Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CF68

Protein Details
Accession A0A0D1CF68    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21APPGDAPPPHKKRRYGEYGFBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 5, mito 4, cyto_pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0032797  C:SMN complex  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
KEGG uma:UMAG_06389  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MAPPGDAPPPHKKRRYGEYGFGTSTQDESFGVQSLPVGILADDFSGEPADGQEYLAVVRREAAAAPCVFLAAHNPYAETATQASRPISAHGAYTAHDPISSCANAGQEDDGLCMPSTEWKTTFVRQFKNAREAISNPPLEPVRLTRDDLPKISNTSAWYAWIHGRPPPPTSPEEAQKQSAKKYEWRIREPSASVLLRLSTEQILALLEAFPYWIAHRVIIPDSQIKASEREGAHVLQPLHARWLFALMLRLDARLVSEEISTLRTLARACIAAITLSRIRRKAVRSRTNKAEAEAEAEAAAAAEAETETDAEGVTVTVTVATPQAADAASHRNADEKQMRKDEAGAWMVVAIVAGVWGQSDLWDDAIGDMRRVT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.82
3 0.78
4 0.78
5 0.76
6 0.74
7 0.68
8 0.61
9 0.53
10 0.43
11 0.37
12 0.28
13 0.2
14 0.15
15 0.14
16 0.14
17 0.13
18 0.12
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.1
23 0.08
24 0.08
25 0.06
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.07
33 0.07
34 0.06
35 0.06
36 0.08
37 0.07
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.08
42 0.13
43 0.13
44 0.11
45 0.12
46 0.13
47 0.13
48 0.15
49 0.16
50 0.15
51 0.15
52 0.16
53 0.14
54 0.14
55 0.13
56 0.12
57 0.14
58 0.14
59 0.16
60 0.15
61 0.16
62 0.16
63 0.18
64 0.18
65 0.15
66 0.13
67 0.12
68 0.14
69 0.16
70 0.16
71 0.16
72 0.17
73 0.17
74 0.18
75 0.16
76 0.15
77 0.15
78 0.15
79 0.14
80 0.16
81 0.15
82 0.13
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.16
87 0.15
88 0.12
89 0.12
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.12
103 0.15
104 0.16
105 0.16
106 0.19
107 0.23
108 0.28
109 0.36
110 0.37
111 0.39
112 0.44
113 0.51
114 0.52
115 0.57
116 0.53
117 0.47
118 0.43
119 0.41
120 0.41
121 0.41
122 0.37
123 0.29
124 0.3
125 0.29
126 0.26
127 0.24
128 0.2
129 0.19
130 0.2
131 0.22
132 0.25
133 0.32
134 0.34
135 0.34
136 0.34
137 0.29
138 0.3
139 0.28
140 0.24
141 0.19
142 0.19
143 0.17
144 0.17
145 0.15
146 0.14
147 0.17
148 0.17
149 0.16
150 0.17
151 0.21
152 0.21
153 0.24
154 0.25
155 0.25
156 0.25
157 0.29
158 0.28
159 0.3
160 0.34
161 0.33
162 0.34
163 0.35
164 0.35
165 0.34
166 0.36
167 0.33
168 0.33
169 0.4
170 0.44
171 0.47
172 0.51
173 0.52
174 0.5
175 0.51
176 0.47
177 0.39
178 0.37
179 0.29
180 0.24
181 0.19
182 0.17
183 0.14
184 0.13
185 0.12
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.11
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.15
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.16
215 0.2
216 0.17
217 0.18
218 0.2
219 0.19
220 0.19
221 0.21
222 0.21
223 0.17
224 0.19
225 0.17
226 0.2
227 0.2
228 0.18
229 0.14
230 0.17
231 0.14
232 0.13
233 0.16
234 0.11
235 0.14
236 0.14
237 0.14
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.09
242 0.1
243 0.08
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.1
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.09
260 0.09
261 0.13
262 0.15
263 0.19
264 0.24
265 0.25
266 0.27
267 0.33
268 0.39
269 0.45
270 0.52
271 0.58
272 0.62
273 0.69
274 0.76
275 0.78
276 0.73
277 0.65
278 0.58
279 0.48
280 0.43
281 0.35
282 0.26
283 0.18
284 0.16
285 0.13
286 0.09
287 0.08
288 0.04
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.09
315 0.15
316 0.17
317 0.18
318 0.18
319 0.21
320 0.21
321 0.3
322 0.37
323 0.38
324 0.45
325 0.51
326 0.53
327 0.5
328 0.52
329 0.47
330 0.45
331 0.4
332 0.31
333 0.24
334 0.22
335 0.2
336 0.17
337 0.13
338 0.06
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.04
346 0.04
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.1
353 0.18
354 0.18