Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8SIK1

Protein Details
Accession A0A3D8SIK1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
523-551QSEKLSKSAARNKKKREARKLKEGQPEEGHydrophilic
555-583ANQPRGEKKKDGPRKNGQQQKQPNGNKAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
528-571SKSAARNKKKREARKLKEGQPEEGANDANQPRGEKKKDGPRKNG
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 10.333, cyto_mito 9.166, nucl 7, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011659  PD40  
IPR011387  TIF2A  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
PF07676  PD40  
Amino Acid Sequences MAAPTQLAFRTVKGVGILDASPVYEPLAGFERPEGNLRCSAYSPDGRYFAWASPEKVTIIDPSVGHVVSTIPAENVFELGFSPLGTYLITWQRPSKDANGDAVKNLKVWQVLETEEDRIVGQYVQKSQTGWNIQYSADEKLCARVVTNEVQFYQSDNLSKVWNKLRVEGVADFALSPGQNLSVAVFIPERKGQPAAVKVFLVPQFGSPVSQKTFFKGDKVQLKWNNSGTSLIVLAQTDVDKTGKSYYGETTLYLLSSSGQFDSRVHLDREGPIHDVSWSPTSKEFGVVYGTIPSKTTIFNVRGVPKHSFPLTPRNTILFSPHGRFVLVAGFGNMAGQMDIYDMEKNYTKITTVEAANSSVCEWSPDGQTILTATTSPRLRVDNGLRLWHVSGALLYNEDINELYDVCWRPQSTTQHPLGDPFNPLPAPHASAVAYLSTRKAPVKPAGAYRPPGARGTSTPLAFRREDQGGAAYVPDGTATGGALNGPARSRRRAVPGAEPAEEFLPPGAAPGGGVALPPGADQSEKLSKSAARNKKKREARKLKEGQPEEGANDANQPRGEKKKDGPRKNGQQQKQPNGNKAAPAPAPVPEPEPLDDGVPSVHDKKIRGLLKKIRAIEDLKMRLAGGEKLEDTQMKKIQTEDSVRKELDGLGYTGAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.16
3 0.18
4 0.17
5 0.14
6 0.13
7 0.13
8 0.11
9 0.11
10 0.11
11 0.1
12 0.09
13 0.11
14 0.15
15 0.14
16 0.15
17 0.18
18 0.2
19 0.2
20 0.28
21 0.29
22 0.28
23 0.33
24 0.34
25 0.34
26 0.32
27 0.35
28 0.35
29 0.38
30 0.39
31 0.39
32 0.4
33 0.38
34 0.4
35 0.38
36 0.33
37 0.35
38 0.34
39 0.32
40 0.32
41 0.34
42 0.3
43 0.28
44 0.27
45 0.21
46 0.21
47 0.21
48 0.18
49 0.19
50 0.21
51 0.2
52 0.18
53 0.16
54 0.13
55 0.11
56 0.13
57 0.11
58 0.08
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.11
75 0.19
76 0.21
77 0.23
78 0.27
79 0.3
80 0.33
81 0.36
82 0.37
83 0.38
84 0.38
85 0.44
86 0.46
87 0.44
88 0.44
89 0.44
90 0.38
91 0.31
92 0.3
93 0.25
94 0.2
95 0.2
96 0.19
97 0.17
98 0.18
99 0.21
100 0.21
101 0.2
102 0.18
103 0.18
104 0.16
105 0.14
106 0.14
107 0.11
108 0.13
109 0.15
110 0.2
111 0.22
112 0.23
113 0.23
114 0.24
115 0.31
116 0.33
117 0.31
118 0.29
119 0.28
120 0.28
121 0.3
122 0.3
123 0.26
124 0.21
125 0.21
126 0.18
127 0.2
128 0.21
129 0.18
130 0.17
131 0.16
132 0.19
133 0.24
134 0.26
135 0.25
136 0.23
137 0.25
138 0.24
139 0.23
140 0.22
141 0.17
142 0.17
143 0.16
144 0.17
145 0.19
146 0.21
147 0.25
148 0.3
149 0.35
150 0.34
151 0.37
152 0.39
153 0.36
154 0.38
155 0.32
156 0.28
157 0.21
158 0.2
159 0.16
160 0.13
161 0.13
162 0.09
163 0.08
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.1
175 0.13
176 0.14
177 0.15
178 0.16
179 0.17
180 0.21
181 0.27
182 0.28
183 0.26
184 0.26
185 0.24
186 0.28
187 0.27
188 0.24
189 0.17
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.17
194 0.13
195 0.16
196 0.17
197 0.2
198 0.2
199 0.21
200 0.28
201 0.26
202 0.29
203 0.31
204 0.36
205 0.41
206 0.44
207 0.5
208 0.5
209 0.54
210 0.55
211 0.53
212 0.47
213 0.39
214 0.37
215 0.28
216 0.22
217 0.17
218 0.13
219 0.1
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.07
229 0.09
230 0.11
231 0.11
232 0.13
233 0.13
234 0.17
235 0.17
236 0.16
237 0.16
238 0.14
239 0.13
240 0.11
241 0.1
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.11
250 0.14
