Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8SDC0

Protein Details
Accession A0A3D8SDC0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MLRQIKPRNARSKRALDKKAPKAIENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-22KPRNARSKRALDKKAPK
320-324KKSRR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 10, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MLRQIKPRNARSKRALDKKAPKAIENPKTALFLRGTSCSQITQNALTDLYQLRIPLAKKFTKKNEIHPFEDPSSLEFFSEKNDAGLLVFGSSNKKRPHAITLARCFGHKILDMLELNLDADTFRTLAQFKNKKCAVGLKPMLVFSGTPFESPVSDEYTLAKSFFIDFFKGEPADKVDVEGLQYIVSISAQDIVDGAESKPQIHLRVYLIKTKKSGQKLPRVEVEEMGPRMDFRVGRVREADESVLKEAMRRARTSAERPKKNISTDIVGDKIGRIHLGKQDLSELQTRKMKGLKRSRDVVDDDFDDEMEDEVVSEEEGKKKSRRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.86
3 0.85
4 0.88
5 0.88
6 0.88
7 0.8
8 0.73
9 0.71
10 0.73
11 0.71
12 0.66
13 0.6
14 0.52
15 0.53
16 0.51
17 0.45
18 0.36
19 0.3
20 0.27
21 0.28
22 0.27
23 0.26
24 0.27
25 0.25
26 0.25
27 0.25
28 0.24
29 0.23
30 0.23
31 0.22
32 0.21
33 0.19
34 0.2
35 0.18
36 0.17
37 0.15
38 0.13
39 0.13
40 0.17
41 0.18
42 0.21
43 0.27
44 0.33
45 0.39
46 0.48
47 0.56
48 0.63
49 0.66
50 0.7
51 0.74
52 0.73
53 0.71
54 0.67
55 0.63
56 0.55
57 0.53
58 0.43
59 0.33
60 0.3
61 0.25
62 0.21
63 0.15
64 0.13
65 0.14
66 0.16
67 0.14
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.13
78 0.15
79 0.22
80 0.24
81 0.27
82 0.3
83 0.32
84 0.38
85 0.41
86 0.48
87 0.5
88 0.54
89 0.57
90 0.54
91 0.51
92 0.46
93 0.37
94 0.31
95 0.23
96 0.17
97 0.13
98 0.18
99 0.18
100 0.16
101 0.16
102 0.13
103 0.12
104 0.11
105 0.09
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.07
113 0.1
114 0.2
115 0.27
116 0.28
117 0.37
118 0.38
119 0.37
120 0.37
121 0.43
122 0.37
123 0.4
124 0.41
125 0.35
126 0.35
127 0.34
128 0.33
129 0.24
130 0.21
131 0.11
132 0.13
133 0.1
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.12
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.1
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.07
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.11
187 0.12
188 0.14
189 0.14
190 0.17
191 0.17
192 0.25
193 0.27
194 0.32
195 0.34
196 0.35
197 0.36
198 0.4
199 0.44
200 0.43
201 0.5
202 0.5
203 0.57
204 0.61
205 0.63
206 0.63
207 0.61
208 0.55
209 0.47
210 0.42
211 0.37
212 0.31
213 0.27
214 0.2
215 0.16
216 0.16
217 0.17
218 0.15
219 0.12
220 0.22
221 0.22
222 0.25
223 0.27
224 0.28
225 0.27
226 0.29
227 0.28
228 0.21
229 0.22
230 0.21
231 0.2
232 0.18
233 0.18
234 0.2
235 0.25
236 0.26
237 0.25
238 0.26
239 0.32
240 0.38
241 0.46
242 0.53
243 0.56
244 0.61
245 0.65
246 0.72
247 0.7
248 0.68
249 0.64
250 0.57
251 0.52
252 0.48
253 0.47
254 0.39
255 0.34
256 0.3
257 0.25
258 0.22
259 0.17
260 0.16
261 0.13
262 0.16
263 0.21
264 0.26
265 0.26
266 0.25
267 0.28
268 0.28
269 0.29
270 0.33
271 0.29
272 0.31
273 0.36
274 0.36
275 0.36
276 0.41
277 0.45
278 0.48
279 0.57
280 0.61
281 0.63
282 0.69
283 0.69
284 0.69
285 0.68
286 0.61
287 0.56
288 0.47
289 0.41
290 0.34
291 0.3
292 0.24
293 0.19
294 0.15
295 0.11
296 0.09
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.09
302 0.11
303 0.17
304 0.2
305 0.26