Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8RTD1

Protein Details
Accession A0A3D8RTD1    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-123QPLTAPLERLRKKQRQRVRRRRDRASRNSTNAIHHydrophilic
558-577QPQANQQKRPYKKSTPIRTEHydrophilic
729-748IYIVDKRHTHHRRVNSRLGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-114RLRKKQRQRVRRRRDRA
702-715RGEPGVPGPRGPRG
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 9.5, cyto_nucl 7.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008160  Collagen  
Pfam View protein in Pfam  
PF01391  Collagen  
Amino Acid Sequences MAQHSSSFRMEHYAVWGTFRRLLQNSPQRIYSQPKICIPKPLCVRFMMPNFNINWRGCPHHLPRIGLASPQHASFHNTASQIAAQNAFKQPLTAPLERLRKKQRQRVRRRRDRASRNSTNAIHAELVAVRALRRELQALGWDQLRTMRSKAESVDSEATVHTVIDWSSDHTDTTRNNNAGTRKSPPQNNLYSRMHAADVPFKPPMEDHGGHLRVIPEGPKEKENTYGGPVDTIKTIKTRTPISALNHERSYDPRIPIKKASATKRNTASIYLPDSISCQMSTSRAVGHPKVAEKTPEIMEMDTVDTGTPKADKKRLRRYVKELELYVQATRTLPGGKLVPSSTITPSGAVSIHTIQALKPYEEQFRAAGFGISSADQRRKRVVRDRNSRPLPPATPPKDDKWSRKPEIVNLDSDNKQDQNPIKYESLTTSMTDGAVDEKGNGTSPRAATKKSLPWLKKQSNIPDISPNSNSQHGVRRSESDISFSPSSTVIDFSGEPSPINDRTPPSRTPPVPPTLDEDKIKKLVIKSFAESVKRNQAIPVSKLARGRTDSAARTKSQPQANQQKRPYKKSTPIRTEQAHVPHDGLFGFTKWELPRPSGSSDLDWVDDFEVDAYKNLDIIRGLHVVTAAACKEEVNERIEYVTGINLRKFLAEVSHIDSTKIAKHAQVQKSATGPEVLGEQGVRGAPGERGPRGLEGAIGPRGEPGVPGPRGPRGEKGERGTDGCDSVIYIVDKRHTHHRRVNSRLGVPASPQGEARFTPRFRPYRRQSLHYKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.31
3 0.34
4 0.32
5 0.37
6 0.37
7 0.39
8 0.35
9 0.39
10 0.45
11 0.52
12 0.57
13 0.54
14 0.56
15 0.51
16 0.54
17 0.58
18 0.57
19 0.55
20 0.53
21 0.58
22 0.63
23 0.62
24 0.67
25 0.62
26 0.62
27 0.63
28 0.64
29 0.58
30 0.53
31 0.55
32 0.53
33 0.57
34 0.57
35 0.48
36 0.47
37 0.46
38 0.5
39 0.52
40 0.44
41 0.42
42 0.36
43 0.41
44 0.39
45 0.46
46 0.46
47 0.5
48 0.54
49 0.52
50 0.52
51 0.52
52 0.5
53 0.45
54 0.4
55 0.35
56 0.32
57 0.3
58 0.29
59 0.23
60 0.27
61 0.25
62 0.26
63 0.25
64 0.24
65 0.24
66 0.24
67 0.26
68 0.23
69 0.23
70 0.23
71 0.2
72 0.23
73 0.27
74 0.27
75 0.24
76 0.23
77 0.21
78 0.27
79 0.33
80 0.3
81 0.31
82 0.38
83 0.48
84 0.52
85 0.6
86 0.62
87 0.66
88 0.74
89 0.8
90 0.82
91 0.83
92 0.9
93 0.92
94 0.93
95 0.94
96 0.94
97 0.94
98 0.95
99 0.94
100 0.94
101 0.93
102 0.91
103 0.87
104 0.85
105 0.75
106 0.69
107 0.59
108 0.5
109 0.4
110 0.3
111 0.24
112 0.17
113 0.16
114 0.12
115 0.11
116 0.09
117 0.1
118 0.12
119 0.13
120 0.14
121 0.15
122 0.15
123 0.16
124 0.21
125 0.21
126 0.23
127 0.23
128 0.21
129 0.19
130 0.23
131 0.23
132 0.21
133 0.2
134 0.22
135 0.22
136 0.24
137 0.26
138 0.28
139 0.28
140 0.31
141 0.33
142 0.28
143 0.27
144 0.25
145 0.23
146 0.17
147 0.15
148 0.09
149 0.07
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.1
