Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8RBJ2

Protein Details
Accession A0A3D8RBJ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
130-152AERHGRRTKHTPIQRRTHQHGQHBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019145  Mediator_Med10  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF09748  Med10  
Amino Acid Sequences MCDWCRVETEGQREDQIVEKGLDYVSNYDGGLSRSRKKKLAEENDTLRDKPKHASRVLVKPPGGSKDYMRYEKWAGIRSNKLARNRPAQAQDSLEHLSLVQNASKSSVQEDGSNDNWRMNSANEAAASGAERHGRRTKHTPIQRRTHQHGQHPSDEQDCVHRNPAAAVAREGGPFQERILTQAQQSAERQHHSSCSETCSSQERINRAKTSRDGRQELKIARRSQTSRSSYQTAFEHPVSLLISEQPAEVHRELHKKPSSYFCAPNHHDGVPCQGACYGLELQTSKPKPESMESSRIELSPQSSFRPSGPVIANSSEYVDRYQPKTQDSYQHSYVAKDAESIMDRIRKQQTRKLDAGSEETLQRDMAPDRIDEKVVENQIKDVIQDLYQVMVQVTAYDLTSRPSKDVLENSTIQLQHSLQKIHNTANSPTAQATMPSVPPELIQYVDTGRNPDIYTREFVERTRKMNQTMKGKFGAFSDFRDVLATEMARAMPELIEDIGLVVERTHGDKEKIMRNVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.37
3 0.32
4 0.27
5 0.23
6 0.21
7 0.21
8 0.2
9 0.19
10 0.16
11 0.16
12 0.14
13 0.14
14 0.13
15 0.13
16 0.15
17 0.16
18 0.22
19 0.25
20 0.33
21 0.4
22 0.46
23 0.51
24 0.55
25 0.62
26 0.66
27 0.71
28 0.71
29 0.72
30 0.74
31 0.77
32 0.75
33 0.67
34 0.63
35 0.55
36 0.49
37 0.49
38 0.49
39 0.5
40 0.49
41 0.57
42 0.58
43 0.64
44 0.71
45 0.7
46 0.62
47 0.58
48 0.6
49 0.56
50 0.51
51 0.42
52 0.37
53 0.38
54 0.46
55 0.47
56 0.44
57 0.43
58 0.44
59 0.47
60 0.48
61 0.46
62 0.43
63 0.45
64 0.5
65 0.52
66 0.58
67 0.58
68 0.62
69 0.64
70 0.66
71 0.67
72 0.66
73 0.66
74 0.64
75 0.62
76 0.57
77 0.52
78 0.46
79 0.41
80 0.38
81 0.31
82 0.24
83 0.2
84 0.18
85 0.16
86 0.16
87 0.14
88 0.12
89 0.12
90 0.15
91 0.16
92 0.16
93 0.16
94 0.19
95 0.18
96 0.2
97 0.22
98 0.24
99 0.26
100 0.3
101 0.28
102 0.26
103 0.25
104 0.23
105 0.22
106 0.18
107 0.19
108 0.16
109 0.17
110 0.15
111 0.15
112 0.14
113 0.13
114 0.13
115 0.1
116 0.1
117 0.14
118 0.14
119 0.2
120 0.26
121 0.28
122 0.33
123 0.41
124 0.48
125 0.53
126 0.62
127 0.67
128 0.7
129 0.79
130 0.82
131 0.82
132 0.81
133 0.81
134 0.78
135 0.76
136 0.77
137 0.72
138 0.68
139 0.63
140 0.57
141 0.49
142 0.43
143 0.34
144 0.31
145 0.29
146 0.26
147 0.25
148 0.24
149 0.22
150 0.22
151 0.27
152 0.24
153 0.21
154 0.2
155 0.19
156 0.19
157 0.19
158 0.19
159 0.14
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.12
164 0.11
165 0.14
166 0.17
167 0.17
168 0.16
169 0.2
170 0.2
171 0.19
172 0.2
173 0.23
174 0.23
175 0.24
176 0.26
177 0.23
178 0.25
179 0.24
180 0.26
181 0.22
182 0.23
183 0.23
184 0.21
185 0.22
186 0.24
187 0.24
188 0.25
189 0.28
190 0.29
191 0.34
192 0.39
193 0.42
194 0.39
195 0.42
196 0.44
197 0.47
198 0.48
199 0.5
200 0.49
201 0.47
202 0.5
203 0.51
204 0.49
