Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8RHJ4

Protein Details
Accession A0A3D8RHJ4    Localization Confidence High Confidence Score 25.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-41DGPIHTSKRARKETNASAKRSHydrophilic
745-764RPAPIKSKPLKGGRDKAGRPBasic
784-808DGLARRQQIIQKKRMMRRNRKNGGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-146RDAKPGTDGKKKSAIAEEAAKVKKER
593-604KHRKAKGKGIVK
677-808RRKEREEKARIRSKEVLEAREKGEAPEKEKKVLGKDTLMAKTRKGMKPGTKGPERRGGPERRAPGGKGRPAPIKSKPLKGGRDKAGRPTHAPKGQRESKEDADSGEKDGLARRQQIIQKKRMMRRNRKNGGA
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034809  Nop4_RRM4  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12676  RRM3_Nop4p  
cd12677  RRM4_Nop4p  
Amino Acid Sequences MSKRQRVQEDDGPAAIVGDEDGPIHTSKRARKETNASAKRSLFVRSLPATATSEALTELFSQSYPLKHATVVLDPVTKQSKGYGFVTFADADDAERAQEEFHGKKFQGRTMKVEIAQPRSRDAKPGTDGKKKSAIAEEAAKVKKERSEKMAEQRQPLKLIIRNLPWSVNTTEKLAELFSKFGKVKHSTLPKVKDTQKGFGFVVMRGRKNAEKALAAVNGTLVDGRVIAVDWAVEKDVWEGQKKAANDQPEADESDEDGGAKVDKVDEKRADTSDYDEDEDLANFFKDRADVLESEDENEEAMKIDTEDEDEDEEDEDEEDDENENEDSENSDDDLEDDEDESEEEEKPVKNFITDNSSTLFVRNLPFTTLDADLKEHFNQFGPVRYARVVMDRATDRPKGTGFVCFFNVEDADNCFRGAPRYQPTGANAIAPQLKHSILQKEEADTSGMYTIEGRLLQISKAVEREQATKLTEVGLNQRTERDTDKRKLYLLSEGTIAKGTPLYEALAPSEVKMREDSAMQRKKLIQNNPTLHLSLTRLSIRNLPRNINSKDLKALAREAVVGFAKDVKNGVRAQLSKEEEARGGDEMRDAEKHRKAKGKGIVKQAKIVFEGREGSKVPEATGAGRSRGYGFLEYSSHRWALMGLRWLNGHSIESGSGKKQRLIVEFAIENVQVVSRRKEREEKARIRSKEVLEAREKGEAPEKEKKVLGKDTLMAKTRKGMKPGTKGPERRGGPERRAPGGKGRPAPIKSKPLKGGRDKAGRPTHAPKGQRESKEDADSGEKDGLARRQQIIQKKRMMRRNRKNGGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.24
3 0.16
4 0.09
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.07
9 0.08
10 0.09
11 0.11
12 0.15
13 0.22
14 0.3
15 0.4
16 0.49
17 0.54
18 0.62
19 0.7
20 0.76
21 0.81
22 0.81
23 0.76
24 0.74
25 0.7
26 0.64
27 0.56
28 0.5
29 0.41
30 0.35
31 0.37
32 0.32
33 0.32
34 0.3
35 0.32
36 0.3
37 0.28
38 0.27
39 0.19
40 0.17
41 0.16
42 0.15
43 0.12
44 0.1
45 0.11
46 0.1
47 0.1
48 0.12
49 0.14
50 0.15
51 0.18
52 0.19
53 0.19
54 0.19
55 0.22
56 0.23
57 0.24
58 0.25
59 0.25
60 0.25
61 0.24
62 0.3
63 0.31
64 0.28
65 0.25
66 0.27
67 0.28
68 0.29
69 0.31
70 0.29
71 0.26
72 0.27
73 0.3
74 0.25
75 0.21
76 0.19
77 0.17
78 0.14
79 0.13
80 0.12
81 0.09
82 0.1
83 0.09
84 0.08
85 0.11
86 0.16
87 0.17
88 0.21
89 0.27
90 0.27
91 0.34
92 0.37
93 0.41
94 0.46
95 0.47
96 0.5
97 0.51
98 0.56
99 0.51
100 0.54
101 0.54
102 0.53
103 0.54
104 0.49
105 0.46
106 0.47
107 0.45
108 0.46
109 0.43
110 0.42
111 0.42
112 0.51
113 0.54
114 0.58
115 0.6
116 0.57
117 0.62
118 0.55
119 0.53
120 0.5
121 0.45
122 0.39
123 0.42
124 0.41
125 0.4
126 0.41
127 0.4
128 0.34
129 0.34
130 0.36
131 0.37
132 0.39
133 0.38