154 0.13
155 0.13
156 0.13
157 0.13
158 0.18
159 0.19
160 0.26
161 0.31
162 0.29
163 0.3
164 0.34
165 0.38
166 0.39
167 0.41
168 0.39
169 0.4
170 0.47
171 0.51
172 0.52
173 0.55
174 0.59
175 0.6
176 0.62
177 0.58
178 0.53
179 0.49
180 0.45
181 0.38
182 0.3
183 0.27
184 0.27
185 0.25
186 0.25
187 0.25
188 0.23
189 0.23
190 0.21
191 0.24
192 0.23
193 0.23
194 0.23
195 0.31
196 0.32
197 0.32
198 0.33
199 0.29
200 0.22
201 0.22
202 0.2
203 0.16
204 0.21
205 0.23
206 0.25
207 0.27
208 0.27
209 0.32
210 0.33
211 0.29
212 0.27
213 0.27
214 0.24
215 0.24
216 0.23
217 0.18
218 0.18
219 0.17
220 0.14
221 0.14
222 0.16
223 0.17
224 0.2
225 0.22
226 0.23
227 0.26
228 0.31
229 0.32
230 0.41
231 0.43
232 0.44
233 0.42
234 0.41
235 0.37
236 0.35
237 0.37
238 0.33
239 0.31
240 0.34
241 0.37
242 0.4
243 0.42
244 0.44
245 0.44
246 0.46
247 0.52
248 0.54
249 0.54
250 0.57
251 0.57
252 0.57
253 0.5
254 0.45
255 0.38
256 0.33
257 0.33
258 0.27
259 0.23
260 0.19
261 0.2
262 0.19
263 0.17
264 0.13
265 0.1
266 0.09
267 0.11
268 0.12
269 0.11
270 0.12
271 0.14
272 0.18
273 0.18
274 0.21
275 0.22
276 0.24
277 0.25
278 0.25
279 0.24
280 0.21
281 0.24
282 0.21
283 0.21
284 0.19
285 0.16
286 0.15
287 0.14
288 0.13
289 0.09
290 0.09
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.1
297 0.15
298 0.23
299 0.3
300 0.4
301 0.51
302 0.61
303 0.68
304 0.72
305 0.76
306 0.78
307 0.78
308 0.72
309 0.62
310 0.54
311 0.47
312 0.41
313 0.32
314 0.22
315 0.16
316 0.12
317 0.12
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.11
325 0.11
326 0.12
327 0.12
328 0.14
329 0.13
330 0.14
331 0.13
332 0.12
333 0.12
334 0.11
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.13
344 0.14
345 0.13
346 0.14
347 0.16
348 0.19
349 0.2
350 0.21
351 0.16
352 0.15
353 0.16
354 0.14
355 0.11
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.08
361 0.09
362 0.16
363 0.18
364 0.2
365 0.27
366 0.29
367 0.35
368 0.44
369 0.51
370 0.55
371 0.63
372 0.7
373 0.74
374 0.75
375 0.7
376 0.64
377 0.58
378 0.49
379 0.44
380 0.45
381 0.4
382 0.41
383 0.42
384 0.42
385 0.47
386 0.51
387 0.53
388 0.53
389 0.58
390 0.55
391 0.58
392 0.56
393 0.53
394 0.56
395 0.5
396 0.42
397 0.35
398 0.36
399 0.32
400 0.31
401 0.27
402 0.19
403 0.18
404 0.2
405 0.21
406 0.21
407 0.22
408 0.25
409 0.24
410 0.24
411 0.24
412 0.21
413 0.21
414 0.17
415 0.15
416 0.13
417 0.12
418 0.11
419 0.11
420 0.09
421 0.07
422 0.07
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.1
431 0.11
432 0.17
433 0.18
434 0.19
435 0.21
436 0.26
437 0.31
438 0.35
439 0.42
440 0.39
441 0.46
442 0.56
443 0.58
444 0.59
445 0.59
446 0.6
447 0.6
448 0.6
449 0.52
450 0.5
451 0.47
452 0.44
453 0.4
454 0.34
455 0.28
456 0.28
