
437 0.32
438 0.32
439 0.28
440 0.27
441 0.26
442 0.3
443 0.34
444 0.33
445 0.32
446 0.3
447 0.34
448 0.38
449 0.41
450 0.44
451 0.41
452 0.44
453 0.52
454 0.57
455 0.55
456 0.53
457 0.5
458 0.45
459 0.44
460 0.41
461 0.32
462 0.27
463 0.26
464 0.21
465 0.18
466 0.16
467 0.14
468 0.13
469 0.16
470 0.19
471 0.2
472 0.24
473 0.26
474 0.31
475 0.35
476 0.4
477 0.44
478 0.48
479 0.56
480 0.61
481 0.69
482 0.75
483 0.78
484 0.83
485 0.86
486 0.87
487 0.86
488 0.87
489 0.88
490 0.88
491 0.9
492 0.87
493 0.86
494 0.85
495 0.84
496 0.8
497 0.79
498 0.74
499 0.72
500 0.73
501 0.69
502 0.64
503 0.56
504 0.53