Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8RF18

Protein Details
Accession A0A3D8RF18    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
166-191PGLPQCPRSRYQRERCRGPRGPCRDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-57RRKI
64-81DKSRRHITFSKRKAGIMK
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 8.5, mito 4, cyto 4, plas 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50066  MADS_BOX_2  
CDD cd00120  MADS  
Amino Acid Sequences MADITAVGEENPSPTQDDLQQAAGNGATDNRGTKRNRMSADDDDDDEDKTGRERRKIEIKFIQDKSRRHITFSKRKAGIMKKVRSTSATEPSTLCFLHHPPYGLCLIDPIVNYLAVFCLDRSIRTLRPHGYSSTSSGRVRDRPRLHLHNPQAAATGYETRRKEPHPGLPQCPRSRYQRERCRGPRGPCRDT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.15
3 0.18
4 0.22
5 0.21
6 0.23
7 0.23
8 0.21
9 0.2
10 0.18
11 0.15
12 0.11
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.12
17 0.14
18 0.21
19 0.23
20 0.31
21 0.39
22 0.45
23 0.48
24 0.5
25 0.54
26 0.54
27 0.58
28 0.52
29 0.45
30 0.4
31 0.37
32 0.32
33 0.26
34 0.19
35 0.12
36 0.14
37 0.19
38 0.21
39 0.27
40 0.29
41 0.35
42 0.45
43 0.48
44 0.53
45 0.55
46 0.58
47 0.61
48 0.62
49 0.65
50 0.61
51 0.61
52 0.59
53 0.61
54 0.54
55 0.49
56 0.54
57 0.54
58 0.58
59 0.62
60 0.65
61 0.56
62 0.58
63 0.61
64 0.59
65 0.59
66 0.58
67 0.57
68 0.54
69 0.55
70 0.54
71 0.48
72 0.46
73 0.41
74 0.4
75 0.35
76 0.29
77 0.28
78 0.27
79 0.27
80 0.22
81 0.17
82 0.1
83 0.11
84 0.13
85 0.14
86 0.15
87 0.13
88 0.15
89 0.15
90 0.14
91 0.12
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.04
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.11
109 0.15
110 0.19
111 0.22
112 0.27
113 0.28
114 0.32
115 0.33
116 0.32
117 0.33
118 0.3
119 0.31
120 0.32
121 0.33
122 0.3
123 0.32
124 0.34
125 0.38
126 0.42
127 0.47
128 0.47
129 0.5
130 0.58
131 0.63
132 0.64
133 0.66
134 0.68
135 0.65
136 0.61
137 0.54
138 0.47
139 0.39
140 0.34
141 0.26
142 0.26
143 0.21
144 0.27
145 0.28
146 0.3
147 0.35
148 0.36
149 0.43
150 0.44
151 0.52
152 0.55
153 0.61
154 0.65
155 0.71
156 0.78
157 0.76
158 0.73
159 0.68
160 0.67
161 0.7
162 0.73
163 0.74
164 0.75
165 0.78
166 0.84
167 0.88
168 0.89
169 0.88
170 0.86
171 0.86