251 0.16
252 0.16
253 0.17
254 0.17
255 0.19
256 0.21
257 0.19
258 0.18
259 0.15
260 0.15
261 0.14
262 0.13
263 0.13
264 0.15
265 0.14
266 0.13
267 0.14
268 0.15
269 0.15
270 0.16
271 0.14
272 0.11
273 0.12
274 0.11
275 0.11
276 0.12
277 0.13
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.12
284 0.14
285 0.15
286 0.19
287 0.22
288 0.26
289 0.27
290 0.3
291 0.32
292 0.28
293 0.29
294 0.26
295 0.24
296 0.23
297 0.31
298 0.31
299 0.31
300 0.31
301 0.3
302 0.3
303 0.28
304 0.28
305 0.23
306 0.22
307 0.2
308 0.21
309 0.19
310 0.18
311 0.17
312 0.15
313 0.12
314 0.1
315 0.08
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.04
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.04
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.12
339 0.11
340 0.12
341 0.12
342 0.13
343 0.12
344 0.12
345 0.11
346 0.08
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.06
359 0.06
360 0.05
361 0.1
362 0.11
363 0.12
364 0.13
365 0.14
366 0.15
367 0.21
368 0.25
369 0.28
370 0.29
371 0.3
372 0.29
373 0.28
374 0.27
375 0.22
376 0.17
377 0.1
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.1
392 0.11
393 0.11
394 0.14
395 0.14
396 0.17
397 0.23
398 0.3
399 0.32
400 0.39
401 0.41
402 0.42
403 0.42
404 0.42
405 0.38
406 0.32
407 0.28
408 0.21
409 0.2
410 0.16
411 0.16
412 0.16
413 0.15
414 0.17
415 0.14
416 0.15
417 0.13
418 0.13
419 0.14
420 0.11
421 0.11
422 0.09
423 0.1
424 0.1
425 0.12
426 0.13
427 0.15
428 0.19
429 0.24
430 0.29
431 0.31
432 0.36
433 0.42
434 0.44
435 0.45
436 0.43
437 0.41
438 0.37
439 0.36
440 0.31
441 0.25
442 0.22
443 0.27
444 0.29
445 0.26
446 0.27
447 0.28
448 0.32
449 0.3
450 0.3
451 0.27
452 0.25
453 0.24
454 0.22
455 0.2
456 0.17
457 0.16
458 0.15
459 0.1
460 0.08
461 0.07
462 0.06
463 0.05
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.05
471 0.05
472 0.06
473 0.08
474 0.14
475 0.18
476 0.22
477 0.26
478 0.29
479 0.36
480 0.42
481 0.44
482 0.46
483 0.52
484 0.52
485 0.5
486 0.45
487 0.39
488 0.33
489 0.3
490 0.21
491 0.12
492 0.08
493 0.07
494 0.07
495 0.06
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.06
500 0.05
501 0.05
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.12
511 0.19
512 0.2
513 0.21
514 0.23
515 0.26
516 0.35
517 0.45
518 0.5
519 0.53
520 0.62
521 0.71
522 0.79
523 0.85
524 0.87
525 0.88
526 0.89
527 0.87
528 0.89
529 0.9
530 0.88
531 0.89
532 0.81
533 0.74
534 0.68
535 0.6
536 0.5
537 0.43
538 0.34
539 0.24
540 0.27
541 0.24
542 0.22
543 0.21
544 0.22
545 0.27
546 0.35
547 0.4
548 0.4
549 0.48
550 0.56
551 0.65
552 0.73
553 0.77
554 0.78
555 0.84
556 0.88
557 0.9
558 0.86
559 0.86
560 0.87
561 0.87
562 0.87
563 0.83
564 0.8
565 0.78
566 0.72
567 0.66
568 0.58
569 0.54
570 0.44
571 0.4
572 0.34
573 0.28
574 0.28
575 0.25
576 0.25
577 0.21
578 0.23
579 0.22
580 0.23
581 0.21
582 0.2
583 0.19
584 0.16
585 0.14
586 0.13
587 0.15
588 0.16
589 0.19
590 0.22
591 0.23
592 0.28
593 0.37
594 0.43
595 0.46
596 0.53
597 0.59
598 0.66
599 0.72
600 0.7
601 0.66
602 0.64
603 0.6
604 0.57
605 0.57
606 0.52
607 0.46
608 0.42
609 0.37
610 0.33
611 0.33
612 0.28
613 0.21
614 0.2
615 0.2
616 0.21
617 0.24
618 0.26
619 0.27
620 0.31
621 0.33
622 0.32
623 0.33
624 0.34
625 0.35
626 0.39
627 0.46
628 0.48
629 0.5
630 0.55
631 0.53
632 0.52
633 0.48
634 0.42
635 0.37
636 0.3
637 0.24