Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8S4F8

Protein Details
Accession A0A3D8S4F8    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-22YALETKKRKFHRVLESLTKPHydrophilic
440-464EWWAKIRRMRQVLNIKSPRRKPSTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
446-447RR
455-460KSPRRK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013909  NIPA/Rsm1_C  
IPR012935  Znf_C3HC-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08600  Rsm1  
PF07967  zf-C3HC  
Amino Acid Sequences MSYALETKKRKFHRVLESLTKPSNPESSKQPASSATAQHGPSAKRARLSGRDDSILGSVRKDILKIARPVSRASSVSSQSRPSFVPWDRDRFLERLETFRRVDRWSPKPSAVNEVEWAKRGWICTDVARVTCVGGCGGSVVVKIPDELDELDGYDGDKIQERKDVRAKLVQEYTGRIVQAHGENCPWRNKGCDGLSQSPIWGNGCFDLQSSATIHRLPLTNPDTAISHLQSRYSHLLKMANQLPEPDSLQTPEGFNAKDIISILPAGALQPSDVRQETTETQEFSSDDNQEHISQPSSQSGTLINESAFTLAFLGWDSVGGAQGVAGCSMCFRRLGLWMYKPKSNGDEPVHDPLDVANEHMEYCPWINGRAQSGTGKPSEKPERFHSGWELLAQALKVKHLRQARTNTPMSSRAGSEAPTADEPVIDEQNDDIRRAKDREWWAKIRRMRQVLNIKSPRRKPSTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.8
3 0.81
4 0.8
5 0.77
6 0.72
7 0.64
8 0.55
9 0.5
10 0.5
11 0.42
12 0.39
13 0.4
14 0.45
15 0.49
16 0.48
17 0.47
18 0.41
19 0.45
20 0.46
21 0.42
22 0.38
23 0.37
24 0.37
25 0.38
26 0.41
27 0.36
28 0.4
29 0.45
30 0.43
31 0.4
32 0.44
33 0.48
34 0.51
35 0.56
36 0.56
37 0.52
38 0.51
39 0.48
40 0.46
41 0.4
42 0.37
43 0.31
44 0.23
45 0.2
46 0.21
47 0.22
48 0.21
49 0.22
50 0.25
51 0.32
52 0.36
53 0.4
54 0.42
55 0.43
56 0.45
57 0.45
58 0.43
59 0.36
60 0.35
61 0.36
62 0.35
63 0.39
64 0.4
65 0.41
66 0.37
67 0.39
68 0.35
69 0.32
70 0.37
71 0.35
72 0.42
73 0.42
74 0.48
75 0.47
76 0.49
77 0.5
78 0.43
79 0.41
80 0.4
81 0.35
82 0.36
83 0.39
84 0.41
85 0.39
86 0.42
87 0.43
88 0.39
89 0.46
90 0.47
91 0.5
92 0.53
93 0.56
94 0.56
95 0.59
96 0.56
97 0.57
98 0.5
99 0.44
100 0.4
101 0.4
102 0.36
103 0.32
104 0.3
105 0.23
106 0.22
107 0.21
108 0.18
109 0.16
110 0.16
111 0.17
112 0.22
113 0.22
114 0.21
115 0.21
116 0.2
117 0.18
118 0.17
119 0.14
120 0.09
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.1
145 0.11
146 0.12
147 0.18
148 0.19
149 0.26
150 0.33
151 0.36
152 0.35
153 0.4
154 0.41
155 0.41
156 0.42
157 0.39
158 0.32
159 0.31
160 0.31
161 0.26
162 0.24
163 0.18
164 0.16
165 0.16
166 0.19
167 0.17
168 0.15
169 0.16
170 0.18
171 0.21
172 0.25
173 0.24
174 0.21
175 0.23
176 0.23
177 0.28
178 0.27
179 0.3
180 0.32
181 0.35
182 0.36
183 0.33
184 0.32
185 0.26
186 0.24
187 0.19
188 0.13
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.18
206 0.19
207 0.18
208 0.18
209 0.19
210 0.17
211 0.18
212 0.19
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.14
217 0.13
218 0.16
219 0.19
220 0.19
221 0.19
222 0.18
223 0.21
224 0.21
225 0.27
226 0.28
227 0.25
228 0.24
229 0.24
230 0.23
231 0.21
232 0.21
233 0.15
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.06
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.13
264 0.15
265 0.2
266 0.21
267 0.19
268 0.19
269 0.19
270 0.19
271 0.18
272 0.19
273 0.15
274 0.13
275 0.14
276 0.15
277 0.15
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.13
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.14
286 0.13
287 0.14
288 0.14
289 0.15
290 0.14
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.08
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.04
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.04
315 0.05
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.09
321 0.13
322 0.18
323 0.23
324 0.31
325 0.39
326 0.42
327 0.45
328 0.45
329 0.44
330 0.44
331 0.41
332 0.41
333 0.36
334 0.39
335 0.39
336 0.45
337 0.43
338 0.38
339 0.35
340 0.27
341 0.26
342 0.2
343 0.17
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.09
350 0.1
351 0.12
352 0.12
353 0.13
354 0.15
355 0.18
356 0.22
357 0.22
358 0.23
359 0.23
360 0.25
361 0.27
362 0.28
363 0.28
364 0.26
365 0.33
366 0.42
367 0.42
368 0.45
369 0.48
370 0.53
371 0.52
372 0.55
373 0.51
374 0.43
375 0.4
376 0.36
377 0.31
378 0.22
379 0.22
380 0.18
381 0.17
382 0.14
383 0.18
384 0.21
385 0.21
386 0.28
387 0.34
388 0.39
389 0.44
390 0.52
391 0.56
392 0.61
393 0.64
394 0.6
395 0.57
396 0.56
397 0.51
398 0.44
399 0.37
400 0.31
401 0.28
402 0.27
403 0.25
404 0.22
405 0.22
406 0.21
407 0.21
408 0.18
409 0.16
410 0.17
411 0.18
412 0.19
413 0.15
414 0.14
415 0.14
416 0.22
417 0.23
418 0.24
419 0.24
420 0.25
421 0.31
422 0.35
423 0.36
424 0.38
425 0.47
426 0.56
427 0.6
428 0.67
429 0.68
430 0.74
431 0.79
432 0.79
433 0.79
434 0.77
435 0.73
436 0.73
437 0.76
438 0.76
439 0.79
440 0.8
441 0.8
442 0.81
443 0.85
444 0.85