205 0.51
206 0.51
207 0.46
208 0.44
209 0.47
210 0.45
211 0.45
212 0.5
213 0.47
214 0.44
215 0.45
216 0.46
217 0.41
218 0.41
219 0.36
220 0.3
221 0.28
222 0.24
223 0.21
224 0.16
225 0.17
226 0.14
227 0.13
228 0.1
229 0.06
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.06
235 0.09
236 0.09
237 0.11
238 0.15
239 0.21
240 0.22
241 0.31
242 0.33
243 0.32
244 0.34
245 0.38
246 0.41
247 0.39
248 0.44
249 0.39
250 0.45
251 0.46
252 0.48
253 0.44
254 0.38
255 0.34
256 0.28
257 0.29
258 0.23
259 0.2
260 0.16
261 0.13
262 0.13
263 0.12
264 0.14
265 0.1
266 0.08
267 0.1
268 0.1
269 0.11
270 0.19
271 0.19
272 0.18
273 0.18
274 0.19
275 0.2
276 0.22
277 0.29
278 0.27
279 0.35
280 0.34
281 0.36
282 0.36
283 0.34
284 0.31
285 0.25
286 0.21
287 0.15
288 0.16
289 0.15
290 0.16
291 0.17
292 0.17
293 0.21
294 0.19
295 0.21
296 0.21
297 0.2
298 0.21
299 0.22
300 0.22
301 0.18
302 0.19
303 0.14
304 0.14
305 0.13
306 0.15
307 0.17
308 0.2
309 0.24
310 0.25
311 0.27
312 0.31
313 0.32
314 0.38
315 0.41
316 0.43
317 0.41
318 0.44
319 0.42
320 0.38
321 0.37
322 0.3
323 0.23
324 0.17
325 0.15
326 0.11
327 0.12
328 0.12
329 0.14
330 0.18
331 0.18
332 0.24
333 0.33
334 0.37
335 0.4
336 0.46
337 0.53
338 0.55
339 0.58
340 0.55
341 0.49
342 0.45
343 0.46
344 0.41
345 0.32
346 0.26
347 0.24
348 0.21
349 0.17
350 0.15
351 0.12
352 0.11
353 0.13
354 0.13
355 0.13
356 0.15
357 0.16
358 0.17
359 0.15
360 0.17
361 0.2
362 0.24
363 0.26
364 0.24
365 0.23
366 0.25
367 0.24
368 0.21
369 0.17
370 0.13
371 0.11
372 0.12
373 0.12
374 0.1
375 0.1
376 0.11
377 0.09
378 0.08
379 0.07
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.09
387 0.14
388 0.15
389 0.15
390 0.17
391 0.18
392 0.22
393 0.27
394 0.3
395 0.3
396 0.31
397 0.31
398 0.34
399 0.33
400 0.28
401 0.26
402 0.22
403 0.22
404 0.24
405 0.26
406 0.23
407 0.3
408 0.32
409 0.34
410 0.37
411 0.35
412 0.34
413 0.37
414 0.35
415 0.3
416 0.28
417 0.25
418 0.21
419 0.18
420 0.19
421 0.16
422 0.17
423 0.17
424 0.17
425 0.15
426 0.16
427 0.17
428 0.15
429 0.13
430 0.12
431 0.12
432 0.14
433 0.19
434 0.19
435 0.2
436 0.2
437 0.22
438 0.22
439 0.24
440 0.25
441 0.24
442 0.27
443 0.27
444 0.32
445 0.3
446 0.33
447 0.4
448 0.41
449 0.43
450 0.48
451 0.5
452 0.52
453 0.58
454 0.63
455 0.63
456 0.63
457 0.64
458 0.6
459 0.56
460 0.5
461 0.44
462 0.44
463 0.35
464 0.34
465 0.36
466 0.31
467 0.3
468 0.31
469 0.29
470 0.22
471 0.24
472 0.2
473 0.13
474 0.14
475 0.14
476 0.13
477 0.13
478 0.13
479 0.08
480 0.09
481 0.09
482 0.08
483 0.08
484 0.08
485 0.08
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.05
490 0.07
491 0.08
492 0.11
493 0.15
494 0.19
495 0.21
496 0.27
497 0.34
498 0.41