Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8RGC7

Protein Details
Accession A0A3D8RGC7    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-124PAKTDAPEEKKERKKRQHDPNAPKRPLTBasic
245-268EPEPTPKTPKAKGRKGKATKEVEPBasic
280-306LPPSAAKPTPDKKRKRTSTAKAAPVESHydrophilic
311-333EAPVETPKEKTKKSRSKKAKNDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-119EKKERKKRQHDPNAP
251-264KTPKAKGRKGKATK
286-301KPTPDKKRKRTSTAKA
316-331TPKEKTKKSRSKKAKN
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.166, cyto 11, nucl 10, cyto_mito 8.166, mito_nucl 7.666, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSSTTKKTKKTGEGSTQGATLSIDVDSFVRTRDSVVTGLATLQDAIQTLSTAYIKHTNAVLGEHGAGLDPGVEHALSKLSDNPLLGGIAGLNRAASPAKTDAPEEKKERKKRQHDPNAPKRPLTPFFLYMQTARPIIATDLGADVAKGAVSAEGTRRWKEMAEADKQLWSNAYKDNLRLYNARSHSYKAGNLEAKDMSNEEALVYADDHNIDASTADASAQLLAETPVVVEDEDAEGEVEVPVPEPEPTPKTPKAKGRKGKATKEVEPESAKAVTESAVLPPSAAKPTPDKKRKRTSTAKAAPVESIEKEEAPVETPKEKTKKSRSKKAKNDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.66
3 0.57
4 0.47
5 0.39
6 0.29
7 0.19
8 0.13
9 0.09
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.09
15 0.09
16 0.1
17 0.1
18 0.12
19 0.14
20 0.17
21 0.16
22 0.17
23 0.16
24 0.15
25 0.15
26 0.14
27 0.11
28 0.09
29 0.08
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.06
36 0.08
37 0.09
38 0.09
39 0.11
40 0.18
41 0.18
42 0.19
43 0.2
44 0.19
45 0.19
46 0.2
47 0.18
48 0.12
49 0.12
50 0.11
51 0.1
52 0.09
53 0.08
54 0.06
55 0.05
56 0.04
57 0.04
58 0.05
59 0.05
60 0.04
61 0.05
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.12
66 0.13
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.14
71 0.14
72 0.12
73 0.09
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.09
84 0.11
85 0.13
86 0.14
87 0.16
88 0.23
89 0.29
90 0.36
91 0.4
92 0.47
93 0.55
94 0.64
95 0.73
96 0.76
97 0.81
98 0.84
99 0.89
100 0.9
101 0.91
102 0.92
103 0.92
104 0.93
105 0.84
106 0.75
107 0.67
108 0.62
109 0.55
110 0.49
111 0.42
112 0.34
113 0.33
114 0.35
115 0.33
116 0.27
117 0.26
118 0.22
119 0.18
120 0.15
121 0.13
122 0.11
123 0.1
124 0.11
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.04
139 0.05
140 0.11
141 0.13
142 0.14
143 0.15
144 0.15
145 0.15
146 0.16
147 0.21
148 0.21
149 0.23
150 0.24
151 0.24
152 0.26
153 0.26
154 0.24
155 0.19
156 0.15
157 0.13
158 0.13
159 0.16
160 0.14
161 0.16
162 0.2
163 0.2
164 0.21
165 0.22
166 0.22
167 0.26
168 0.27
169 0.28
170 0.26
171 0.26
172 0.28
173 0.29
174 0.28
175 0.23
176 0.27
177 0.27
178 0.26
179 0.26
180 0.23
181 0.21
182 0.19
183 0.18
184 0.13
185 0.1
186 0.09
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.11
234 0.15
235 0.19
236 0.26
237 0.33
238 0.39
239 0.45
240 0.54
241 0.61
242 0.67
243 0.73
244 0.76
245 0.8
246 0.83
247 0.86
248 0.86
249 0.83
250 0.79
251 0.78
252 0.72
253 0.66
254 0.59
255 0.51
256 0.44
257 0.37
258 0.3
259 0.22
260 0.18
261 0.13
262 0.12
263 0.11
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.13
270 0.16
271 0.16
272 0.16
273 0.24
274 0.33
275 0.45
276 0.54
277 0.62
278 0.68
279 0.79
280 0.86
281 0.87
282 0.89
283 0.88
284 0.9
285 0.89
286 0.87
287 0.81
288 0.72
289 0.63
290 0.56
291 0.49
292 0.39
293 0.34
294 0.27
295 0.22
296 0.22
297 0.21
298 0.19
299 0.18
300 0.21
301 0.21
302 0.23
303 0.27
304 0.35
305 0.43
306 0.49
307 0.56
308 0.64
309 0.71
310 0.77
311 0.85
312 0.87
313 0.9