Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8SWL6

Protein Details
Accession A0A3D8SWL6    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-58SPPTSKPSSARRSPLKPKQKPSKPQTDPRHLAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-48SARRSPLKPKQKPSK
Subcellular Location(s) mito 24.5, cyto_mito 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039693  Rtr1/RPAP2  
IPR007308  Rtr1/RPAP2_dom  
IPR038534  Rtr1/RPAP2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0017018  F:myosin phosphatase activity  
GO:0043175  F:RNA polymerase core enzyme binding  
GO:0008420  F:RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04181  RPAP2_Rtr1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51479  ZF_RTR1  
Amino Acid Sequences MSSAKPILKTSIPSMHAASARQSNTSPPTSKPSSARRSPLKPKQKPSKPQTDPRHLAIALHHAHRIQAQKNAQDLILDRILELLTIPSSPSADPAAPSAEDAHKFKAALVPFQPADYDNLIQERNIEGLCGYGLCPHEHRQENSRGAFRITWGARGSGPRGRGREMNIVPKEQYEMWCSDECAERAMYIRVQLAAEPVWERRADDLRGEELLLLEEGRSGKGKSAMRDPTSVQEVLGQLDNLHMDTTPEPSAVADEISRLSVRDDARSRELAMERGDQNPALQGGRVNVNIQEKTNVGQVTAPEMRAGDERGGSIEGYMPNES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.37
4 0.35
5 0.33
6 0.32
7 0.31
8 0.31
9 0.29
10 0.3
11 0.34
12 0.39
13 0.37
14 0.33
15 0.4
16 0.43
17 0.48
18 0.5
19 0.54
20 0.57
21 0.63
22 0.68
23 0.69
24 0.74
25 0.79
26 0.82
27 0.84
28 0.84
29 0.87
30 0.89
31 0.9
32 0.91
33 0.89
34 0.9
35 0.88
36 0.89
37 0.89
38 0.88
39 0.83
40 0.75
41 0.72
42 0.61
43 0.53
44 0.44
45 0.42
46 0.35
47 0.32
48 0.3
49 0.24
50 0.25
51 0.28
52 0.32
53 0.27
54 0.32
55 0.35
56 0.37
57 0.4
58 0.4
59 0.36
60 0.31
61 0.29
62 0.25
63 0.22
64 0.18
65 0.15
66 0.14
67 0.14
68 0.12
69 0.11
70 0.07
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.05
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.11
82 0.12
83 0.11
84 0.12
85 0.13
86 0.14
87 0.17
88 0.18
89 0.19
90 0.19
91 0.19
92 0.19
93 0.21
94 0.18
95 0.19
96 0.19
97 0.21
98 0.2
99 0.2
100 0.2
101 0.16
102 0.18
103 0.16
104 0.15
105 0.11
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.11
111 0.1
112 0.09
113 0.08
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.12
123 0.15
124 0.23
125 0.26
126 0.28
127 0.31
128 0.37
129 0.42
130 0.42
131 0.41
132 0.34
133 0.32
134 0.3
135 0.25
136 0.25
137 0.2
138 0.2
139 0.18
140 0.18
141 0.18
142 0.19
143 0.21
144 0.17
145 0.21
146 0.21
147 0.23
148 0.24
149 0.25
150 0.27
151 0.33
152 0.32
153 0.37
154 0.35
155 0.34
156 0.33
157 0.31
158 0.29
159 0.21
160 0.2
161 0.14
162 0.14
163 0.15
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.17
168 0.15
169 0.15
170 0.13
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.12
189 0.16
190 0.16
191 0.17
192 0.19
193 0.19
194 0.19
195 0.19
196 0.15
197 0.12
198 0.11
199 0.09
200 0.07
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.1
208 0.17
209 0.2
210 0.21
211 0.29
212 0.36
213 0.37
214 0.39
215 0.39
216 0.36
217 0.37
218 0.34
219 0.26
220 0.21
221 0.19
222 0.19
223 0.18
224 0.14
225 0.1
226 0.1
227 0.11
228 0.08
229 0.08
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.11
239 0.1
240 0.1
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.14
249 0.15
250 0.22
251 0.26
252 0.3
253 0.34
254 0.36
255 0.36
256 0.37
257 0.37
258 0.33
259 0.32
260 0.33
261 0.3
262 0.3
263 0.31
264 0.25
265 0.24
266 0.22
267 0.21
268 0.15
269 0.14
270 0.14
271 0.15
272 0.18
273 0.19
274 0.18
275 0.21
276 0.27
277 0.28
278 0.28
279 0.27
280 0.24
281 0.25
282 0.29
283 0.25
284 0.19
285 0.19
286 0.18
287 0.24
288 0.25
289 0.24
290 0.19
291 0.19
292 0.21
293 0.21
294 0.23
295 0.18
296 0.16
297 0.16
298 0.17
299 0.18
300 0.16
301 0.14
302 0.16
303 0.16