134 0.45
135 0.51
136 0.61
137 0.68
138 0.68
139 0.69
140 0.7
141 0.67
142 0.6
143 0.55
144 0.5
145 0.45
146 0.46
147 0.44
148 0.42
149 0.43
150 0.42
151 0.42
152 0.36
153 0.35
154 0.32
155 0.3
156 0.26
157 0.24
158 0.23
159 0.21
160 0.21
161 0.18
162 0.18
163 0.15
164 0.16
165 0.14
166 0.2
167 0.2
168 0.22
169 0.28
170 0.3
171 0.32
172 0.39
173 0.47
174 0.49
175 0.57
176 0.62
177 0.6
178 0.64
179 0.67
180 0.67
181 0.61
182 0.61
183 0.54
184 0.52
185 0.47
186 0.42
187 0.37
188 0.3
189 0.35
190 0.33
191 0.32
192 0.3
193 0.34
194 0.33
195 0.35
196 0.37
197 0.31
198 0.26
199 0.27
200 0.29
201 0.26
202 0.24
203 0.2
204 0.16
205 0.13
206 0.12
207 0.1
208 0.06
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.06
220 0.05
221 0.06
222 0.07
223 0.1
224 0.13
225 0.15
226 0.16
227 0.18
228 0.22
229 0.22
230 0.26
231 0.26
232 0.27
233 0.26
234 0.27
235 0.27
236 0.24
237 0.26
238 0.22
239 0.18
240 0.15
241 0.15
242 0.13
243 0.1
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.11
251 0.13
252 0.2
253 0.22
254 0.25
255 0.28
256 0.29
257 0.3
258 0.26
259 0.28
260 0.25
261 0.24
262 0.23
263 0.2
264 0.19
265 0.17
266 0.16
267 0.12
268 0.09
269 0.08
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.08
276 0.1
277 0.1
278 0.13
279 0.18
280 0.18
281 0.19
282 0.19
283 0.17
284 0.14
285 0.13
286 0.1
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.11
336 0.1
337 0.1
338 0.11
339 0.12
340 0.18
341 0.17
342 0.18
343 0.18
344 0.19
345 0.18
346 0.18
347 0.17
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.11
354 0.11
355 0.13
356 0.13
357 0.12
358 0.11
359 0.12
360 0.12
361 0.13
362 0.14
363 0.12
364 0.11
365 0.11
366 0.13
367 0.13
368 0.15
369 0.16
370 0.16
371 0.17
372 0.17
373 0.17
374 0.15
375 0.17
376 0.15
377 0.12
378 0.15
379 0.15
380 0.17
381 0.2
382 0.22
383 0.19
384 0.19
385 0.19
386 0.18
387 0.17
388 0.2
389 0.18
390 0.18
391 0.19
392 0.18
393 0.17
394 0.16
395 0.15
396 0.1
397 0.09
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.09
403 0.09
404 0.11
405 0.12
406 0.15
407 0.17
408 0.21
409 0.22
410 0.23
411 0.25
412 0.26
413 0.25
414 0.21
415 0.16
416 0.15
417 0.16
418 0.14
419 0.14
420 0.12
421 0.12
422 0.12
423 0.15
424 0.17
425 0.16
426 0.2
427 0.2
428 0.2
429 0.2
430 0.19
431 0.17
432 0.12
433 0.12
434 0.09
435 0.08
436 0.07
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.11
449 0.12
450 0.14
451 0.15
452 0.18
453 0.18
454 0.2
455 0.21
456 0.19
457 0.19
458 0.17
459 0.16
460 0.14
461 0.18
462 0.2
463 0.19
464 0.19
465 0.21
466 0.2
467 0.21
468 0.25
469 0.26
470 0.3
471 0.36
472 0.41
473 0.41
474 0.42
475 0.42
476 0.39
477 0.38
478 0.32
479 0.26
480 0.23
481 0.21
482 0.2
483 0.18
484 0.17
485 0.1
486 0.09
487 0.08
