Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8SIZ8

Protein Details
Accession A0A3D8SIZ8    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-70AQEIASKEKKSKGKKKEPTPSSSSEHydrophilic
85-110SEDEKPAKKEVKKDNKKVTKKAESSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-62KASQSPKAKSKKVAQEIASKEKKSKGKKKE
90-104PAKKEVKKDNKKVTK
139-153KPAKKAKAEPKAAKK
460-506GGGRGGGRGGFGGRGRGGPRGGGRGGRGGFGGRGGGAGGPPNRARGG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSKSKSVVKKGAETAGKLADKALSKVKDAGVTKASQSPKAKSKKVAQEIASKEKKSKGKKKEPTPSSSSESESESESESSSSSSSEDEKPAKKEVKKDNKKVTKKAESSSESESDSSDSDEEMKDASSSESESESEEEKPAKKAKAEPKAAKKAESSESESSDSDNESSEDEEETPKAAAAESSDSDESDSSESEDEAPAKAKKADTKASKEESGSDSDSSEGSSDSDSSESESEDSDKPAESKKRKAEEEPEAASKKSKTEEGASANLFVGNLSWNVTEEWLQQEFEQFGELSARIMTERETGRSRGFGYVEFTDAADAAKAYEAMKEHEIDGRKINLDYATVRPANKDQGGFKERAQTRARSFGDQASPESDTLFVGNLPFSANEDSVHEVFGPQGTVLGIRLPTDMESGRPKGFGYVQYSSVDEARNAYNELQGAEIDGRPIRLDFSTPRQNNGGGGGGRGGGRGGFGGRGRGGPRGGGRGGRGGFGGRGGGAGGPPNRARGGIPEFKGTKMTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.5
3 0.45
4 0.38
5 0.34
6 0.3
7 0.28
8 0.29
9 0.34
10 0.28
11 0.29
12 0.33
13 0.35
14 0.37
15 0.37
16 0.39
17 0.34
18 0.34
19 0.34
20 0.38
21 0.39
22 0.4
23 0.43
24 0.46
25 0.51
26 0.59
27 0.63
28 0.64
29 0.71
30 0.73
31 0.77
32 0.78
33 0.73
34 0.73
35 0.73
36 0.75
37 0.73
38 0.64
39 0.6
40 0.6
41 0.64
42 0.65
43 0.68
44 0.69
45 0.73
46 0.81
47 0.87
48 0.9
49 0.9
50 0.87
51 0.84
52 0.78
53 0.73
54 0.65
55 0.58
56 0.49
57 0.43
58 0.36
59 0.31
60 0.26
61 0.22
62 0.2
63 0.17
64 0.15
65 0.13
66 0.13
67 0.11
68 0.1
69 0.09
70 0.1
71 0.13
72 0.16
73 0.21
74 0.27
75 0.32
76 0.35
77 0.42
78 0.49
79 0.5
80 0.56
81 0.61
82 0.66
83 0.72
84 0.79
85 0.83
86 0.85
87 0.9
88 0.9
89 0.89
90 0.88
91 0.82
92 0.77
93 0.75
94 0.69
95 0.63
96 0.59
97 0.51
98 0.42
99 0.37
100 0.32
101 0.24
102 0.2
103 0.18
104 0.13
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.11
120 0.12
121 0.13
122 0.13
123 0.15
124 0.17
125 0.18
126 0.23
127 0.27
128 0.28
129 0.3
130 0.38
131 0.45
132 0.52
133 0.6
134 0.64
135 0.69
136 0.77
137 0.75
138 0.69
139 0.61
140 0.56
141 0.51
142 0.47
143 0.43
144 0.35
145 0.36
146 0.36
147 0.34
148 0.3
149 0.25
150 0.21
151 0.15
152 0.13
153 0.1
154 0.09
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.07
168 0.09
169 0.08
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.09
177 0.09
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.14
189 0.15
190 0.19
191 0.24
192 0.32
193 0.36
194 0.42
195 0.47
196 0.49
197 0.49
198 0.44
199 0.41
200 0.35
201 0.32
202 0.26
203 0.2
204 0.16
205 0.15
206 0.15
207 0.12
208 0.1
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.16
228 0.24
229 0.26
230 0.34
231 0.41
232 0.47
233 0.49
234 0.53
235 0.54
236 0.53
237 0.54
238 0.49
239 0.46
240 0.4
241 0.38
242 0.35
243 0.29
244 0.23
245 0.18
246 0.17
247 0.14
248 0.16
249 0.2
250 0.21
251 0.24
252 0.22
253 0.22
254 0.2
255 0.18
256 0.15
257 0.1
258 0.07
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.1
269 0.1
270 0.11
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.07
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.1
287 0.1
288 0.14
289 0.16
290 0.18
291 0.19
292 0.2
293 0.21
294 0.19
295 0.19
296 0.16
297 0.17
298 0.16
299 0.16
300 0.15
301 0.14
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.06
306 0.05
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.05
311 0.06
312 0.07
313 0.09
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.16
318 0.18
319 0.18
320 0.2
321 0.2
322 0.2
323 0.19
324 0.19
325 0.15
326 0.15
327 0.16
328 0.15
329 0.18
330 0.19
331 0.2
332 0.21
333 0.23
334 0.26
335 0.26
336 0.27
337 0.24
338 0.31
339 0.34
340 0.34
341 0.33
342 0.38
343 0.37
344 0.42
345 0.43
346 0.41
347 0.4
348 0.48
349 0.49
350 0.42
351 0.43
352 0.4
353 0.41
354 0.37
355 0.35
356 0.28
357 0.27
358 0.23
359 0.22
360 0.17
361 0.12
362 0.11
363 0.1
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.08
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.12
375 0.16
376 0.15
377 0.16
378 0.14
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.1
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.09
394 0.11
395 0.11
396 0.13
397 0.19
398 0.22
399 0.22
400 0.22
401 0.22
402 0.22
403 0.25
404 0.27
405 0.28
406 0.27
407 0.28
408 0.29
409 0.3
410 0.28
411 0.27
412 0.23
413 0.17
414 0.16
415 0.16
416 0.16
417 0.17
418 0.17
419 0.17
420 0.16
421 0.16
422 0.14
423 0.12
424 0.13
425 0.12
426 0.12
427 0.12
428 0.12
429 0.12
430 0.12
431 0.13
432 0.13
433 0.12
434 0.16
435 0.18
436 0.26
437 0.37
438 0.37
439 0.41
440 0.41
441 0.41
442 0.38
443 0.36
444 0.33
445 0.22
446 0.22
447 0.19
448 0.18
449 0.17
450 0.16
451 0.14
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.1
457 0.11
458 0.15
459 0.16
460 0.2
461 0.21
462 0.25
463 0.25
464 0.26
465 0.28
466 0.3
467 0.32
468 0.31
469 0.32
470 0.35
471 0.35
472 0.31
473 0.28
474 0.24
475 0.22
476 0.19
477 0.18
478 0.11
479 0.1
480 0.1
481 0.09
482 0.08
483 0.14
484 0.15
485 0.2
486 0.21
487 0.24
488 0.25
489 0.25
490 0.25
491 0.27
492 0.34
493 0.37
494 0.38
495 0.44
496 0.44
497 0.45