FuNGI

A0A3D8SRP8

Protein Details

Accession

A0A3D8SRP8

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
50-69	ATNSQEKKDKKLAKKLLSGG	Hydrophilic
441-468	LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGFIDV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
56-73	KKDKKLAKKLLSGGNKEK
177-182	KKKASA
212-226	KKASPKAKANPLKRK
447-460	KGFTKEKNKKKRGS

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MVSSNPNMQKLGKRKNPAGTEQPSWLFPGAGSAAPTPAAPAVPAPQPTPATNSQEKKDKKLAKKLLSGGNKEKSTKPAPPPQLLQAIETFLVEHDLTKTSRALAAETKNLTPSSEATPGNETLSLSAIYEQWRKADGANAGGKAATEKEDSSSSSSEESSSSSDDSDVEMEDAPPAKKKASAKRSPSPSSSSASSSSSESDADDEKETPAVKKASPKAKANPLKRKAASSSGSSSSSSSDSDSDSSSSSEDEAPKTKKAKTQTASSESSSSESSSDSESSSSSESSSDSSSDDEKAKDAQSDSSDSDSSSDSSDDSDSSTQSLAKKTPLPDSDSDSSSDSDSDEEGDKPVRSDTSATLSDGAKKSTTSSDSDSSSESEAEATKTKTVPRALSPPLPPTPVINKKKTNVPFSRIKADVKVDERLASNAYVPYDYAQKAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGFIDVEGRKGIKFDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.67
2	0.74
3	0.77
4	0.76
5	0.75
6	0.71
7	0.66
8	0.63
9	0.58
10	0.49
11	0.45
12	0.38
13	0.28
14	0.21
15	0.21
16	0.17
17	0.16
18	0.17
19	0.15
20	0.15
21	0.15
22	0.15
23	0.12
24	0.11
25	0.1
26	0.08
27	0.09
28	0.12
29	0.16
30	0.18
31	0.18
32	0.22
33	0.25
34	0.25
35	0.3
36	0.33
37	0.36
38	0.43
39	0.48
40	0.49
41	0.56
42	0.59
43	0.6
44	0.64
45	0.67
46	0.68
47	0.73
48	0.78
49	0.76
50	0.8
51	0.79
52	0.79
53	0.77
54	0.75
55	0.73
56	0.71
57	0.67
58	0.63
59	0.59
60	0.57
61	0.54
62	0.55
63	0.55
64	0.57
65	0.6
66	0.62
67	0.62
68	0.6
69	0.62
70	0.54
71	0.47
72	0.38
73	0.32
74	0.27
75	0.23
76	0.18
77	0.1
78	0.12
79	0.1
80	0.09
81	0.09
82	0.12
83	0.12
84	0.14
85	0.14
86	0.13
87	0.16
88	0.15
89	0.16
90	0.2
91	0.23
92	0.27
93	0.29
94	0.29
95	0.29
96	0.29
97	0.27
98	0.22
99	0.2
100	0.19
101	0.22
102	0.22
103	0.21
104	0.24
105	0.24
106	0.24
107	0.22
108	0.18
109	0.13
110	0.14
111	0.12
112	0.09
113	0.09
114	0.1
115	0.13
116	0.16
117	0.16
118	0.16
119	0.18
120	0.18
121	0.18
122	0.21
123	0.19
124	0.21
125	0.24
126	0.23
127	0.22
128	0.21
129	0.2
130	0.16
131	0.15
132	0.11
133	0.09
134	0.09
135	0.11
136	0.12
137	0.14
138	0.16
139	0.16
140	0.15
141	0.15
142	0.15
143	0.13
144	0.13
145	0.13
146	0.11
147	0.11
148	0.11
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.08
155	0.07
156	0.07
157	0.07
158	0.08
159	0.1
160	0.1
161	0.12
162	0.13
163	0.13
164	0.17
165	0.24
166	0.33
167	0.42
168	0.5
169	0.55
170	0.63
171	0.71
172	0.71
173	0.67
174	0.62
175	0.54
176	0.48
177	0.42
178	0.36
179	0.29
180	0.27
181	0.24
182	0.2
183	0.18
184	0.15
185	0.14