488 0.06
489 0.06
490 0.07
491 0.07
492 0.08
493 0.08
494 0.1
495 0.09
496 0.09
497 0.14
498 0.13
499 0.14
500 0.14
501 0.15
502 0.13
503 0.16
504 0.22
505 0.27
506 0.34
507 0.34
508 0.37
509 0.4
510 0.47
511 0.52
512 0.54
513 0.5
514 0.52
515 0.56
516 0.56
517 0.53
518 0.46
519 0.39
520 0.32
521 0.28
522 0.2
523 0.19
524 0.18
525 0.18
526 0.19
527 0.25
528 0.3
529 0.36
530 0.38
531 0.39
532 0.42
533 0.49
534 0.5
535 0.51
536 0.47
537 0.41
538 0.41
539 0.4
540 0.36
541 0.29
542 0.29
543 0.22
544 0.2
545 0.19
546 0.16
547 0.15
548 0.14
549 0.12
550 0.1
551 0.14
552 0.13
553 0.13
554 0.14
555 0.13
556 0.16
557 0.17
558 0.19
559 0.21
560 0.22
561 0.25
562 0.32
563 0.34
564 0.32
565 0.33
566 0.32
567 0.27
568 0.27
569 0.24
570 0.18
571 0.15
572 0.13
573 0.13
574 0.12
575 0.13
576 0.15
577 0.17
578 0.23
579 0.3
580 0.35
581 0.39
582 0.47
583 0.48
584 0.54
585 0.6
586 0.62
587 0.62
588 0.69
589 0.71
590 0.63
591 0.68
592 0.61
593 0.54
594 0.47
595 0.42
596 0.32
597 0.26
598 0.28
599 0.22
600 0.23
601 0.22
602 0.22
603 0.23
604 0.23
605 0.21
606 0.19
607 0.19
608 0.18
609 0.23
610 0.22
611 0.2
612 0.2
613 0.2
614 0.19
615 0.2
616 0.21
617 0.16
618 0.16
619 0.16
620 0.18
621 0.2
622 0.21
623 0.23
624 0.21
625 0.19
626 0.18
627 0.17
628 0.18
629 0.2
630 0.25
631 0.23
632 0.24
633 0.25
634 0.25
635 0.25
636 0.22
637 0.19
638 0.12
639 0.12
640 0.12
641 0.14
642 0.15
643 0.19
644 0.25
645 0.26
646 0.27
647 0.31
648 0.35
649 0.37
650 0.4
651 0.37
652 0.35
653 0.34
654 0.32
655 0.29
656 0.24
657 0.2
658 0.14
659 0.14
660 0.13
661 0.16
662 0.21
663 0.26
664 0.31
665 0.37
666 0.46
667 0.52
668 0.59
669 0.68
670 0.71
671 0.74
672 0.8
673 0.77
674 0.75
675 0.74
676 0.66
677 0.65
678 0.61
679 0.58
680 0.54
681 0.55
682 0.49
683 0.47
684 0.45
685 0.37
686 0.4
687 0.37
688 0.38
689 0.45
690 0.46
691 0.44
692 0.46
693 0.48
694 0.47
695 0.5
696 0.47
697 0.41
698 0.43
699 0.47
700 0.51
701 0.53
702 0.47
703 0.41
704 0.45
705 0.51
706 0.51
707 0.49
708 0.51
709 0.54
710 0.62
711 0.71
712 0.72
713 0.72
714 0.74
715 0.75
716 0.76
717 0.7
718 0.67
719 0.67
720 0.66
721 0.65
722 0.67
723 0.66
724 0.63
725 0.65
726 0.6
727 0.61
728 0.62
729 0.62
730 0.59
731 0.6
732 0.62
733 0.62
734 0.66
735 0.64
736 0.65
737 0.63
738 0.66
739 0.69
740 0.69
741 0.75
742 0.78
743 0.79
744 0.78
745 0.82
746 0.76
747 0.77
748 0.78
749 0.73
750 0.7
751 0.68
752 0.68
753 0.66
754 0.68
755 0.66
756 0.68
757 0.72
758 0.71
759 0.7
760 0.67
761 0.66
762 0.66
763 0.59
764 0.52
765 0.49
766 0.43
767 0.41
768 0.35
769 0.28
770 0.23
771 0.28
772 0.32
773 0.32
774 0.36
775 0.35
776 0.41
777 0.48
778 0.57
779 0.62
780 0.64
781 0.67
782 0.72
783 0.79
784 0.8
785 0.85
786 0.86
787 0.88
788 0.9