457 0.28
458 0.22
459 0.28
460 0.28
461 0.3
462 0.29
463 0.3
464 0.31
465 0.35
466 0.33
467 0.28
468 0.26
469 0.27
470 0.26
471 0.23
472 0.21
473 0.16
474 0.17
475 0.13
476 0.13
477 0.08
478 0.09
479 0.09
480 0.1
481 0.12
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.14
486 0.14
487 0.16
488 0.16
489 0.17
490 0.22
491 0.27
492 0.29
493 0.32
494 0.39
495 0.39
496 0.43
497 0.46
498 0.46
499 0.44
500 0.43
501 0.43
502 0.4
503 0.42
504 0.39
505 0.36
506 0.34
507 0.34
508 0.33
509 0.29
510 0.27
511 0.28
512 0.32
513 0.32
514 0.3
515 0.34
516 0.37
517 0.39
518 0.38
519 0.37
520 0.4
521 0.39
522 0.37
523 0.33
524 0.35
525 0.35
526 0.35
527 0.39
528 0.32
529 0.34
530 0.37
531 0.37
532 0.36
533 0.34
534 0.36
535 0.32
536 0.35
537 0.36
538 0.4
539 0.42
540 0.39
541 0.4
542 0.43
543 0.45
544 0.46
545 0.47
546 0.49
547 0.57
548 0.65
549 0.7
550 0.72
551 0.75
552 0.77
553 0.8
554 0.78
555 0.76
556 0.77
557 0.78
558 0.8
559 0.79
560 0.78
561 0.78
562 0.72
563 0.67
564 0.63
565 0.6
566 0.51
567 0.43
568 0.38
569 0.31
570 0.28
571 0.24
572 0.19
573 0.13
574 0.11
575 0.12
576 0.11
577 0.15
578 0.15
579 0.21
580 0.22
581 0.24
582 0.28
583 0.29
584 0.32
585 0.32
586 0.33
587 0.28
588 0.29
589 0.27
590 0.24
591 0.21
592 0.18
593 0.14
594 0.13
595 0.11
596 0.08
597 0.08
598 0.08
599 0.08
600 0.09
601 0.08
602 0.1
603 0.09
604 0.1
605 0.1
606 0.11
607 0.14
608 0.14
609 0.14
610 0.13
611 0.13
612 0.12
613 0.12
614 0.13
615 0.1
616 0.09
617 0.09
618 0.08
619 0.1
620 0.15
621 0.17
622 0.18
623 0.19
624 0.18
625 0.19
626 0.19
627 0.18
628 0.14
629 0.15
630 0.16
631 0.18
632 0.18
633 0.19
634 0.19
635 0.19
636 0.18
637 0.15
638 0.14
639 0.14
640 0.16
641 0.2
642 0.25
643 0.25
644 0.25
645 0.25
646 0.25
647 0.26
648 0.26
649 0.22
650 0.19
651 0.28
652 0.37
653 0.43
654 0.49
655 0.47
656 0.47
657 0.49
658 0.48
659 0.4
660 0.31
661 0.25
662 0.17
663 0.16
664 0.13
665 0.11
666 0.09
667 0.08
668 0.09
669 0.09
670 0.08
671 0.08
672 0.09
673 0.1
674 0.15
675 0.21
676 0.2
677 0.22
678 0.24
679 0.25
680 0.26
681 0.24
682 0.2
683 0.17
684 0.21
685 0.22
686 0.2
687 0.19
688 0.17
689 0.18
690 0.16
691 0.15
692 0.14
693 0.2
694 0.21
695 0.25
696 0.27
697 0.33
698 0.39
699 0.41
700 0.45
701 0.44
702 0.51
703 0.56
704 0.58
705 0.58
706 0.56
707 0.56
708 0.5
709 0.44
710 0.37
711 0.29
712 0.24
713 0.17
714 0.14
715 0.16
716 0.15
717 0.15
718 0.16
719 0.22
720 0.24
721 0.27
722 0.38
723 0.42
724 0.5
725 0.57
726 0.65
727 0.69
728 0.76
729 0.83
730 0.8
731 0.76
732 0.73
733 0.68
734 0.59
735 0.52
736 0.5
737 0.41
738 0.34
739 0.32
740 0.27
741 0.26
742 0.26
743 0.29
744 0.31
745 0.31
746 0.39
747 0.47
748 0.54
749 0.59
750 0.69
751 0.72
752 0.75
753 0.79
754 0.79