186	0.11
187	0.11
188	0.11
189	0.11
190	0.11
191	0.11
192	0.1
193	0.12
194	0.12
195	0.11
196	0.14
197	0.14
198	0.14
199	0.21
200	0.28
201	0.34
202	0.4
203	0.44
204	0.47
205	0.55
206	0.63
207	0.66
208	0.69
209	0.67
210	0.69
211	0.65
212	0.62
213	0.54
214	0.52
215	0.44
216	0.37
217	0.35
218	0.28
219	0.29
220	0.26
221	0.24
222	0.19
223	0.17
224	0.14
225	0.12
226	0.1
227	0.09
228	0.1
229	0.1
230	0.09
231	0.09
232	0.09
233	0.08
234	0.08
235	0.08
236	0.09
237	0.1
238	0.11
239	0.16
240	0.18
241	0.22
242	0.25
243	0.26
244	0.29
245	0.33
246	0.41
247	0.39
248	0.44
249	0.47
250	0.5
251	0.5
252	0.47
253	0.43
254	0.34
255	0.32
256	0.25
257	0.18
258	0.13
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.1
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.1
268	0.09
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.08
276	0.1
277	0.1
278	0.12
279	0.14
280	0.13
281	0.13
282	0.15
283	0.15
284	0.16
285	0.15
286	0.15
287	0.16
288	0.18
289	0.18
290	0.18
291	0.18
292	0.16
293	0.16
294	0.15
295	0.13
296	0.11
297	0.1
298	0.08
299	0.09
300	0.09
301	0.08
302	0.09
303	0.1
304	0.09
305	0.1
306	0.1
307	0.11
308	0.13
309	0.15
310	0.15
311	0.17
312	0.22
313	0.23
314	0.3
315	0.31
316	0.33
317	0.33
318	0.38
319	0.38
320	0.35
321	0.34
322	0.28
323	0.26
324	0.22
325	0.2
326	0.14
327	0.11
328	0.1
329	0.1
330	0.1
331	0.1
332	0.11
333	0.13
334	0.13
335	0.13
336	0.14
337	0.13
338	0.13
339	0.14
340	0.15
341	0.18
342	0.19
343	0.19
344	0.2
345	0.2
346	0.26
347	0.25
348	0.24
349	0.19
350	0.18
351	0.2
352	0.22
353	0.24
354	0.21
355	0.24
356	0.26
357	0.27
358	0.28
359	0.28
360	0.25
361	0.23
362	0.2
363	0.15
364	0.13
365	0.12
366	0.13
367	0.15
368	0.15
369	0.16
370	0.18
371	0.21
372	0.26
373	0.3
374	0.31
375	0.33
376	0.39
377	0.42
378	0.47
379	0.47
380	0.48
381	0.46
382	0.45
383	0.4
384	0.38
385	0.43
386	0.47
387	0.51
388	0.53
389	0.57
390	0.59
391	0.68
392	0.71
393	0.71
394	0.68
395	0.66
396	0.67
397	0.65
398	0.69
399	0.63
400	0.59
401	0.53
402	0.52
403	0.52
404	0.47
405	0.46
406	0.4
407	0.39
408	0.38
409	0.34
410	0.3
411	0.23
412	0.22
413	0.19
414	0.18
415	0.16
416	0.15
417	0.15
418	0.19
419	0.19
420	0.18
421	0.17
422	0.19
423	0.2
424	0.21
425	0.22
426	0.18
427	0.19
428	0.25
429	0.29
430	0.27
431	0.27
432	0.3
433	0.31
434	0.36
435	0.4
436	0.43
437	0.49
438	0.59
439	0.68
440	0.75
441	0.82
442	0.84
443	0.9
444	0.91
445	0.9
446	0.91
447	0.88
448	0.86
449	0.84
450	0.79
451	0.68
452	0.58
453	0.56
454	0.46
455	0.41
456	0.33
457	0.27
458	0.22

A0A3D8SRP8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer